个体单体型组装问题MEC模型的算法研究与比较
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·研究背景 | 第7-8页 |
| ·单体型检测计算 | 第8-11页 |
| ·单体型组装问题及计算模型 | 第8-9页 |
| ·单体型推断问题及计算模型 | 第9-10页 |
| ·单体型检测的意义及两种问题的比较 | 第10-11页 |
| ·本文的主要内容及结构安排 | 第11-13页 |
| 第二章 单体型组装问题的MEC模型 | 第13-23页 |
| ·遗传学基本概念 | 第13-15页 |
| ·染色体和DNA染色体和DNA | 第13-14页 |
| ·基因及等位基因 | 第14页 |
| ·单核苷酸多态性和单体型 | 第14-15页 |
| ·单体型组装问题 | 第15-21页 |
| ·单体型组装问题相关概念 | 第16-17页 |
| ·单体型组装问题数据形式 | 第17-18页 |
| ·MEC模型 | 第18-20页 |
| ·算法研究 | 第20-21页 |
| ·本章小结 | 第21-23页 |
| 第三章 基于统计学的MCMC算法研究 | 第23-35页 |
| ·马尔科夫链蒙特卡罗(MCMC)方法 | 第23-25页 |
| ·蒙特卡罗模拟方法 | 第23-24页 |
| ·Metropolis-Hastings算法 | 第24-25页 |
| ·基于MEC模型的MCMC算法设计 | 第25-31页 |
| ·问题的最大似然模型描述 | 第26-27页 |
| ·建议分布的设计 | 第27-30页 |
| ·接受概率的设计 | 第30页 |
| ·完整的MCMC算法流程 | 第30-31页 |
| ·算法实现与数值结果 | 第31-33页 |
| ·本章小结 | 第33-35页 |
| 第四章 基于遗传算法的GAMEC算法研究 | 第35-43页 |
| ·基于MEC模型的遗传算法设计 | 第35-39页 |
| ·编码及适应度函数设计 | 第35-36页 |
| ·启发式交叉算子的设计 | 第36-38页 |
| ·变异算子的设计 | 第38-39页 |
| ·完整的遗传算法流程 | 第39页 |
| ·算法实现与数值结果 | 第39-41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 第五章 单体型组装方法的分析与比较 | 第43-53页 |
| ·MCMC算法与GAMEC算法的实验和结果分析 | 第43-49页 |
| ·数据特性分析 | 第43-46页 |
| ·实验结果分析 | 第46-49页 |
| ·MCMC算法与GAMEC算法的比较 | 第49-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 总结与展望 | 第53-55页 |
| 致谢 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-58页 |
