| 中文摘要 | 第1-8页 |
| 英文摘要 | 第8-10页 |
| 第一部分 构建Web Services平台发布及整合核酸数据 | 第10-41页 |
| 摘要 | 第10页 |
| 1 引言 | 第10-16页 |
| ·生物数据整合的概念和困难 | 第11-12页 |
| ·Web Services | 第12-13页 |
| ·XML数据模型 | 第13-16页 |
| 2 Web Services服务的调用 | 第16-29页 |
| ·构建平台的硬件和操作系统以及软件 | 第16-17页 |
| ·Web Services提供商 | 第17页 |
| ·调用Web Services服务获取XML格式的核酸数据 | 第17-29页 |
| ·获取XML格式核酸数据的技术流程 | 第17-18页 |
| ·了解GetEntry服务对象 | 第18-25页 |
| ·编写Web Services客户端获取核酸数据 | 第25-29页 |
| ·使用JAVA语言实现 | 第25-28页 |
| ·使用Perl语言实现 | 第28-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-36页 |
| 4 讨论 | 第36-39页 |
| 参考文献 | 第39-41页 |
| 第二部分 Linux平台下EST序列分析系统的构建 | 第41-52页 |
| 摘要 | 第41页 |
| 1 引言 | 第41-43页 |
| 2 EST序列分析系统的构建 | 第43-47页 |
| ·硬件配置与Linux操作系统的安装 | 第43-44页 |
| ·数据的获取与预处理 | 第44页 |
| ·EST数据 | 第44页 |
| ·基因组数据 | 第44页 |
| ·相关程序的获取与安装 | 第44-46页 |
| ·EST载体序列的去除及Blast数据库的建立 | 第46页 |
| ·数据处理过程及自动化实现 | 第46-47页 |
| 3 结果 | 第47-49页 |
| 4 讨论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-52页 |
| 文献综述 生物信息数据整合与Web Services、XML技术研究进展 | 第52-76页 |
| 引言 | 第53页 |
| 1 生物信息数据整合 | 第53-59页 |
| ·数据整合(data integration)的概念 | 第53-54页 |
| ·生物数据整合的困难 | 第54-56页 |
| ·生物数据整合的理论研究现状(方法和策略) | 第56-59页 |
| ·数据库联盟(database federation) | 第56-58页 |
| ·数据仓库和数据市场(data warehouses and datamarts) | 第58页 |
| ·专一化数据库(specialized databases) | 第58-59页 |
| ·点方案(points solutions) | 第59页 |
| ·结语 | 第59页 |
| 2 XML概述与研究进展 | 第59-68页 |
| ·XML技术概况 | 第59-65页 |
| ·标记语言 | 第59-63页 |
| ·XML | 第63-65页 |
| ·XML在生命科学应用中的研究进展 | 第65-67页 |
| ·结语 | 第67-68页 |
| 3 Web Services研究进展 | 第68-72页 |
| ·Web Services概述 | 第68-69页 |
| ·Web Services工作原理 | 第69-72页 |
| 参考文献 | 第72-76页 |
| 在读期间发表或被接收的论文 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 声明 | 第78页 |
