| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-15页 |
| 符号说明 | 第15-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-36页 |
| 第一节 链霉菌简介 | 第17-18页 |
| 第二节 聚酮化合物和非核糖体类多肽化合物 | 第18-23页 |
| ·聚酮化合物的生物合成 | 第18-21页 |
| ·非核糖体类多肽化合物的生物合成 | 第21-22页 |
| ·PKS/NRP 或 SNRPS/PKS 的杂合化合物的生物合成 | 第22-23页 |
| 第三节 聚醚类抗生素的研究进展 | 第23-30页 |
| ·聚醚类抗生素的药用价值 | 第24页 |
| ·聚醚类抗生素的分类 | 第24-25页 |
| ·聚醚类抗生素的生物合成基因簇 | 第25-30页 |
| 第四节 calcimycin(A23187)的研究进展和背景 | 第30-36页 |
| ·A23187 的化学结构 | 第30-33页 |
| ·A23187 的应用 | 第33-34页 |
| ·A23187 衍生物的生物合成 | 第34页 |
| ·A23187 的化学合成 | 第34-36页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第36-57页 |
| 第一节 实验材料 | 第36-48页 |
| ·菌株 | 第36-37页 |
| ·质粒 | 第37-39页 |
| ·本研究所用的 PCR 引物 | 第39-45页 |
| ·培养基和化学试剂 | 第45-48页 |
| 第二节 实验方法 | 第48-57页 |
| 第三章 A23187 生物合成基因簇的克隆和测序 | 第57-73页 |
| 第一节 A23187 生物合成基因簇的克隆 | 第57-63页 |
| ·克隆探针的设计 | 第57-61页 |
| ·教酒链霉菌 NRRL 3882 的基因组文库的筛选 | 第61-63页 |
| 第二节 A23187 生物合成基因簇的序列测定和 ORF 预测 | 第63-73页 |
| 第四章 A23187 生物合成基因簇中几个重要功能基因的缺失 | 第73-104页 |
| 第一节 教酒链霉菌NRRL 3882 野生型的发酵产物的 HPLC/MS 分析 | 第73-80页 |
| ·野生型发酵物的HPLC/MS分析 | 第73-75页 |
| ·野生型发酵物的高分辨质谱 Q-TOF 分析 | 第75-80页 |
| 第二节 脯氨酸腺苷转移酶CalN2 特异识别和活化脯氨酸 | 第80-86页 |
| ·教酒链霉菌 NRRL 3882 中的calN2 的生物信息学分析 | 第80-82页 |
| ·教酒链霉菌 NRRL 3882 中的calN2 的基因置换 | 第82-84页 |
| ·教酒链霉菌 NRRL 3882 中的calN2 的基因置换突变株的 A23187 的生物合成 | 第84-85页 |
| ·教酒链霉菌 NRRL 3882 中的calN2 的基因置换突变株的回补 | 第85-86页 |
| ·教酒链霉菌 NRRL 3882 中的calN2 的基因置换回补菌株的A23187 的生物合成 | 第86页 |
| 第三节 酰基辅酶 A 脱氢酶 CalN1 负责辅氨酰基德氧化脱氢反应，生成吡咯环 | 第86-92页 |
| ·CalN1 的生物信息学分析 | 第87-89页 |
| ·教酒链霉菌 NRRL 3882 中的calN1 的基因置换和HPLC 分析 | 第89-92页 |
| 第四节 异分支酸酶Ca182 负责水解2-氨基-2 脱氧异分支酸(ADIC)为2.,3-二氢-3-羟基邻氨苯甲酸(DHHA) | 第92-96页 |
| ·Ca182 的生物信息学分析 | 第92-93页 |
| ·ca182 的基因置换 | 第93-96页 |
| 第五节 N-甲基转移酶CalM 催化N-demethyl A23187 生成A23187 | 第96-104页 |
| ·CalM 的生物信息学分析 | 第96-97页 |
| ·calM 的基因置换及其突变株的HPLC 分析 | 第97-100页 |
| ·calM 的基因置换突变株的回补及其HPLC 分析 | 第100-101页 |
| ·CalM 的原核表达和纯化 | 第101-102页 |
| ·体外分析CalM的酶活反应 | 第102-104页 |
| 第五章 A23187 生物合成途径的推导 | 第104-140页 |
| 第一节 A23187 生物合成基因簇边界的推测 | 第104页 |
| 第二节 A23187 生物合成途径的推导一 | 第104-131页 |
| ·负责吡咯环合成的基因 | 第106-109页 |
| ·负责聚酮链生物合成的基因 | 第109-121页 |
| ·负责3-羟基邻氨基苯甲酸合成的基因 | 第121-126页 |
| ·A23187 生物合成中的抗性基因和调节基因 | 第126-130页 |
| ·A23187 生物合成的其它基因 | 第130-131页 |
| 第三节 A23187 生物合成途径推导二 | 第131-140页 |
| ·聚酮链的释放 | 第131-135页 |
| ·苯并噁唑环的形成 | 第135-137页 |
| ·螺旋环的形成 | 第137-138页 |
| ·C3 位的氨基化和 N-甲基化反应 | 第138-139页 |
| ·聚酮链释放、苯并噁唑环和螺旋环形成、C3 位氨基化和 N-甲基化反应的时间顺序 | 第139-140页 |
| 第六章 总结和展望 | 第140-145页 |
| 第一节 本研究工作总结和主要创新点 | 第140-142页 |
| 第二节 进一步工作和展望 | 第142-145页 |
| 参考文献 | 第145-157页 |
| 致谢 | 第157-159页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文和申请的专利 | 第159页 |
