| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第13-16页 |
| 1.1 引言 | 第13页 |
| 1.2 研究背景与意义 | 第13-14页 |
| 1.3 本文的主要研究内容与安排 | 第14-16页 |
| 第二章 基因选择性剪接生物学基础 | 第16-23页 |
| 2.1 引言 | 第16页 |
| 2.2 生物学基础 | 第16-20页 |
| 2.2.1 分子生物学中心法则 | 第16-17页 |
| 2.2.2 基因选择性剪接过程 | 第17-19页 |
| 2.2.3 深度测序技术 | 第19-20页 |
| 2.3 TCGA数据库 | 第20-22页 |
| 2.4 本章小结 | 第22-23页 |
| 第三章 剪接调控元件的数据挖掘分析 | 第23-47页 |
| 3.1 引言 | 第23-24页 |
| 3.2 数据准备和方法 | 第24-28页 |
| 3.2.1 数据集 | 第24-26页 |
| 3.2.2 序列模式挖掘方法 | 第26-28页 |
| 3.3 结果与分析 | 第28-45页 |
| 3.3.1 基于序列模式挖掘方法分类剪接调控元件 | 第28-33页 |
| 3.3.2 计算方法验证分类性能 | 第33-36页 |
| 3.3.3 生物方法验证分类性能 | 第36-40页 |
| 3.3.4 剪接调控元件多重功能分析 | 第40-41页 |
| 3.3.5 基因组变异的剪接影响分析 | 第41-45页 |
| 3.4 本章小结 | 第45-47页 |
| 第四章 癌症突变的剪接影响研究 | 第47-60页 |
| 4.1 引言 | 第47页 |
| 4.2 数据集和方法 | 第47-53页 |
| 4.2.1 TCGA Splice Seq数据初步分析 | 第47-51页 |
| 4.2.2 方法 | 第51页 |
| 4.2.3 癌症剪接位点突变提取 | 第51-53页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第53-59页 |
| 4.3.1 序列模式挖掘识别剪接位点癌症变异 | 第53-56页 |
| 4.3.2 生物验证癌症剪接位点突变影响机制分析 | 第56-59页 |
| 4.4 本章小结 | 第59-60页 |
| 第五章 总结与展望 | 第60-62页 |
| 5.1 总结 | 第60-61页 |
| 5.2 展望 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 附录 | 第68-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第75-76页 |
| 攻读硕士学位期间参加的科研项目 | 第76页 |