| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 引言 | 第11-21页 |
| 1.1 微生物生态学概况 | 第11页 |
| 1.2 微生物基因组学研究进展 | 第11-12页 |
| 1.3 微生物的多样性 | 第12页 |
| 1.4 微生物多样性研究方法 | 第12-15页 |
| 1.4.1 传统研究方法 | 第13-14页 |
| 1.4.2 现代分子生物学研究方法 | 第14-15页 |
| 1.5 刺参养殖业发展现状及其问题 | 第15-18页 |
| 1.5.1 刺参养殖业发展现状 | 第15-16页 |
| 1.5.2 刺参养殖业目前所面临的问题 | 第16-17页 |
| 1.5.3 刺参养殖过程中疾病及微生物的研究 | 第17页 |
| 1.5.4 刺参疾病的治疗方法 | 第17-18页 |
| 1.6 本论文的研究目的、意义和内容 | 第18-21页 |
| 1.6.1 研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 1.6.2 研究内容 | 第19页 |
| 1.6.3 技术路线 | 第19-21页 |
| 2 刺参养殖环境细菌群落种类组成季节变化研究及 DGGE MARKER 的制备 | 第21-49页 |
| 2.1 材料与方法 | 第21-23页 |
| 2.1.1 样品和材料来源 | 第21页 |
| 2.1.2 沉积物中细菌基因组 DNA 的提取与纯化 | 第21-22页 |
| 2.1.3 16S rDNA 的扩增 | 第22页 |
| 2.1.4 克隆，RFLP 和测序 | 第22页 |
| 2.1.5 DGGE 的条件优化 | 第22-23页 |
| 2.1.6 DGGE | 第23页 |
| 2.1.7 DGGE marker 的制备 | 第23页 |
| 2.2 结果 | 第23-48页 |
| 2.2.1 沉积物样品中细菌基因组 DNA 的提取 | 第23-24页 |
| 2.2.2 16S rRNA 的扩增 | 第24页 |
| 2.2.3 克隆 | 第24页 |
| 2.2.4 RFLP | 第24-25页 |
| 2.2.5 刺参养殖池环境细菌群落结构特征 | 第25-42页 |
| 2.2.6 DGGE marker 的制备 | 第42-48页 |
| 2.3 讨论 | 第48-49页 |
| 3 刺参发病前后养殖环境几类细菌数量的变化及其与理化因子关系 | 第49-57页 |
| 3.1 材料和方法 | 第49页 |
| 3.1.1 试验材料来源 | 第49页 |
| 3.1.2 培养计数 | 第49页 |
| 3.2 结果与分析 | 第49-55页 |
| 3.2.1 刺参池塘理化指标的变化 | 第49-51页 |
| 3.2.2 刺参池塘养殖环境中几种重要生理类群细菌的数量变化 | 第51-55页 |
| 3.3 讨论 | 第55-57页 |
| 4 刺参养殖池环境细菌群落对底质改良剂的响应模拟试验 | 第57-67页 |
| 4.1 材料和方法 | 第57-58页 |
| 4.1.1 试验材料来源 | 第57页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第57页 |
| 4.1.3 培养计数 | 第57页 |
| 4.1.4 DNA 的提取 | 第57页 |
| 4.1.5 16S rRNAV3 区扩增 | 第57-58页 |
| 4.1.6 DGGE、克隆、测序、序列分析 | 第58页 |
| 4.2 结果与分析 | 第58-65页 |
| 4.2.1 底泥中不同生理类群细菌的数量变化 | 第58-61页 |
| 4.2.2 DNA 的提取、扩增与纯化 | 第61页 |
| 4.2.3 底泥 DGGE 图谱结果 | 第61-62页 |
| 4.2.4 多样性指数 | 第62页 |
| 4.2.5 聚类分析 | 第62-63页 |
| 4.2.6 相似性分析 | 第63页 |
| 4.2.7 优势细菌 16S rRNA 基因鉴定 | 第63-65页 |
| 4.3 讨论 | 第65-67页 |
| 5 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-75页 |
| 作者简历 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
