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岷江百合响应尖孢镰刀菌的基因表达谱分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
图表目录第13-14页
缩略词表第14-15页
第一章 引言第15-26页
    1.1 百合病害概况第15页
    1.2 百合抗病种质资源研究进展第15-16页
    1.3 植物来源的镰刀菌抗性相关基因及抗病作用机理第16-19页
        1.3.1 病程相关蛋白(pathogenesis-related proteins,PRs)第17-18页
        1.3.2 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting protein,PGIP)第18-19页
    1.4 植物抗病基因分离方法应用研究进展第19-21页
        1.4.1 抑制差减杂交(SSH)第19-20页
        1.4.2 cDNA-AFLP第20页
        1.4.3 基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)第20-21页
        1.4.4 基因芯片第21页
    1.5 植物抗生物胁迫相关转录因子研究进展第21-25页
        1.5.1 ERF转录因子第22-23页
        1.5.2 bZIP转录因子第23页
        1.5.3 WRKY类转录因子第23-25页
    1.6 课题研究意义及目的第25-26页
第二章 岷江百合受尖孢镰刀菌侵染过程的SSH cDNA文库构建及分析第26-37页
    2.1 前言第26页
    2.2 材料第26-27页
        2.2.1 植物材料及病原真菌第26页
        2.2.2 试剂第26-27页
        2.2.3 菌株及载体第27页
        2.2.4 培养基及缓冲液配方第27页
    2.3 方法第27-30页
        2.3.1 岷江百合组织培养第27-28页
        2.3.2 病原真菌的活化培养第28页
        2.3.3 病原真菌接种及激素处理第28页
        2.3.4 RNA提取及mRNA分离第28-29页
        2.3.5 SSH cDNA文库构建第29页
        2.3.6 文库插入片段分析第29页
        2.3.7 测序及序列分析第29-30页
    2.4 结果及分析第30-35页
        2.4.1 岷江百合组织培养第30页
        2.4.2 SSH cDNA文库构建及分析第30-32页
        2.4.3 文库插入片段分析结果第32-33页
        2.4.4 序列比对分析及相关功能基因分类第33-35页
    2.5 讨论第35-37页
        2.5.1 高质量RNA对于SSH文库构建的重要性第35-36页
        2.5.2 SSH技术应用于分离植物抗病相关基因的有效性和不足第36-37页
第三章 基因表达谱分析第37-65页
    3.1 前言第37页
    3.2 材料第37页
    3.3 方法第37-39页
        3.3.1 病原菌接种处理及取样第37-38页
        3.3.2 RNA提取第38页
        3.3.3 寡核苷酸芯片制备及靶探针标记第38页
        3.3.4 杂交及信号扫描第38-39页
        3.3.5 数据分析第39页
    3.4 结果及分析第39-62页
        3.4.1 芯片杂交结果总体聚类分析及评价第39-40页
        3.4.2 差异表达基因的筛选及统计分析第40-44页
        3.4.3 差异表达基因的功能注释及分类第44-56页
        3.4.4 部分表达上调基因的表达谱分析第56-62页
    3.5 讨论第62-65页
        3.5.1 百合功能基因组学研究面临的问题第62-63页
        3.5.2 岷江百合抗应尖孢镰刀菌分子机理解析第63-65页
第四章 岷江百合转录因子LrbZIP1的克隆及表达特性分析第65-77页
    4.1 前言第65页
    4.2 材料第65-66页
        4.2.1 植物材料第65页
        4.2.2 试剂第65页
        4.2.3 菌株及载体第65-66页
    4.3 方法第66-69页
        4.3.1 RNA提取及mRNA分离第66页
        4.3.2 5’RACE及3’RACE第66-67页
        4.3.3 全长ORF的克隆第67页
        4.3.4 生物信息学分析第67-68页
        4.3.5 基因的表达分析第68-69页
    4.4 结果及分析第69-75页
        4.4.1 LrbZIP1转录因子全长ORF的克隆第69-70页
        4.4.2 LrbZIP1的生物信息学分析第70-74页
        4.4.3 LrbZIP1基因的表达分析第74-75页
    4.5 讨论第75-77页
第五章 结论及展望第77-79页
致谢第79-80页
参考文献第80-89页
附录A第89-90页
附录B第90-96页

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