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碳霉素与必特螺旋霉素生物合成调控的研究

中文摘要第7-9页
Abstract第9-10页
第1章 前言第11-20页
    1.1 16元大环内酯的概述第11-12页
    1.2 碳霉素(Carbomycin)的概述第12-14页
    1.3 必特螺旋霉素的研究进展第14-17页
    1.4 链霉菌途径特异性调控第17-20页
        1.4.1 链霉菌次级代谢产物合成基因簇第17-18页
        1.4.2 链霉菌途径特异性调控第18-20页
第2章 实验材料与方法第20-56页
    2.1 实验材料第20-34页
        2.1.1 生物信息学分析工具第20页
        2.1.2 基因第20-21页
        2.1.3 质粒第21-22页
        2.1.4 菌种第22-25页
        2.1.5 引物第25-28页
        2.1.6 试剂第28-30页
        2.1.7 培养基第30-32页
        2.1.8 常用缓冲液第32-33页
        2.1.9 仪器第33-34页
    2.2 实验方法第34-56页
        2.2.1 大肠杆菌感受态细胞的制备第34页
        2.2.2 质粒DNA转化到大肠杆菌第34页
        2.2.3 大肠杆菌质粒DNA小量提取第34-35页
        2.2.4 DNA琼脂糖凝胶电泳和片段回收第35-36页
        2.2.5 PCR反应第36-37页
        2.2.6 DNA限制性酶切及粘性末端的去磷酸化和平滑化第37页
        2.2.7 DNA连接与转化第37页
        2.2.8 链霉菌基因组的提取第37-38页
        2.2.9 链霉菌原生质体的制备、再生及DNA转化原生质体第38-39页
        2.2.10 链霉菌-大肠杆菌间的接合转移第39-40页
        2.2.11 Southern blot杂交和菌落原位杂交第40-43页
        2.2.12 cbmR基因的发现与克隆第43页
        2.2.13 cbmR和acyB2的基因敲除第43-45页
        2.2.14 cbmR和acyB2基因的互补和过表达突变株第45-46页
        2.2.15 耐热链霉菌的发酵和产物检测第46-47页
        2.2.16 耐热链霉菌中碳霉素合成基因簇基因的测序和分析第47页
        2.2.17 RNA提取,RT-qPCR第47-50页
        2.2.18 CbmR和AcyB2蛋白在大肠杆菌中的表达及表达条件的优化第50-53页
        2.2.19 S. lividans TK24转化子的构建第53-54页
        2.2.20 S. lividans TK24转化子对螺旋霉素的体外转化和产物检测第54-56页
第3章 实验结果第56-81页
    3.1 在耐热链霉菌中克隆出一个新基因cbmR第56-58页
    3.2 碳霉素生物合成基因簇的测序和序列分析第58-63页
        3.2.1 内脂环合成和修饰的基因第58页
        3.2.2 糖基侧链合成和连接的相关基因第58-63页
        3.2.3 产物转运分泌相关基因和抗性基因第63页
        3.2.4 调控基因第63页
    3.3 cbmR和acyB2基因的阻断,回复及过表达突变菌株的验证第63-66页
    3.4 chmR对碳霉素生物合成起重要的调控作用第66-68页
    3.5 acyB2对碳霉素生物合成具有正调控作用第68-71页
    3.6 cbmR和acyB2对碳霉素生物合成基因簇中基因的表达起重要的调控作用第71-73页
    3.7 CbmR和AcyB2蛋白的表达第73-76页
        3.7.1 CbmR蛋白的表达第73-74页
        3.7.2 AcyB2蛋白的表达第74-76页
    3.8 各S. lividans TK24转化子对螺旋霉素进行生物转化的影响第76-77页
    3.9 L-亮氨酸对各S. lividans TK24转化子生成ISP的影响第77-80页
    3.10 其它L型氨基酸对S. lividons TK24转化子生成ISP的影响第80-81页
第4章 讨论第81-84页
总结第84-86页
    论文主要结果第84-85页
    论文创新点第85-86页
参考文献第86-93页
英文缩写说明第93-96页
氨基酸缩写第96-97页
附录第97-99页
    论文发表第97-98页
    学术会议第98-99页
致谢第99-100页

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