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边鸡MSTN基因、MyoD家族部分基因和Smad3基因多态性与生长和屠体性状的相关性分析以及表达的研究

中文摘要第8-11页
ABSTRACT第11-13页
第一章 文献综述第14-29页
    1. 骨骼肌的组成和发生第14-15页
    2. MyoD基因家族概况及研究进展第15-19页
        2.1 MyoD基因第16-18页
        2.2 MyoG基因第18-19页
        2.3 Myf5基因第19页
    3. MSTN基因第19-22页
        3.1 MSTN基因及编码蛋白特性第20页
        3.2 MSTN的作用机制及功能第20-22页
    4. Smads基因家族第22-24页
        4.1 Smads基因家族结构与功能第22-23页
        4.2 Smad 3基因结构与功能第23-24页
    5. 实时荧光定量PCR技术第24-28页
        5.1 荧光定量PCR的定量方法第25页
        5.2 荧光定量PCR的荧光标记方法的分类第25-26页
            5.2.1 DNA结合染料法第25页
            5.2.2 探针法第25-26页
        5.3 荧光定量PCR的应用第26-28页
            5.3.1 医学领域的应用第26-27页
            5.3.2 畜牧学领域的应用第27-28页
    6. 本研究的目的与意义第28-29页
第二章 MSTN基因、MYOD基因家族和SMAD3基因多态性及其与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第29-112页
    第一节 MSTN基因的多态性及其与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第29-48页
        1. 材料与方法第29-36页
            1.1 试验材料第29-32页
                1.1.1 试验动物第29页
                1.1.2 主要实验仪器与设备第29-30页
                1.1.3 生物学分析软件第30页
                1.1.4 主要实验试剂第30-31页
                1.1.5 主要试剂的配制第31-32页
            1.2 试验方法第32-34页
                1.2.1 鸡血液DNA提取第32页
                1.2.2 引物设计第32页
                1.2.3 PCR-RFLP分析第32页
                1.2.4 多态片段的回收和序列测定第32-33页
                1.2.5 肌肉样本石蜡切片制作第33-34页
            1.3 统计方法第34-36页
                1.3.1 群体基因频率、基因型频率的计算以及卡方检验第34-35页
                1.3.2 遗传多样性参数第35-36页
                1.3.3 统计分析模型第36页
                1.3.4 基因位点的方差组分分析第36页
        2. 结果与分析第36-45页
            2.1 鸡基因组DNA和PCR产物检测结果第36-37页
                2.1.1 基因组DNA提取结果第36-37页
                2.1.2 引物MYOE1-3 PCR扩增效果及BbvI酶切检测第37页
            2.2 MSTN基因不同基因型个体测序及分析第37-38页
            2.3 边鸡MSTN基因的遗传学分析第38页
            2.4 MSTN基因与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第38-45页
                2.4.1 MSTN基因与七世代边鸡母鸡生长性状的相关性分析第38-39页
                2.4.2 七世代边鸡MSTN基因G2283A位点的方差组分分析第39页
                2.4.3 MSTN基因与八世代边鸡母鸡生长和屠体性状的相关性分析第39-41页
                2.4.4 边鸡八世代母鸡MSTN不同基因型个体生长和屠体性状的表型相关分析第41-44页
                2.4.5 八世代边鸡MSTN基因G2283A位点不同基因型个体肌纤维特性比较分析第44-45页
        3. 讨论第45-48页
            3.1 边鸡MSTN基因的多态性和群体遗传学分析第45页
            3.2 边鸡MSTN基因G2283A位点多态性与生长和屠体性状相关性第45-47页
            3.3 边鸡八世代母鸡MSTN基因G2283A位点不同基因型个体肌纤维特性第47-48页
    第二节 MYOD基因的多态性及其与边鸡生长和屠体性状状的相关性分析第48-70页
        1 材料与方法第48-50页
            1.1 试验材料第48页
                1.1.1 试验动物第48页
                1.1.2 主要实验仪器与设备第48页
                1.1.3 生物学分析软件第48页
                1.1.4 主要实验试剂第48页
                1.1.5 主要试剂的配制第48页
            1.2 试验方法第48-49页
                1.2.1 鸡血液DNA提取第48-49页
                1.2.2 引物设计第49页
                1.2.3 PCR-SSCP分析第49页
                1.2.4 多态片段的回收和序列测定第49页
            1.3 统计方法第49-50页
                1.3.1 群体基因频率、基因型频率的计算以及卡方检验第49页
                1.3.2 遗传多样性参数第49-50页
                1.3.3 统计分析模型第50页
        2. 结果与分析第50-66页
            2.1 引物PCR产物检测第50-51页
            2.2 MyoD基因PCR-SSCP分析第51页
            2.3 MyoD基因不同基因型个体测序及分析第51-53页
