| 中文摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| 1 水稻内生菌的研究进展 | 第10-12页 |
| ·植物内生菌的定义 | 第10页 |
| ·水稻中的内生细菌 | 第10-12页 |
| ·水稻内生细菌的起源 | 第10-11页 |
| ·水稻内生细菌多样性 | 第11-12页 |
| ·水稻内生细菌的功能 | 第12页 |
| 2 植物内生细菌和根系土壤微生物与植物的相互关系 | 第12-13页 |
| ·植物内生细菌和根系土壤微生物对寄主的促生作用 | 第12-13页 |
| ·植物内生细菌和根系土微生物对寄主植物病原微生物的拮抗作用 | 第13页 |
| ·植物内生细菌和根系土壤微生物的代谢产物对植株生长的影响 | 第13页 |
| 3 微生物群落结构研究方法 | 第13-16页 |
| ·微生物群落结构常见的研究方法 | 第14页 |
| ·以磷脂脂肪酸（PLFA）为代表的生物标记法 | 第14-16页 |
| ·脂肪酸生物标记在微生物鉴定中的应用 | 第14-15页 |
| ·脂肪酸生物标记在微生物多样性研究中的应用 | 第15-16页 |
| 4 本研究的总体思路、主要内容及创新点 | 第16-17页 |
| ·本研究的总体思路 | 第16页 |
| ·主要内容 | 第16页 |
| ·创新点 | 第16-17页 |
| 第二章 水稻品种内生细菌群落结构多样性 | 第17-22页 |
| 1 引言 | 第17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-18页 |
| ·材料 | 第17页 |
| ·供试水稻品种 | 第17页 |
| ·培养基及其试剂 | 第17页 |
| ·仪器及分析软件 | 第17页 |
| ·方法 | 第17-18页 |
| ·水稻的采集 | 第17页 |
| ·内生细菌分离与培养 | 第17-18页 |
| ·水稻内生细菌种类鉴定（Sherlock MIS） | 第18页 |
| ·数理统计分析 | 第18页 |
| 3 结果与分析 | 第18-21页 |
| ·水稻内生细菌种类鉴定 | 第18-19页 |
| ·水稻内生细菌群落结构分析 | 第19-20页 |
| ·不同部位水稻内生细菌“0-1”聚类分析 | 第20-21页 |
| ·水稻内生细菌主成分分析 | 第21页 |
| 4 讨论 | 第21-22页 |
| 第三章 水稻内生细菌与根系土壤细菌的相关性 | 第22-31页 |
| 1 引言 | 第22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-23页 |
| ·材料 | 第22页 |
| ·水稻品种 | 第22页 |
| ·培养基与试剂 | 第22页 |
| ·仪器与分析软件 | 第22页 |
| ·方法 | 第22-23页 |
| ·水稻的采集 | 第22页 |
| ·水稻内生细菌和根系土壤细菌分离与培养 | 第22页 |
| ·水稻内生细菌和根系土壤细菌种类鉴定 | 第22页 |
| ·水稻生物学特性调查 | 第22-23页 |
| ·数理统计方法 | 第23页 |
| 3 结果与分析 | 第23-29页 |
| ·水稻根系土壤细菌和内生细菌的种类鉴定 | 第23-24页 |
| ·内生细菌的鉴定 | 第23-24页 |
| ·根系土壤细菌的鉴定 | 第24页 |
| ·水稻内生细菌与根系土壤细菌群落结构多样性指数比较 | 第24-26页 |
| ·水稻内生细菌与根系土壤细菌群落结构典型相关分析 | 第26-28页 |
| ·水稻根系细菌总量和内生细菌总量与水稻生物学特征的相关分析 | 第28-29页 |
| 4 讨论 | 第29-31页 |
| 第四章 水稻内生菌群落脂肪酸生物标记的多样性 | 第31-37页 |
| 1 引言 | 第31页 |
| 2 材料与方法 | 第31-32页 |
| ·材料 | 第31页 |
| ·水稻材料 | 第31页 |
| ·试剂 | 第31页 |
| ·仪器与分析软件 | 第31页 |
| ·方法 | 第31-32页 |
| ·水稻品种采集 | 第31页 |
| ·水稻内生菌脂肪酸生物标记提取方法 | 第31-32页 |
| ·水稻内生细菌脂肪酸生物标记检测 | 第32页 |
| ·数理统计方法 | 第32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-36页 |
| ·水稻内生菌脂肪酸生物标记群落结构分析 | 第32-33页 |
| ·水稻内生菌脂肪酸生物标记聚类分析 | 第33-34页 |
| ·不同品种水稻内生菌脂肪酸种类和含量比较 | 第34页 |
| ·水稻内生菌脂肪酸生物标记非线性映射分析 | 第34-36页 |
| 4 讨论 | 第36-37页 |
| 第五章 水稻不同品种根系土壤微生物PLFA 的多态性 | 第37-47页 |
| 1 引言 | 第37页 |
| 2 材料与方法 | 第37-39页 |
| ·材料 | 第37页 |
| ·供试材料 | 第37页 |
| ·试剂 | 第37页 |
| ·仪器与分析软件 | 第37页 |
| ·方法 | 第37-38页 |
| ·水稻品种采集 | 第37页 |
| ·田间试验设计和性状调查 | 第37-38页 |
| ·根系土壤取样方法 | 第38页 |
| ·土壤脂肪酸生物标记（PLFAs）分析方法 | 第38页 |
| ·数理统计分析 | 第38-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-45页 |
| ·水稻根系土壤微生物群落脂肪酸生物标记的群落结构分析 | 第39-40页 |
| ·水稻根系土壤微生物脂肪酸生物标记的分布特性 | 第40-42页 |
| ·不同水稻品种根系土壤微生物脂肪酸生物标记种类和总量的比较 | 第42-43页 |
| ·不同水稻品种根系土壤特征微生物脂肪酸生物标记含量的比较 | 第43页 |
| ·不同水稻品种根系土壤硫酸盐还原细菌和甲烷氧化菌含量的比较 | 第43-44页 |
| ·不同品种水稻根系土壤微生物脂肪酸生物量总量与水稻品种特性相关性分析 | 第44-45页 |
| ·基于脂肪酸生物标记的不同水稻品种聚类分析 | 第45页 |
| 4 讨论 | 第45-47页 |
| 第六章 小结和展望 | 第47-48页 |
| 1、小结 | 第47页 |
| 2、展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 作者简介 | 第54-55页 |
| 试验报告 | 第55页 |
