摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
引言 | 第12-28页 |
0.1 人乳头瘤病毒研究现状 | 第12-17页 |
0.1.1 人乳头瘤病毒及其历史背景 | 第12-13页 |
0.1.2 HPV结构和生理学功能 | 第13-15页 |
0.1.3 HPV病毒复制机制 | 第15-16页 |
0.1.4 HPV关键蛋白E1的研究进展 | 第16-17页 |
0.2 防治HPV药物的研究 | 第17-19页 |
0.2.1 药物的研究 | 第18-19页 |
0.2.1.1 预防性疫苗 | 第18页 |
0.2.1.2 HPV治疗性疫苗 | 第18-19页 |
0.2.1.3 治疗HPV的药物 | 第19页 |
0.3 计算机辅助药物设计 | 第19-26页 |
0.3.1 计算机辅助药物设计方法分类 | 第20-25页 |
0.3.1.1 基于受体结构下的直接药物设计 | 第20-25页 |
0.3.1.1.1 从头药物设计(de novo drug design) | 第20-21页 |
0.3.1.1.2 分子对接(docking) | 第21-25页 |
0.3.1.1.2.1 分子对接的原理 | 第22页 |
0.3.1.1.2.2 分子对接方法分类 | 第22-25页 |
0.3.1.2 受体结构未知情况下的间接药物设计 | 第25页 |
0.3.2 分子动力学模拟 | 第25-26页 |
0.4 本项目的研究目的及意义 | 第26-28页 |
第1章 人乳头瘤病毒DNA解旋酶抑制剂作用机制的研究 | 第28-38页 |
1.1 前言 | 第28-29页 |
1.2 材料和方法 | 第29-31页 |
1.2.1 E1晶体结构的预处理 | 第29-30页 |
1.2.2 联苯磺化乙酸小分子配体处理 | 第30页 |
1.2.3 分子对接 | 第30页 |
1.2.4 分子动力学模拟 | 第30-31页 |
1.3 结果与讨论 | 第31-37页 |
1.3.1 分子对接中受体活性位点设定 | 第31页 |
1.3.2 分子对接结果 | 第31-33页 |
1.3.3 联苯磺化乙酸衍生物与E1的对接模式 | 第33-35页 |
1.3.4 动力学模拟 | 第35-37页 |
1.4 本章小结 | 第37-38页 |
第2章 基于分子对接技术筛选天然产物数据库中潜在的HPV DNA解旋酶抑制剂 | 第38-46页 |
2.1 前言 | 第38页 |
2.2 材料和方法 | 第38-40页 |
2.2.1 天然产物小分子数据库的选择及化合物分子的预处理 | 第38-39页 |
2.2.2 蛋白晶体结构的预处理 | 第39页 |
2.2.3 分子对接 | 第39页 |
2.2.4 小分子抑制剂的选取 | 第39-40页 |
2.3 结果与讨论 | 第40-44页 |
2.3.1 分子对接的可行性验证 | 第40-41页 |
2.3.2 受体蛋白活性位点设定 | 第41页 |
2.3.3 分子对接结果 | 第41-43页 |
2.3.4 选取化合物与E1-E2受体蛋白作用方式 | 第43-44页 |
2.4 本章小结 | 第44-46页 |
第3章 携带HPV病毒DNA的质粒扩增验证 | 第46-54页 |
3.1 前言 | 第46页 |
3.2 材料和方法 | 第46-49页 |
3.2.1 菌种和载体 | 第46-47页 |
3.2.2 生化试剂和工具酶 | 第47-48页 |
3.2.3 主要仪器和设备 | 第48页 |
3.2.4 溶液和培养基的配制 | 第48-49页 |
3.3 方法 | 第49-52页 |
3.3.1 实验设计和流程 | 第49-50页 |
3.3.2 大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第50页 |
3.3.3 pBR322-HPV11质粒的转化 | 第50-51页 |
3.3.4 阳性质粒的筛选鉴定 | 第51-52页 |
3.3.5 阳性菌种的保存 | 第52页 |
3.4 pBR322-HPV11质粒鉴定及单酶切验证 | 第52-53页 |
3.5 本章小结 | 第53-54页 |
第4章 总结 | 第54-56页 |
致谢 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-63页 |
攻读学位期间发表论文以及参加科研情况 | 第63页 |