            2.4 边鸡MyoD基因的群体遗传学分析第53页
            2.5 MyoD基因与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第53-66页
                2.5.1 MyoD基因与七世代边鸡母鸡生长性状的相关性分析第53-59页
                2.5.2 MyoD基因MD-3和MD-4位点与MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对边鸡快慢型群体的生长和屠体性状联合效应分析第59-66页
        3. 讨论第66-70页
            3.1 MyoD基因的多态性及群体遗传学分析第66页
            3.2 MyoD基因多态性与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第66-70页
                3.2.1 MyoD基因MD-3和MD-4位点与七世代边鸡生长性状的相关性分析第66-67页
                3.2.2 MyoD基因MD-3和MD-4位点不同基因型组合与七世代边鸡生长性状的相关性分析第67-68页
                3.2.3 MyoD基因MD-3和MD-4位点与MSTN基因G2283A位点对边鸡快慢型群体生长和屠体性状的联合效应分析第68-70页
    第三节 MYOG基因的多态性及其与边鸡生长和屠体性状状的相关性分析第70-82页
        1 材料与方法第70-71页
            1.1 试验材料第70页
                1.1.1 试验动物第70页
                1.1.2 主要实验仪器与设备第70页
                1.1.3 生物学分析软件第70页
                1.1.4 主要实验试剂第70页
                1.1.5 主要试剂的配制第70页
            1.2 试验方法第70-71页
                1.2.1 鸡血液DNA提取第70页
                1.2.2 引物设计第70-71页
                1.2.3 PCR-SSCP分析第71页
                1.2.4 多态片段的回收和序列测定第71页
            1.3 统计方法第71页
        2. 结果与分析第71-79页
            2.1 引物PCR产物检测第71页
            2.2 MyoG基因PCR-SSCP分析第71-72页
            2.3 MyoG基因不同基因型个体测序及分析第72-73页
            2.4 边鸡MyoG基因的群体遗传学分析第73页
            2.5 MyoG基因多态性与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第73-79页
                2.5.1 MyoG基因MG-5位点与七世代边鸡母鸡生长性状的相关性分析第73-74页
                2.5.2 MyoG基因与MSTN基因不同基因型组合对边鸡快慢型群体生长和屠体性状的联合效应分析第74-79页
        3. 讨论第79-82页
            3.1 MyoG基因的多态性及群体遗传学分析第79页
            3.2 MyoG基因的多态性与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第79-82页
                3.2.1 MyoG基因的多态性与七世代边鸡生长性状的相关性分析第79-80页
                3.2.2 MyoG基因MG-5位点与MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对边鸡快慢型群体生长和屠体性状的联合效应分析第80-82页
    第四节 MYF5基因多态性及其与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第82-102页
        1. 材料与方法第82-83页
            1.1 试验材料第82页
                1.1.1 实验动物第82页
                1.1.2 主要实验仪器与设备第82页
                1.1.3 生物学分析软件第82页
                1.1.4 主要实验试剂第82页
                1.1.5 主要试剂的配制第82页
            1.2 试验方法第82-83页
                1.2.1 鸡血液DNA提取第82页
                1.2.2 引物设计第82-83页
                1.2.3 PCR-SSCP分析第83页
                1.2.4 多态片段的回收和序列测定第83页
            1.3 统计方法第83页
        2. 结果与分析第83-98页
            2.1 引物PCR产物检测第83页
            2.2 Myf5基因PCR-SSCP分析第83-84页
            2.3 Myf5基因不同基因型个体测序及分析第84-85页
            2.4 边鸡Myf5基因的群体遗传学分析第85-86页
                2.4.1 边鸡Myf5基因MY5-1位点的群体遗传学分析第85页
                2.4.2 边鸡Myf5基因MY5-3位点的群体遗传学分析第85-86页
            2.5 Myf5基因多态性与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第86-98页
                2.5.1 Myf5基因MY5-1位点与七世代边鸡母鸡生长性状的相关性分析第86-87页
                2.5.2 Myf5基因MY5-3位点与七世代边鸡母鸡生长性状的相关性分析第87页
                2.5.3 七世代边鸡Myf5基因MY5-3位点的方差组分分析第87-88页
                2.5.4 Myf5基因MY5-1和MY5-3位点不同基因型组合对七世代边鸡母鸡生长性状的联合效应分析第88-89页
                2.5.5 八世代边鸡Myf5基因MY5-1和MY5-3位点与MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对生长和屠体性状的联合效应分析第89-98页
