| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-11页 |
| 1.2 研究意义 | 第11-12页 |
| 1.3 研究现状 | 第12-13页 |
| 1.4 本论文的主要研究内容 | 第13-14页 |
| 1.5 本论文的结构安排 | 第14-15页 |
| 第二章 材料和方法 | 第15-19页 |
| 2.1 分子动力学模拟 | 第15-16页 |
| 2.2 结合自由能计算 | 第16-19页 |
| 第三章 肽调节蛋白质相互作用的动力学与热力学研究 | 第19-41页 |
| 3.1 背景及研究问题 | 第19-20页 |
| 3.2 材料和方法 | 第20-25页 |
| 3.2.1 肽调节蛋白体系的甄选 | 第20-22页 |
| 3.2.2 构建肽-蛋白体系 | 第22-23页 |
| 3.2.3 分子动力学方法和策略 | 第23-24页 |
| 3.2.4 肽/蛋白结合自由能计算 | 第24-25页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第25-39页 |
| 3.3.1 肽-蛋白体系与蛋白-蛋白体系动力学轨迹比较分析 | 第25-29页 |
| 3.3.2 肽-蛋白体系与蛋白-蛋白体系的动力学行为和结构特点比较分析 | 第29-39页 |
| 3.3.3 肽-蛋白体系与蛋白-蛋白体系的热力学性质比较分析 | 第39页 |
| 3.4 本章小结 | 第39-41页 |
| 第四章 分离肽调节蛋白质相互作用的动力学研究 | 第41-46页 |
| 4.1 背景及研究问题 | 第41页 |
| 4.2 材料和方法 | 第41-42页 |
| 4.2.2 构建分离肽/蛋白体系 | 第41-42页 |
| 4.2.3 分子动力学方法和策略 | 第42页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第42-44页 |
| 4.3.1 分离肽-蛋白体系轨迹分析 | 第42-43页 |
| 4.3.2 肽-蛋白体系与蛋白-蛋白体系的动力学行为和结构特点比较分析 | 第43-44页 |
| 4.4 本章小结 | 第44-46页 |
| 第五章 探索自结合肽作为药物靶标 | 第46-56页 |
| 5.1 背景及研究问题 | 第46-48页 |
| 5.2 材料和方法 | 第48-50页 |
| 5.2.1 Src结构模型 | 第48-49页 |
| 5.2.2 分子动力学模拟的方法及策略 | 第49页 |
| 5.2.3 体系结合自由能计算 | 第49-50页 |
| 5.3 结论和讨论 | 第50-55页 |
| 5.3.1 针对Src的自结合肽位点的动力学分析 | 第50-53页 |
| 5.3.2 针对Src的自结合肽位点的结构和能量分析 | 第53-55页 |
| 5.4 本章小结 | 第55-56页 |
| 第六章 总结和展望 | 第56-58页 |
| 6.1 总结 | 第56页 |
| 6.2 后续工作展望 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 攻读硕士期间研究成果 | 第63页 |
