| 中文摘要 | 第1-14页 |
| ABSTRACT | 第14-17页 |
| 1 前言 | 第17-35页 |
| ·表观遗传学 | 第17页 |
| ·植物DNA 甲基化(DNA METHYLATION)研究进展 | 第17-29页 |
| ·DNA 甲基化的分布 | 第18-19页 |
| ·植物DNA 甲基化作用方式 | 第19页 |
| ·植物DNA 的去甲基化 | 第19-22页 |
| ·DNA 甲基化的生物学意义 | 第22-24页 |
| ·DNA 甲基化与植物生长发育 | 第22-23页 |
| ·DNA 甲基化调节基因表达 | 第23页 |
| ·DNA 甲基化维持基因组稳定性 | 第23-24页 |
| ·DNA 甲基化的水平 | 第24-25页 |
| ·木本植物甲基化的研究 | 第25-27页 |
| ·DNA 甲基化的检测方法 | 第27-29页 |
| ·DNA 甲基化敏感扩增多态性 | 第27-28页 |
| ·高效液相色谱法 | 第28-29页 |
| ·亚硫酸盐测序 | 第29页 |
| ·银杏(GINKGO BILOBA L)研究进展 | 第29页 |
| ·叶籽银杏研究进展 | 第29-33页 |
| ·本研究的目的意义 | 第33-35页 |
| 2 材料与方法 | 第35-60页 |
| ·试验材料 | 第35-37页 |
| ·试验材料的采集 | 第35-36页 |
| ·萌动期叶籽银杏试验材料的采集 | 第35页 |
| ·展叶期叶籽银杏试验材料的采集 | 第35页 |
| ·不同组织叶籽银杏试验材料的采集 | 第35页 |
| ·不同发育时期正常银杏试验材料的采集 | 第35页 |
| ·苏铁、铁线蕨试验材料的采集 | 第35-36页 |
| ·其他材料的准备 | 第36-37页 |
| ·菌株和载体 | 第36页 |
| ·主要仪器 | 第36-37页 |
| ·酶和试剂 | 第37页 |
| ·主要数据库及生物软件 | 第37页 |
| ·试验方法 | 第37-60页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第37-41页 |
| ·改良的CTAB 法提取基因组DNA | 第37-40页 |
| ·采用试剂盒提取基因组DNA | 第40-41页 |
| ·银杏基因组DNA 过柱纯化 | 第41-42页 |
| ·模板DNA 纯度与浓度检测 | 第42页 |
| ·常用试剂的配制 | 第42-44页 |
| ·克隆和测序 | 第44-47页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第44页 |
| ·回收片段加A 尾巴 | 第44-45页 |
| ·连接 | 第45页 |
| ·感受态细胞的制备和转化 | 第45-46页 |
| ·小量质粒DNA 制备 | 第46-47页 |
| ·重组质粒的酶切鉴定和测序 | 第47页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第47-48页 |
| ·SOUTHERN 杂交分析 | 第48-52页 |
| ·银杏基因组DNA 的甲基化MSAP 分析 | 第52-58页 |
| ·DNA 双链的酶切 | 第53-54页 |
| ·基因组DNA 接头的准备 | 第54页 |
| ·基因组DNA 接头的连接 | 第54-55页 |
| ·基因组DNA 的预扩增 | 第55-56页 |
| ·基因组DNA 的选择性扩增 | 第56-57页 |
| ·PAGE 制作与条件筛选 | 第57-58页 |
| ·读带及分析 | 第58页 |
| ·甲基化修饰片段的回收、克隆及测序 | 第58-59页 |
| ·甲基化修饰片段的回收和二次扩增 | 第58页 |
| ·二次扩增修饰片段的纯化 | 第58-59页 |
| ·重组质粒的PCR 鉴定 | 第59页 |
| ·小提质粒后，进行酶切鉴定 | 第59-60页 |
| 3 结果与分析 | 第60-112页 |
| ·银杏全基因组DNA 甲基化水平、模式的研究 | 第60-71页 |
| ·MSAP 技术体系的优化 | 第60-63页 |
| ·酶切体系的优化 | 第60页 |
| ·预扩增体系的优化 | 第60-61页 |
| ·选扩增体系的优化 | 第61-63页 |
| ·银杏基因组DNA 甲基化水平 | 第63-64页 |
| ·DNA 的提取 | 第63页 |
| ·纯度和含量的测定 | 第63-64页 |
| ·银杏基因组DNA 甲基化模式分析 | 第64-71页 |
| ·酶切结果 | 第64-65页 |
| ·预扩增和选扩增结果 | 第65-67页 |
| ·银杏MSAP 扩增图谱构建 | 第67-68页 |
| ·基因组DNA 甲基化修饰水平分析 | 第68-69页 |
| ·修饰位点回收和二次扩增结果 | 第69页 |
