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疏水电荷诱导置换色谱中吸附和置换过程的分子模拟研究

摘要第3-4页
ABSTRACT第4-5页
第一章 文献综述第9-24页
    1.1 抗体分离纯化技术第9-10页
    1.2 疏水电荷诱导色谱第10-13页
        1.2.1 原理及操作方法第10-11页
        1.2.2 配基第11-13页
    1.3 置换色谱第13-18页
        1.3.1 原理及操作方法第14-15页
        1.3.2 置换剂的筛选及开发第15-18页
    1.4 疏水电荷诱导置换色谱第18-19页
    1.5 分子动力学模拟第19-22页
        1.5.1 原理及方法第19-21页
        1.5.2 在蛋白质体系中的应用第21-22页
    1.6 本文研究内容第22-24页
第二章 粗粒化模型的构建及验证第24-46页
    2.1 引言第24-25页
    2.2 模拟系统及模型构建第25-32页
        2.2.1 色谱基质模型第25页
        2.2.2 色谱配基模型第25-27页
        2.2.3 色谱孔道模型第27页
        2.2.4 蛋白质模型第27-28页
        2.2.5 置换剂模型第28-32页
        2.2.6 水分子模型第32页
    2.3 模拟方法及参数设置第32-34页
        2.3.1 模拟设备第32页
        2.3.2 模拟过程及参数设置第32-34页
    2.4 数据分析方法第34-37页
        2.4.1 密度分析第34页
        2.4.2 径向分布函数分析第34页
        2.4.3 标准偏差分析第34-35页
        2.4.4 氢键相互作用分析第35页
        2.4.5 势能分析第35-36页
        2.4.6 均方根偏差分析第36页
        2.4.7 回转半径分析第36-37页
    2.5 结果与讨论第37-45页
        2.5.1 密度分析第37-38页
        2.5.2 径向分布函数分析第38-40页
        2.5.3 扩散系数分析第40-41页
        2.5.4 氢键分析第41-42页
        2.5.5 AI与水分子间非键相互作用分析第42-43页
        2.5.6 AI分子结构变化分析第43-45页
    2.6 小结第45-46页
第三章 吸附过程的分子动力学模拟第46-58页
    3.1 引言第46-47页
    3.2 模拟体系及方法第47-49页
        3.2.1 模拟体系构建及模拟过程第47-48页
        3.2.2 模拟参数设置第48页
        3.2.3 数据分析方法第48-49页
    3.3 结果与讨论第49-57页
        3.3.1 配基密度对吸附的影响第49-50页
        3.3.2 蛋白质初始构象对吸附的影响第50-52页
        3.3.3 蛋白质与配基的相互作用第52-53页
        3.3.4 蛋白质构象变化第53-55页
        3.3.5 吸附位点及能量第55-57页
    3.4 小结第57-58页
第四章 置换过程的分子动力学模拟第58-70页
    4.1 引言第58页
    4.2 模拟体系及方法第58-60页
        4.2.1 模拟体系构建及模拟过程第58-59页
        4.2.2 模拟参数设置第59页
        4.2.3 数据分析方法第59-60页
    4.3 结果与讨论第60-68页
        4.3.1 能量分析第60-61页
        4.3.2 蛋白质质心移动分析第61-62页
        4.3.3 蛋白质结构变化分析第62-63页
        4.3.4 配基密度的影响第63-64页
        4.3.5 置换剂种类的影响第64-66页
        4.3.6 置换剂浓度的影响第66-68页
    4.4 小结第68-70页
第五章 结论与展望第70-72页
    5.1 本文总结第70-71页
    5.2 创新点第71页
    5.3 未来工作的建议与展望第71-72页
参考文献第72-78页
致谢第78页

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