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扬子鳄(Alligator sinensis)和中华鳖(Trionyx sinensis)的Sox基因研究

Abstract第1-10页
中文摘要第10-13页
Chapter 1 Literature Review第13-36页
   ·A comparison of expression patterns of sex-determining genes in different system of sex-determining第13-25页
     ·Introduction第13-15页
     ·The pathway of positive regulation第15-20页
       ·SRY gene第15-16页
       ·Sox3 gene第16-17页
       ·Sox9 gene第17-18页
       ·Regulation of sex determining by SRY, Sox3 and Sox9 genes第18-20页
     ·The pathway of negative regulation第20-25页
       ·MIS (Mullerian inhibitory substance)第20-21页
       ·SF1 (Steroidogenic factor 1)第21-22页
       ·WT1 (Wilms's tumour 1)第22-23页
       ·DAX1 (DSS-adrenal hypoplasia critical region of the X-chromosome)第23页
       ·Summary第23-25页
   ·Progress of study on the Sox gene family第25-34页
     ·Introduction第25页
     ·Classification of Sox genes第25-27页
     ·Relationship of SRY and Sox3第27-28页
     ·Expression of Sox genes第28-30页
     ·Function of Sox genes第30-31页
     ·Sox genes in reptiles第31-34页
   ·Background, objectives and organization of the thesis第34-36页
Chapter 2 General Materials第36-39页
   ·Materials used in chapter 3 and chapter 5第36-37页
     ·Animals第36页
     ·Reagents for DNA extraction第36页
     ·Restriction enzymes第36页
     ·Reagents for PCR amplification第36页
     ·PCR machine第36页
     ·DNA preparation kit第36页
     ·Cloning vector第36-37页
     ·Reagents for ligation第37页
     ·Host cells第37页
   ·Materials used in chapter 4第37-39页
     ·Eggs第37页
     ·RNA preparation第37页
     ·Vector第37页
     ·SMART cDNA library Construction kit第37页
     ·Enzymes第37-38页
     ·PCR machine第38页
     ·Reagents for cDNA purification第38页
     ·Reagents for colony hybridization第38页
     ·Sequencing reagent and sequencer第38页
     ·DNA size marker第38-39页
Chapter 3 SRY-related genes of Trionyx sinensis and Alligator sinensis第39-55页
   ·Introduction第39-40页
   ·Materials and methods第40-44页
     ·Animals第40页
     ·DNA Extraction第40页
     ·PCR Amplification第40-41页
     ·Cloning and Sequencing第41页
     ·Construction of the Molecular Phylogenetic Tree第41-44页
   ·Results第44-50页
     ·Isolation SRY-related Genes第44-46页
     ·Sequence Comparison of SRY-related Genes第46-48页
     ·Molecular Phylogenetic Analysis of SRY-related Gene第48-50页
   ·Discussion第50-55页
     ·Reasons of experimental results第50-51页
     ·Molecular phylogenefic analyses of Sox genes第51-52页
     ·Evolution of the Sox-1, -2, -3 homologues第52-55页
Chapter 4 Construction and characterization of a cDNA libraryfrom complex tissues of one-week-old embryos of Trionyx sinensis第55-82页
   ·Introduction第55页
   ·Materials and methods第55-62页
     ·Eggs and embryos第55-56页
     ·Extraction of total RNA第56页
     ·Isolation of mRNA第56页
     ·Vector第56页
     ·First-strand cDNA synthesis第56-57页
     ·cDNA amplification by long-distance (LD) PCR第57-58页
     ·Digestion of proteinase K第58页
     ·Sfi I digestion第58-59页
     ·cDNA size fractionation by CHROMA SPIN-400第59页
     ·Ligation and transformation第59-60页
     ·Titering the unamplified library第60页
     ·Determining the percentage of recombinant clones第60-61页
     ·Screening of a cDNA library第61-62页
       ·Colony hybridization第61页
       ·Specific-primer PCR第61-62页
     ·DNA sequencing第62页
     ·Sequence analysis第62页
   ·Results第62-77页
     ·Isolation of total RNA第62-63页
     ·Construction of a cDNA library第63-66页
     ·Analysis of cDNA inserts第66-75页
     ·Screening of cDNA library第75-77页
   ·Discussion第77-82页
     ·Construction of a cDNA library第77-79页
     ·Application of a stage-specific cDNA library第79-82页
       ·Expression of tissue-specific genes第80页
       ·Expression of stage-specific genes第80-81页
       ·Exon identification第81页
       ·Regulatory mechanism of gene expression第81-82页
Chapter 5 Cloning of CtSox2 in Trionyx sinensis using RPGW-PCR amplification第82-93页
   ·Introduction第82-83页
   ·Materials and Methods第83-86页
     ·Preparation of genomic DNA第83页
     ·Digestion of genomic DNA第83页
     ·Amplification of the specific-primer PCR第83-84页
     ·RPGW-PCR amplification第84-85页
       ·The first amplification of single-stranded (ss) DNA第84页
       ·The second amplification of double strand (ds) DNA第84-85页
     ·Cloning of PCR products第85页
     ·DNA sequencing and analysis第85-86页
   ·Results第86-90页
     ·Digestion of genomic DNA第86页
     ·Amplification of the specific-primer PCR第86-87页
     ·RPGW-PCR amplification第87-88页
     ·Cloning and sequence analysis of CtSox2第88-90页
   ·Discussion第90-93页
     ·RPGW-PCR amplification第90-91页
     ·Comparison of Sox2 gene第91-93页
References第93-103页
Acknowledgements第103页

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