| ·修饰位点片段克隆测序结果 | 第69-70页 |
| ·DNA 甲基化修饰位点序列分析 | 第70-71页 |
| ·苏铁、铁线蕨全基因组DNA 甲基化分析 | 第71-76页 |
| ·苏铁、铁线蕨DNA 的提取 | 第71-72页 |
| ·苏铁、铁线蕨DNA 的提取 | 第71-72页 |
| ·苏铁、铁线蕨DNA 纯度和含量的测定 | 第72页 |
| ·酶切结果 | 第72-73页 |
| ·苏铁、铁线蕨基因组DNA 预扩增及选扩增图 | 第73页 |
| ·苏铁、铁线蕨MSAP 扩增图谱构建 | 第73-74页 |
| ·基因组DNA 甲基化修饰水平分析 | 第74-76页 |
| ·叶籽银杏EFRO 发育过程中DNA 甲基化的研究 | 第76-110页 |
| ·叶籽银杏基因组DNA 提取 | 第76-79页 |
| ·萌动期叶籽银杏基因组DNA 提取 | 第76-77页 |
| ·展叶期叶籽银杏基因组DNA 的提取 | 第77-78页 |
| ·雌配子发育期不同组织叶籽银杏基因组DNA 的提取 | 第78-79页 |
| ·叶籽银杏基因组DNA 的甲基化MSAP 分析 | 第79-83页 |
| ·叶籽银杏基因组DNA 甲基化修饰位点的分析 | 第80-81页 |
| ·叶籽银杏MSAP 扩增图谱构建 | 第81-82页 |
| ·叶籽银杏甲基化修饰水平的分析 | 第82-83页 |
| ·萌动期叶籽银杏甲基化水平、模式及位点的差异分析 | 第83-88页 |
| ·萌动期叶籽银杏基因组DNA 的甲基化MSAP 分析 | 第83-84页 |
| ·酶切结果 | 第83页 |
| ·预扩增结果 | 第83-84页 |
| ·萌动期叶籽银杏、银杏DNA 胞嘧啶甲基化的水平 | 第84-85页 |
| ·萌动期叶籽银杏、银杏MSAP 扩增图谱构建 | 第85页 |
| ·萌动期叶籽银杏、银杏在甲基化模式上的差异 | 第85-88页 |
| ·展叶期叶籽银杏甲基化水平、模式及位点的差异分析 | 第88-96页 |
| ·展叶期叶籽银杏基因组DNA 的甲基化MSAP 分析 | 第88-89页 |
| ·酶切结果 | 第89页 |
| ·预扩增结果 | 第89-90页 |
| ·展叶期叶籽银杏、银杏DNA 胞嘧啶甲基化的水平 | 第90-92页 |
| ·展叶期叶籽银杏、银杏MSAP 扩增图谱构建 | 第92页 |
| ·展叶期叶籽银杏、银杏在甲基化模式上的差异 | 第92-96页 |
| ·叶籽银杏不同组织甲基化水平、模式及差异的分析 | 第96-105页 |
| ·叶籽银杏不同组织甲基化MSAP 分析的酶切结果 | 第96-97页 |
| ·预扩增结果 | 第97页 |
| ·叶籽银杏不同组织DNA 胞嘧啶甲基化的水平 | 第97-98页 |
| ·叶籽银杏不同组织MSAP 扩增图谱构建 | 第98-99页 |
| ·叶籽银杏不同组织甲基化模式上的差异 | 第99-105页 |
| ·叶籽银杏不同单株甲基化水平的分析 | 第105-110页 |
| ·叶籽银杏不同单株胞嘧啶甲基化的水平 | 第105-106页 |
| ·叶籽银杏不同单株MSAP 扩增图谱构建 | 第106-107页 |
| ·叶籽银杏不同单株在甲基化模式上的差异 | 第107-110页 |
| ·差异位点回收和二次扩增结果 | 第110-111页 |
| ·差异位点片段克隆测序结果 | 第111页 |
| ·DNA 甲基化差异位点序列分析 | 第111-112页 |
| 4 讨论 | 第112-120页 |
| ·MSAP 技术体系中常见问题与解决方案 | 第112页 |
| ·MSAP 分离银杏、叶籽银杏基因组DNA 甲基化修饰位点的有效性及相对性 | 第112-114页 |
| ·叶籽银杏基因组甲基化模式的变异 | 第114-115页 |
| ·叶籽银杏基因组甲基化组织特异性 | 第115-116页 |
| ·叶籽银杏DNA 甲基化与基因表达 | 第116-117页 |
| ·叶籽银杏甲基化修饰的系统学意义 | 第117-120页 |
| 5 结论 | 第120-122页 |
| ·叶籽银杏DNA 胞嘧啶甲基化修饰水平及MSAP 扩增图谱的构建 | 第120页 |
| ·叶籽银杏EFRO 发育过程中胞嘧啶甲基化具有时空特异性 | 第120页 |
| ·叶籽银杏不同组织DNA 胞嘧啶甲基化模式上的差异变化 | 第120-121页 |
| ·叶籽银杏不同单株DNA 胞嘧啶甲基化差异特点 | 第121页 |
| ·叶籽银杏修饰位点及多态性位点的同源序列功能注释情况 | 第121-122页 |
| 6 参考文献 | 第122-135页 |
| 7 附录 | 第135-141页 |
| 致谢 | 第141-142页 |
| 攻读学位期间发表的主要论文 | 第142-143页 |
| 博士学位论文内容简介及自评 | 第143页 |
