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木薯耐寒相关microRNA的差异表达分析

摘要第1-5页
Abstract第5-7页
目录第7-9页
1 前言第9-25页
   ·木薯是重要的能源作物第9-10页
   ·植物的抗寒研究机理第10-14页
     ·植物低温生理生化变化第11页
     ·植物的抗寒基因的表达及调控第11-12页
     ·低温信号转导第12-13页
     ·低温逆境蛋白第13-14页
   ·miRNA研究进展第14-24页
     ·miRNA的分子机制第14-16页
       ·miRNA的生物合成第14-15页
       ·miRNA的作用机制第15-16页
     ·miRNA的研究方法第16-19页
       ·miRNA的获取方法第16-17页
       ·miRNA的检测方法第17-19页
     ·植物miRNA数据库第19-20页
     ·植物miRNA功能第20-24页
       ·miRNA与植物的生长发育第20-21页
       ·miRNA与植物激素的调节及信号转导第21-22页
       ·miRNA与植物的抗逆胁迫反应第22-23页
       ·植物miRNA与靶基因的关系及应用第23-24页
   ·本研究的目的和意义第24-25页
2 材料与方法第25-32页
   ·植物的材料及其低温处理第25-26页
   ·主要仪器及试剂第26-27页
     ·主要仪器第26页
     ·试剂与试剂盒第26-27页
   ·miRNA差异表达分析第27-31页
     ·miRNA获取第28页
       ·计算机预测第28页
       ·胁迫材料Solexa测序第28页
     ·miRNA引物设计第28-29页
     ·miRNA的提取第29-30页
     ·miRNA 3’末端加Poly(A)第30页
     ·cDNA第一链的合成第30页
     ·RT-PCR检测第30-31页
     ·实时定量PCR对miRNA进行相对定量分析第31页
   ·miRNA靶基因预测第31-32页
3 结果与分析第32-59页
   ·木薯品系的低温胁迫反应第32-33页
   ·small RNA检测及qRT-PCR检测第33-36页
     ·small RNA质控检测及PCR反应体系优化第33-34页
     ·qRT-PCR检测第34-36页
   ·miRNA表达水平分析第36-37页
     ·未处理对照下miRNA表达水平第36-37页
     ·低温胁迫下miRNA表达水平第37页
   ·不同胁迫过程中miRNA的差异表达第37-47页
     ·在未处理对照下miRNA的表达第37页
     ·在低温胁迫下miRNA的表达第37-40页
       ·低温诱导AT下表达的miRNA第38页
       ·诱导后寒害AH下表达的miRNA第38-39页
       ·非诱导直接寒害NAH下表达的miRNA第39-40页
     ·未处理对照和低温胁迫下miRNA的表达异同第40-42页
  小结第42-47页
   ·不同胁迫过程中miRNA的表达模式第47-56页
     ·miRNA表达模式的确定第47页
     ·miRNA表达模式第47-55页
       ·未处理对照下miRNA的表达模式第48-49页
       ·低温诱导AT下miRNA的表达模式第49-52页
       ·诱导后寒害AH下miRNA的表达模式第52页
       ·非诱导直接寒害NAH下miRNA的表达模式第52-55页
  小结第55-56页
   ·木薯低温胁迫miRNA的靶基因预测第56-59页
4 讨论第59-65页
   ·低温胁迫处理及表达模式分类的可行性评价第59页
   ·植物耐低温miRNA与抗寒性关联性第59-60页
   ·植物miRNA的组织特异性第60-61页
   ·植物miRNA的功能第61-64页
   ·植物miRNA及其靶基因第64-65页
5 结论第65-66页
参考文献第66-72页
附录1 苗期培养营养液配制第72-73页
附录2 胁迫处理下23个miRNA的表达水平总结第73-76页
附录3 预测得到的12个miRNA在蓖麻编码区中互作的42对标靶基因及主要功能第76-78页
附录4 测序得到的11个miRNA在拟南芥编码区中互作的138对标靶基因及主要功能第78-82页
研究生期间发表的论文情况第82-83页
致谢第83页

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