| 摘要 | 第1-16页 |
| ABSTRACT | 第16-22页 |
| 第一章 绪论 | 第22-51页 |
| 1 酶催化反应机理研究 | 第22-24页 |
| 2 蛋白质对小分子化合物的分子识别研究 | 第24-25页 |
| 3 基于定量构效关系的药物设计 | 第25页 |
| 4 选题背景 | 第25-31页 |
| ·糖苷水解酶和糖苷合成酶 | 第26-28页 |
| ·维生素D和维生素D受体 | 第28-29页 |
| ·孕酮受体及生理功能 | 第29页 |
| ·前列腺素类化合物 | 第29-31页 |
| 5 研究进展 | 第31-35页 |
| ·糖苷酶催化水解和合成机理 | 第31-33页 |
| ·维生素D相关抑制剂的研究进展 | 第33-34页 |
| ·PR抑制剂的研究进展 | 第34页 |
| ·前列腺素类化合物的研究进展 | 第34-35页 |
| 6 研究方法 | 第35-39页 |
| ·量子化学方法 | 第35-36页 |
| ·分子对接方法 | 第36-37页 |
| ·分子动力学方法 | 第37页 |
| ·三维定量结构关系 | 第37-38页 |
| ·量子力学/分子力学组合方法 | 第38-39页 |
| 7 开展的主要工作 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-51页 |
| 第二章 水稻葡萄糖苷酶糖基化,去糖基化及合成机理研究 | 第51-89页 |
| 1 水稻葡萄糖苷酶糖基化机理研究 | 第51-62页 |
| ·研究背景 | 第51-53页 |
| ·研究方法 | 第53-54页 |
| ·结果和讨论 | 第54-58页 |
| ·结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-62页 |
| 2 水稻葡糖苷酶去糖基化机理的理论研究 | 第62-74页 |
| ·研究背景 | 第62-65页 |
| ·研究方法 | 第65-66页 |
| ·结果和讨论 | 第66-69页 |
| ·结论 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-74页 |
| 3 水稻葡萄糖苷酶E3 86突变体催化低聚糖合成机理的理论研究 | 第74-89页 |
| ·研究背景 | 第74-76页 |
| ·研究方法 | 第76-78页 |
| ·结果和讨论 | 第78-84页 |
| ·结论 | 第84页 |
| 参考文献 | 第84-89页 |
| 第三章 多形拟杆菌α-型葡萄苷酶催化机理研究 | 第89-108页 |
| 1 研究背景 | 第89-92页 |
| 2 研究方法 | 第92-94页 |
| ·对接设置 | 第92页 |
| ·计算模型 | 第92-94页 |
| 3 结果和讨论 | 第94-103页 |
| ·对接结果 | 第94-95页 |
| ·反应物的优化结构 | 第95页 |
| ·不同反应路径的分析 | 第95-102页 |
| ·底物结合位点处ca~(2+)-O距离变化 | 第102-103页 |
| ·催化效果分析 | 第103页 |
| 4 结论 | 第103页 |
| 参考文献 | 第103-108页 |
| 第四章 维生素D受体构象变化及相关抑制剂3D-QSAR研究 | 第108-148页 |
| 1 人类维生素D受体结合口袋构象变化研究 | 第108-123页 |
| ·研究背景 | 第108-109页 |
| ·研究方法 | 第109-112页 |
| ·结果和讨论 | 第112-118页 |
| ·结论 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-123页 |
| 2 维生素D_3 2 6,2 3-内酯类抑制剂的3D-QSAR研究 | 第123-148页 |
| ·研究背景 | 第123-125页 |
| ·研究方法 | 第125-133页 |
| ·结果和讨论 | 第133-142页 |
| ·结论 | 第142-143页 |
| 参考文献 | 第143-148页 |
| 第五章 芳基羟吲哚和芳基苯并咪唑孕酮受体抑制剂的3D-QSAR研究 | 第148-177页 |
| 1 研究背景 | 第148-149页 |
| 2 研究方法 | 第149-156页 |
| ·化合物和生物活性 | 第149-152页 |
| ·配体的准备 | 第152页 |
| ·分子对接 | 第152-153页 |
| ·分子叠加 | 第153页 |
| ·3D-QSAR：CoMFA和CoMSIA | 第153-156页 |
| 3 结果与讨论 | 第156-169页 |
| ·CoMFA和CoMSIA统计结果分析 | 第156-159页 |
| ·CoMFA模型的等势面图 | 第159-164页 |
| ·CoMSIA等势能面图 | 第164-166页 |
| ·Galahad模型 | 第166-167页 |
| ·CoMFA模型验证 | 第167-169页 |
| ·QM/MM计算 | 第169页 |
| 4 结论 | 第169-170页 |
| 参考文献 | 第170-177页 |
| 第六章 吲哚酰基硫胺类EP_3受体拮抗剂的3D-QSAR研究 | 第177-202页 |
| 1 研究背景 | 第177-179页 |
| 2 研究方法 | 第179-185页 |
| ·数据和生物活性 | 第179页 |
| ·配体分子的准备 | 第179页 |
| ·叠合方法 | 第179-180页 |
| ·3D-QSAR：CoMFA和CoMSIA | 第180-184页 |
| ·Galahad分析 | 第184页 |
| ·自由能扰动模拟 | 第184-185页 |
| 3 结果和讨论 | 第185-197页 |
| ·CoMFA和CoMSIA统计结果 | 第185-188页 |
| ·CoMFA模型等势面图 | 第188-191页 |
| ·CoMSIA等势面图 | 第191-194页 |
| ·Galahad模型 | 第194-196页 |
| ·3,4-二取代基吲哚酰基硫胺类抑制剂药物的设计 | 第196-197页 |
| 4 结论 | 第197页 |
| 参考文献 | 第197-202页 |
| 博士期间发表论文 | 第202-204页 |
| 致谢 | 第204-206页 |
| 外文论文 | 第206-310页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第310页 |
