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火炬松萜类合成途径中PT、TPS和P450基因的鉴定与功能分析

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
缩略词表第11-12页
第1章 绪论第12-20页
    1.1 萜类化合物概述第12页
    1.2 萜类化合物的功能与应用第12-13页
    1.3 萜类合成相关酶第13-17页
        1.3.1 MVA途径中各类酶第13-14页
        1.3.2 MEP途径中各类酶第14-15页
        1.3.3 异戊烯转移酶(Prenyltransferase,PT)第15-16页
        1.3.4 萜类合成酶(Terpene synthase,TPS)第16-17页
        1.3.5 细胞色素P450(Cytochrome P450)第17页
    1.4 火炬松及其萜类化合物第17-18页
    1.5 异戊烯转移酶、萜类合成酶与P450的研究进展第18-19页
    1.6 研究目的与意义第19-20页
第2章 研究材料与方法第20-24页
    2.1 数据来源第20页
    2.2 异戊烯转移酶第20-21页
        2.2.1 PT家族基因鉴定第20页
        2.2.2 PT多序列比对与系统进化树的构建第20页
        2.2.3 PT表达谱分析第20-21页
        2.2.4 PT相似性网络分析第21页
    2.3 萜类合成酶第21-23页
        2.3.1 TPS家族基因鉴定及信息分析第21页
        2.3.2 TPS基因结构与结构域的分析第21-22页
        2.3.3 TPS多序列比对与系统进化树的构建第22页
        2.3.4 TPS相似性网络分析第22页
        2.3.5 TPS启动子分析第22页
        2.3.6 Ka/Ks分析第22-23页
    2.4 细胞色素P450第23页
        2.4.1 P450家族基因鉴定第23页
        2.4.2 多序列比对与系统进化树的构建第23页
        2.4.3 P450表达谱分析第23页
    2.5 共表达网络分析第23-24页
第3章 研究结果与分析第24-56页
    3.1 萜类合成相关酶的识别第24-25页
    3.2 异戊烯转移酶第25-30页
        3.2.1 火炬松PT的分类与进化分析第25-27页
        3.2.2 火炬松PT的表达谱分析第27-28页
        3.2.3 基于相似性网络对火炬松PT的功能分析第28-30页
    3.3 萜类合成酶第30-47页
        3.3.1 火炬松TPS基因的识别第30-34页
        3.3.2 火炬松TPS基因的结构分析第34-35页
        3.3.3 火炬松TPS基因的启动子分析第35-37页
        3.3.4 火炬松萜类合成酶Motif分析第37-40页
        3.3.5 火炬松TPS进化分析第40-44页
        3.3.6 火炬松TPS表达谱分析第44-45页
        3.3.7 基于相似性网络预测火炬松TPS功能第45-47页
    3.4 细胞色素P450第47-52页
        3.4.1 火炬松P450命名第47-48页
        3.4.2 火炬松P450进化分析第48-49页
        3.4.3 火炬松P450基因表达谱分析第49-52页
    3.5 基于共表达网络进行PT、P450以及TPS功能相关性分析第52-56页
第4章 讨论与创新之处第56-60页
    4.1 HMGR基因家族第56页
    4.2 异戊烯转移酶的进化分析第56-57页
    4.3 萜类合成酶第57页
    4.4 细胞色素P450第57页
    4.5 基于关联基因推测萜类合成途径中的相关酶的功能第57-60页
第5章 结论与展望第60-62页
参考文献第62-72页
附录第72-74页
致谢第74-76页
攻读硕士学位期间研究成果第76页

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