| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 引言 | 第10-19页 |
| 1.1 巴西橡胶树 | 第10页 |
| 1.2 植物生长优势的研究进展 | 第10-12页 |
| 1.2.1 植物叶片光合效率与生长的关系 | 第10-11页 |
| 1.2.2 转录组测序在植物生长优势中的应用 | 第11-12页 |
| 1.3 高通量测序技术 | 第12-16页 |
| 1.3.1 高通量测序技术的发展历史 | 第12-16页 |
| 1.3.2 高通量测序在橡胶树研究中的应用 | 第16页 |
| 1.4 研究的目的与意义 | 第16-17页 |
| 1.5 技术路线 | 第17-19页 |
| 2 实验材料与方法 | 第19-25页 |
| 2.1 实验材料 | 第19页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第19页 |
| 2.1.2 主要仪器和软件 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-25页 |
| 2.2.1 橡胶树一年生种苗叶片形态特征调查及株高和茎粗的测量 | 第19页 |
| 2.2.2 橡胶树总RNA的提取 | 第19-20页 |
| 2.2.3 橡胶树转录组测序、测序数据的组装和功能注释 | 第20-21页 |
| 2.2.4 橡胶树叶片基因GO、KEGG和KOG分析 | 第21页 |
| 2.2.5 BT3410和WC11间的差异表达基因的QRT-PCR验证 | 第21-24页 |
| 2.2.6 差异表达基因的鉴定和注释 | 第24页 |
| 2.2.7 筛选橡胶树生长相关的差异表达基因并鉴定 | 第24-25页 |
| 3 实验结果与分析 | 第25-39页 |
| 3.0 文昌11 (WC 11)和保亭3410 (BT 3410)叶片形体特征分析 | 第25页 |
| 3.1 文昌11 (WC 11)和保亭3410 (BT 3410)遗传背景、株高和茎粗的测量 | 第25-26页 |
| 3.2 橡胶树RNA的提取 | 第26-27页 |
| 3.3 橡胶树叶片转录组测序、组装、数据分析及注释 | 第27-28页 |
| 3.4 橡胶树叶片基因GO、KEGG和KOG分析 | 第28-31页 |
| 3.4.1 橡胶树叶片转录组数据GO功能分析 | 第28-29页 |
| 3.4.2 橡胶树叶片转录组数据KOG分析 | 第29-30页 |
| 3.4.3 橡胶树叶片转录组数据KEGG分析 | 第30-31页 |
| 3.5 BT 3410和WC11差异表达基因鉴定及qRT-PCR验证 | 第31-33页 |
| 3.5.1 BT 3410和WC 11差异表达基因鉴定 | 第31页 |
| 3.5.2 第一链cDNA模板的获取及检测 | 第31-32页 |
| 3.5.3 荧光定量引物的筛选 | 第32-33页 |
| 3.5.4 30个差异表达基因的qRT-PCR验证结果 | 第33页 |
| 3.6 BT 3410和WC11中的1066个差异表达基因GO分析 | 第33-34页 |
| 3.6.1 BT3410和WC11的差异表达基因在生物过程GO terms中的富集分析 | 第34页 |
| 3.7 BT3410和WC11差异表达基因KEGG分析 | 第34-35页 |
| 3.8 橡胶树苗期生长相关的候选基因深入分析 | 第35-39页 |
| 3.8.1 橡胶树12个生长相关候选基因的qRT-PCR验证 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-41页 |
| 5 结论与展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-48页 |
| 附录 | 第48-63页 |
| 缩写语表(Abbreviations) | 第63-64页 |
| 硕士期间发表的文章 | 第64页 |
| 作者简历 | 第64-65页 |
| 项目支持 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
