| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 前言 | 第13-21页 |
| 1.1 海洋微生物多样性的概念 | 第13-14页 |
| 1.2 海洋细菌研究简述 | 第14-18页 |
| 1.2.1 海洋生态系统中细菌的群落结构分布模式及典型类群 | 第14-15页 |
| 1.2.2 海洋细菌群落结构的多样性研究及其发展过程 | 第15-16页 |
| 1.2.3 国内外对于海洋细菌群落结构多样性的研究现状 | 第16页 |
| 1.2.4 海洋微生物的生态功能 | 第16-18页 |
| 1.3 海洋细菌多样性的研究方法 | 第18-19页 |
| 1.3.1 传统的研究方法 | 第18页 |
| 1.3.2 分子生物学方法 | 第18-19页 |
| 1.4 PICRUSt技术及其应用 | 第19-20页 |
| 1.5 本研究目的及其意义 | 第20-21页 |
| 第二章 长江口及邻近海域细菌多样性及其生态功能研究 | 第21-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第22-25页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第22-24页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第24-25页 |
| 2.2 实验结果 | 第25-35页 |
| 2.2.1 海水理化指标和细菌丰度分析 | 第25页 |
| 2.2.2 海水样品中细菌群落的相似性 | 第25-26页 |
| 2.2.3 细菌的多样性分析 | 第26-28页 |
| 2.2.4 细菌群落结构分析 | 第28-30页 |
| 2.2.5 环境因素对细菌群落结构和功能基因的影响 | 第30-32页 |
| 2.2.6 细菌群落功能分析 | 第32-35页 |
| 2.3 讨论 | 第35-40页 |
| 2.3.1 表层海水细菌丰度的相关性分析 | 第35-36页 |
| 2.3.2 长江口及邻近海域细菌多样性及群落结构 | 第36-38页 |
| 2.3.3 细菌结构、功能与环境因子之间的关系 | 第38-39页 |
| 2.3.4 细菌生态功能预测 | 第39-40页 |
| 第三章 东海表层沉积物细菌的多样性和生态功能预测 | 第40-55页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第41-42页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第42页 |
| 3.2 结果 | 第42-51页 |
| 3.2.1 细菌丰富度和多样性 | 第42-44页 |
| 3.2.2 细菌群落组成分析 | 第44-45页 |
| 3.2.3 沉积物样品中细菌群落结构的相似性 | 第45-47页 |
| 3.2.4 预测宏基因组分析 | 第47-50页 |
| 3.2.5 功能与分类学组成之间的关系 | 第50-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-55页 |
| 3.3.1 东海表层沉积物细菌群落结构分析 | 第51-53页 |
| 3.3.2 东海表层沉积物细菌生态功能预测分析 | 第53-55页 |
| 第四章 东海沉积物不同深度的细菌群落结构和功能预测分析 | 第55-70页 |
| 4.1 材料与方法 | 第55-57页 |
| 4.1.1 样品采集 | 第55-56页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第56-57页 |
| 4.2 结果 | 第57-66页 |
| 4.2.1 细菌丰度和多样性与深度的关系 | 第57-59页 |
| 4.2.2 不同深度沉积物样品中细菌群落的相似性 | 第59-60页 |
| 4.2.3 细菌群落结构和深度的关系 | 第60-62页 |
| 4.2.4 不同站点的显著差异性类群 | 第62-63页 |
| 4.2.5 细菌之间的共生关系 | 第63-64页 |
| 4.2.6 不同深度细菌群落的功能分析 | 第64-66页 |
| 4.3 讨论 | 第66-70页 |
| 4.3.1 不同深度细菌丰富度和多样性 | 第66-67页 |
| 4.3.2 不同深度沉积物的细菌群落结构分析 | 第67-68页 |
| 4.3.3 东海沉积物中细菌的共生模式 | 第68页 |
| 4.3.4 不同深度沉积物中细菌功能分析 | 第68-70页 |
| 结论 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第81页 |
