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长链非编码RNA lncATV参与宿主抗病毒机制的研究

中文摘要第7-9页
Abstract第9-10页
前言第11-25页
    一、天然免疫概述第11-19页
        1. RIG-I样受体家族(RLRs)第12-17页
        2. 其它模式识别受体第17-19页
    二、干扰素研究进展第19-22页
        1. 干扰素的分类第20-21页
        2. 干扰素的生物学功能第21页
        3. 干扰素调节的宿主基因第21-22页
    三、长链非编码RNA研究进展第22-25页
材料与方法第25-40页
    一、材料第25-32页
        1. 细胞系和病毒第25页
        2. 质粒第25-26页
        3. 抗体第26-27页
        4. 部分生化试剂第27-29页
        5. 工具酶第29页
        6. 溶液配制第29-31页
        7. 主要仪器第31-32页
        8. 数据处理和分析软件第32页
    二、实验方法第32-40页
        1. 细胞培养第32页
        2. 病毒的制备及抗病毒实验第32-33页
        3. lncRNA差异表达芯片制备与分析第33-34页
        4. lncRNA对病毒感染的影响第34-35页
        5. 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第35页
        6. 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)第35-36页
        7. 荧光实时定量RT-PCR第36-37页
        8. 荧光素酶报告基因实验第37页
        9. 免疫荧光实验和细胞内免疫印迹第37-38页
        10. RNA FISH检测lncATV在细胞的定位第38-39页
        11. 统计分析第39-40页
实验结果第40-74页
    一、三种类型干扰素调节的lncRNA表达谱第40-46页
        1. 干扰素处理条件的确定第40-42页
        2. 干扰素处理Huh7细胞的样本质量的验证第42页
        3. 三种类型干扰素调节的lncRNA表达谱分析第42-44页
        4. 芯片结果的验证第44-46页
    二、lncATV的生物学特性第46-52页
        1. lncATV的克隆第46-47页
        2. 干扰素处理诱导lncATV的表达第47页
        3. 病毒感染诱导lncATV的表达第47-48页
        4. lncATV的蛋白编码能力预测第48-49页
        5. lncATV在不同细胞中的保守性第49-50页
        6. lncATV在不同细胞中的表达水平差异第50页
        7. lncATV在细胞内的定位第50-52页
    三、lncATV影响多种病毒的感染第52-61页
        1. 沉默lncATV抑制HCV的感染第52-54页
        2. 沉默lncATV抑制ZIKV的感染第54-55页
        3. 沉默lncATV抑制NDV病毒的感染第55-57页
        4. 沉默lncATV抑制SeV病毒的感染第57-58页
        5. 过表达lncATV促进HCV的感染第58-59页
        6. 在Hep2细胞中沉默lncATV抑制NDV和Sev病毒的感染第59-61页
    四、lncATV调节细胞内的天然免疫反应第61-70页
        1. 沉默lncATV增强RIG-I介导的IFN-β和ISRE的报告基因活性第61-62页
        2. 过表达lncATV抑制RIG-I介导的ISRE的激活第62-63页
        3. 过表达lncATV抑制病毒诱导的IFN-β和ISRE报告基因活性第63-64页
        4. 沉默lncATV显著激活RLR信号通路第64-66页
        5. 沉默lncATV显著激活Ⅰ型干扰素介导的天然免疫反应第66-68页
        6. 过表达lncATV抑制RLR和Ⅰ型干扰素信号通路第68-70页
    五、lncATV调节天然免疫的机制研究第70-74页
        1. 不同刺激剂的作用下沉默lncATV对IFN-β报告基因的影响第70-71页
        2. 不同天然免疫刺激剂作用下沉默lncATV对ISRE报告基因的影响第71-72页
        3. 在RIG-I缺失的Huh7.5.1中敲低lncATV对病毒感染的影响第72页
        4. 利用siRNA敲低内源RIG-I对lncATV发挥抗病毒作用的影响第72-74页
讨论第74-77页
结论第77-78页
参考文献第78-86页
文献综述第86-96页
    参考文献第93-96页
缩略语第96-99页
致谢第99-100页
个人简历及发表文章第100页

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