        3. 讨论第98-102页
            3.1 Myf5基因的多态性及群体遗传学分析第98页
            3.2 Myf5基因的多态性与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第98-102页
                3.2.1 Myf5基因MY5-1和MY5-3位点与七世代边鸡生长性状的相关性分析第98-99页
                3.2.2 Myf5基因MY5-1和MY5-3位点不同基因型组合对七世代边鸡生长性状的联合效应分析第99-100页
                3.2.3 Myf5基因MY5-1和MY5-3位点与MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对边鸡快慢型群体生长和屠体性状的联合效应分析第100-102页
    第五节 SMAD 3基因的多态性及其与边鸡生长和屠体性状状的相关性分析第102-112页
        1 材料与方法第102-103页
            1.1 试验材料第102页
                1.1.1 试验动物第102页
                1.1.2 主要实验仪器与设备第102页
                1.1.3 生物学分析软件第102页
                1.1.4 主要实验试剂第102页
                1.1.5 主要试剂的配制第102页
            1.2 试验方法第102-103页
                1.2.1 鸡血液DNA提取第102页
                1.2.2 引物设计第102-103页
                1.2.3 PCR-SSCP分析第103页
                1.2.4 多态片段的回收和序列测定第103页
            1.3 统计方法第103页
        2. 结果与分析第103-110页
            2.1 引物PCR产物检测第103-104页
            2.2 Smad3基因PCR-SSCP分析第104页
            2.3 Smad 3基因不同基因型个体测序及分析第104-105页
            2.4 边鸡Smad 3基因的群体遗传学分析第105页
            2.5 Smad 3基因多态性与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第105-110页
                2.5.1 Smad 3基因S8位点与七世代边鸡母鸡生长性状的相关性分析第105页
                2.5.2 七世代边鸡Smad 3基因S8位点的方差组分分析第105-106页
                2.5.3 Smad3基因S8位点与MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对边鸡快慢型群体生长和屠体性状的联合效应分析第106-110页
        3. 讨论第110-112页
            3.1 Smad3基因的多态性及群体遗传学分析第110页
            3.2 Smad3基因多态性与边鸡生长和屠体性状的相关性分析第110-112页
                3.2.1 Smad3基因S8位点与七世代边鸡生长性状的相关性分析第110页
                3.2.2 Smad3基因S8位点位点与MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对边鸡快慢型群体生长和屠体性状的联合效应分析第110-112页
第三章 MSTN基因、MYOD基因家族和SMAD3基因在边鸡肌肉组织中表达水平的研究第112-133页
    1 材料与方法第112-115页
        1.1 试验鸡群和样本采集第112页
        1.2 主要试剂第112-113页
        1.3 主要仪器设备第113页
        1.4 分析工具软件第113页
        1.5 实验方法第113-115页
            1.5.1 主要试剂配制第113页
            1.5.2 鸡组织总RNA的提取和检测(Trizol法)第113-114页
            1.5.3 引物设计和PCR扩增第114页
            1.5.4 RNA反转录第114页
            1.5.5 目的基因和内参基因的PCR扩增第114-115页
            1.5.6 扩增片段的测序第115页
            1.5.7 标准曲线的绘制第115页
            1.5.8 实时荧光定量PCR第115页
        1.6 统计软件和方法第115页
    2 结果与分析第115-127页
        2.1 RNA的提取结果第115-116页
        2.2 目的基因和内参基因常规PCR检测结果第116-117页
        2.3 目的基因和内参基因的溶解曲线第117-119页
        2.4 目的基因和内参基因的标准曲线第119-121页
        2.5 候选基因表达水平相对定量分析第121-127页
            2.5.1 MSTN基因表达水平相对定量分析第121-122页
            2.5.2 MyoD基因表达水平相对定量分析第122-123页
            2.5.3 MyoG基因表达水平相对定量分析第123-124页
            2.5.4 Myf5基因表达水平相对定量分析第124-126页
            2.5.5 Smad3基因表达水平相对定量分析第126-127页
    3. 讨论第127-133页
        3.1 荧光定量PCR的影响因素第127-128页
        3.2 MSTN基因的表达第128-129页
        3.3 MyoD基因的表达第129页
        3.4 MyoG基因的表达第129-130页
        3.5 Myf5基因的表达第130-131页
        3.6 Smad3基因的表达第131-132页
        3.7 MSTN基因、MyoD基因家族及Smad3基因的表达水平关系第132-133页
全文结论第133-134页
创新点第134-135页
参考文献第135-142页
致谢第142-143页
攻读学位期间发表学术论文第143-144页

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