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Geldanamycin产生菌吸水链霉菌17997中安莎类抗生素生物合成基因簇的克隆与研究

中文摘要第1-11页
Abstract第11-16页
前言第16-17页
材料和方法第17-36页
 1.材料部分第17-24页
 2.方法部分第24-36页
第一部分 S.hygroscopicus 17997基因文库的建立第36-45页
 一、文库构建过程第36-42页
  1.载体Cosmid pKC505及其制备第37页
  2.S.hygroscopicus17997染色体DNA的制备及酶切第37-42页
  3.总DNA片段与pKC505的连接、包装及转染第42页
 二、基因文库质量分析第42-45页
  1.基因文库中粘粒重组率和基因组覆盖率第42-43页
  2.文库的重叠性和稳定性第43-45页
第二部分 基因文库的杂交筛选及序列分析第45-104页
 一、Geldanamycin生物合成的推测和相关基因的克隆策略第45-47页
 二、基因文库筛选第47-104页
  (一) AHBA生物合成相关基因的筛选第47-59页
   1.基因文库的初步筛选第47页
   2.文库的进一步筛选第47-50页
   3.外源片段的克隆及序列分析第50-52页
   4.AHBA合酶基因的筛选第52-59页
  (二) S.hygroscopicus17997中PKS基因的克隆与分析第59-63页
   1.PKS基因的克隆第59-61页
   2.含PKS基因cosmids的筛选第61-63页
   小结:第63页
  (三) S.hygroscopicus17997中安莎类抗生素生物合成基因簇的克隆及序列分析第63-104页
   1.克隆AHBA合酶基因第63-67页
   3.基因文库筛选第67-71页
   3.克隆基因的序列分析第71-104页
第三部分 S.hygroscopicus17997遗传转移系统的建立和克隆基因功能的鉴定第104-132页
 一、S.hygroscopicus17997对抗生素的敏感性研究第104-106页
  (一) 固体平板法第104-106页
   1.不同培养基上S.hygroscopicus17997生长情况第104-105页
   2.S.hygroscopicus17997抗性研究第105-106页
  (二) 液体培养法第106页
 二 噬菌体φC31衍生的KC515介导的遗传转移系统的建立第106-114页
  (一) 噬菌体KC515对S.lividans1326及S.hygroscopicus17997侵染实验第107-108页
  (二) KC515噬菌体的繁殖及DNA的提取第108-111页
   1.KC515的培养第108-110页
   2.制备高效价噬菌体原液及DNA快速鉴定第110页
   3.噬菌体DNA的提取第110-111页
  (三) 重组噬菌体的构建第111-114页
   1.载体KC515的制备:第111页
   2.外源克隆基因的制备、连接:第111-112页
   3.PEG介导的噬菌体转染S.lividans1326原生质体及重组噬菌体的筛选第112-114页
 三、重组噬菌体对S.hygroscopicus17997的转染及Geldanamycin生物合成阻断株的筛选第114-116页
 四.生物合成阻断株发酵产物的HPLC鉴定及Southern证明第116-132页
  (一) Southern杂交证明第116-118页
  (二) 筛选菌株发酵产物的HPLC检测第118-129页
   1.Geldanamycin标准品的HPLC观察第119-122页
   2.各菌株发酵提取物HPLC检测第122-129页
  (三) 发酵产物抗病毒活性检测第129-132页
第四部分 生物合成基因簇的异源表达第132-141页
 1.S.lividans TK24转化子的获得第132页
 2.转化子的联合共培养结果分析第132-141页
结论第141-143页
参考文献第143-144页
文献综述第144-175页
 一、AHBA生物合成途径的研究第144-146页
 二、聚酮体生物合成途径的研究第146-149页
 三、萘醌型安莎类抗生素生物合成基因簇的研究第149-164页
  1.rifamycin B第149-163页
  2.Naphthomycin C第163-164页
 四.苯醌型安莎类抗生素第164-169页
  Ansatsienin A第164-169页
 五、Mitomycin C第169页
 六、Geldanamycin的研究进展第169-175页
参考文献第175-184页
攻读学位期间论文发表及获奖情况第184-185页
致谢第185-186页

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