| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-33页 |
| 1.1 环境细菌耐药性的研究现状 | 第13-15页 |
| 1.1.1 环境细菌普遍存在耐药性 | 第13页 |
| 1.1.2 细菌耐药性的产生机制 | 第13-15页 |
| 1.1.3. antibiotic resistome 与antibiotic extended resistome | 第15页 |
| 1.2 水平基因转移 | 第15-17页 |
| 1.2.1 水平基因转移的概念 | 第15-16页 |
| 1.2.2 水平基因转移的作用 | 第16页 |
| 1.2.3 水平基因转移的方式 | 第16-17页 |
| 1.3 整合子 | 第17-21页 |
| 1.3.1 整合子的概念 | 第17-18页 |
| 1.3.2 整合子的结构 | 第18-19页 |
| 1.3.3 整合子的分类 | 第19-21页 |
| 1.4 基因盒 | 第21-27页 |
| 1.4.1 基因盒的结构 | 第21-22页 |
| 1.4.2 基因盒的种类 | 第22-24页 |
| 1.4.3 基因盒的来源 | 第24-25页 |
| 1.4.4 基因盒的移动和表达 | 第25-27页 |
| 1.5 泛宿主质粒 | 第27-28页 |
| 1.5.1 泛宿主质粒的概念 | 第27页 |
| 1.5.2 不相容性的检测 | 第27页 |
| 1.5.3. Inc群质粒 | 第27-28页 |
| 1.6 整合子的检测方法 | 第28-29页 |
| 1.7 污水处理环境中耐药基因及整合子的研究 | 第29-31页 |
| 1.8 本文涉及的分子生态学研究方法 | 第31-33页 |
| 1.8.1 克隆文库技术 | 第31-33页 |
| 第二章 喹啉降解群落中整合子的研究 | 第33-56页 |
| 2.1 引言 | 第33-34页 |
| 2.2 材料和方法 | 第34-43页 |
| 2.2.1 喹啉反应器反应装置及样品采集 | 第34-35页 |
| 2.2.2 反应器喹啉去除率检测（分光光度法） | 第35页 |
| 2.2.3 生物膜样品的预处理与 DNA 提取 | 第35-37页 |
| 2.2.4 反应器生物膜样品整合子 PCR 分析 | 第37-40页 |
| 2.2.5 转化和构建克隆文库 | 第40-43页 |
| 2.3 结果和分析 | 第43-52页 |
| 2.3.1 反应器的喹啉去除率检测 | 第43-44页 |
| 2.3.2 生物膜样品总 DNA 提取 | 第44-45页 |
| 2.3.3 两种 PCR 扩增体系的比较 | 第45-46页 |
| 2.3.4. First gene cassettes 扩增及纯化结果 | 第46-47页 |
| 2.3.5. Gene cassettes 扩增及纯化结果 | 第47-48页 |
| 2.3.6 序列比对和分析 | 第48-52页 |
| 2.4 讨论 | 第52-55页 |
| 2.4.1 携带耐药基因盒和芳香族污染物降解基因盒的整合子的发现 | 第52-54页 |
| 2.4.2 部分基因盒的功能尚不明确 | 第54页 |
| 2.4.3 运用两对引物进行 PCR 方法构建克隆文库的比较 | 第54-55页 |
| 2.5 本章小结 | 第55-56页 |
| 第三章 喹啉降解微生物群落优势微生物的耐药性测定和质粒谱分析 | 第56-70页 |
| 3.1 引言 | 第56-57页 |
| 3.2 材料和方法 | 第57-61页 |
| 3.2.1 菌株来源 | 第57-58页 |
| 3.2.2 培养基和培养条件 | 第58页 |
| 3.2.3 菌株天然耐药性鉴定 | 第58页 |
| 3.2.4 抗性菌株质粒谱分析 | 第58-59页 |
| 3.2.5 抗性菌株泛宿主性质粒分析 | 第59-60页 |
| 3.2.6 序列比对和分析 | 第60-61页 |
| 3.3 结果和分析 | 第61-66页 |
| 3.3.1 菌株天然耐药性鉴定 | 第61-63页 |
| 3.3.2 抗性菌株质粒谱分析 | 第63-64页 |
| 3.3.3 抗性菌株泛宿主性质粒分析 | 第64-66页 |
| 3.4 讨论 | 第66-69页 |
| 3.4.1 水体环境中耐药基因的主要分布及成因 | 第66页 |
| 3.4.2 从一个几乎不含抗生素选择压力的反应器中发现了菌株耐药性 | 第66-69页 |
| 3.4.3 对耐药菌株的质粒特性研究仍需深入 | 第69页 |
| 3.5 本章小结 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-87页 |
| 附录1 溶液试剂及培养基的配制 | 第87-89页 |
| 附录2 实验中所用的仪器设备 | 第89-90页 |
| 附录3 缩写和全称 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-93页 |
| 攻读硕士学位期间已（待）发表或录用的论文 | 第93页 |
