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泛素特异性蛋白酶USP2和USP8催化机制和底物特异性研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-10页
第一部分 引言第10-29页
 一、泛素和泛素化作用第10-15页
  (一) 泛素第10-11页
  (二) 泛素化作用第11-13页
  (三) 泛素化过程中的酶第13-14页
  (四) 泛素类似蛋白(Ubl-Ubiquitin-like proteins)第14-15页
 二、去泛素化作用第15-16页
 三、去泛素化酶(DUB)第16-27页
  (一) DUBs 的作用第17-19页
  (二) DUBs 亚家族第19-27页
 四、半胱氨酸酶的作用机理第27-28页
 五、本研究的目的和意义第28-29页
第二部分 材料与方法第29-40页
 一、实验材料第29-33页
  (一) 主要试剂第29页
  (二) 质粒及菌株第29-30页
  (三) 底物和抑制剂第30页
  (四) 引物和测序第30-31页
  (五) 药品及缓冲液第31-32页
  (六) 实验仪器第32-33页
 二、实验方法第33-40页
  (一) 表达载体的构建第33-35页
  (二) 蛋白的表达和纯化第35-37页
  (三) 底物的合成和纯化第37-38页
  (四) 酶活性分析第38-39页
  (五) 蛋白二级结构分析第39-40页
第三部分 实验结果第40-75页
 一、USP2 催化机制研究第40-67页
  (一) USP2-WT 活性分析第40-45页
  (二) 氧离子洞在USP2 催化过程中的作用第45-55页
  (三) 催化中心三联体在USP2 催化过程中的作用第55-61页
  (四) USP2 抑制活性分析第61-63页
  (五) 二级结构分析第63-64页
  (六) 催化中心以外的结构对酶活的影响第64-67页
 二、USP8 催化机制研究第67-75页
  (一) 载体的构建和表达第67-68页
  (二) USP8-WT 和突变体的活性分析第68-75页
第四部分 讨论第75-83页
 一、催化机制研究第75-80页
  (一) USP2 的催化机制分析第75-77页
  (二) USP2 与Ub、Ubal 复合物构象模型分析第77-79页
  (三) USP8 的催化机制第79-80页
 二、底物特异性研究第80-83页
  (一) USP2 的底物特异性研究第80-81页
  (二) USP8 的底物特异性研究第81页
  (三) 不同检测方法的比较分析第81-83页
第五部分 结论第83-84页
参考文献第84-94页
附录第94-106页
 一、图表第94-103页
 二、英文缩略词第103-106页
致谢第106-107页
作者简历第107-108页
在学期间参与的科研项目和公开发表的论文第108页

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