| 摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-13页 |
| 1.1.1 农业废弃物堆肥概况 | 第12页 |
| 1.1.2 堆肥中氮素转化的过程 | 第12-13页 |
| 1.2 氮素转化微生物研究现状 | 第13-15页 |
| 1.2.1 氨氧化细菌 | 第13-14页 |
| 1.2.2 厌氧氨氧化细菌 | 第14-15页 |
| 1.3 影响堆肥化的环境因素 | 第15页 |
| 1.4 堆肥微生物分子生物学检测技术 | 第15-17页 |
| 1.4.1 荧光原位杂交技术 | 第16页 |
| 1.4.2 PCR技术 | 第16页 |
| 1.4.3 变性梯度凝胶电泳 | 第16页 |
| 1.4.4 荧光定量PCR | 第16-17页 |
| 1.5 多元分析方法 | 第17页 |
| 1.5.1 排序分析 | 第17页 |
| 1.5.2 冗余分析（RDA） | 第17页 |
| 1.5.3 典范对应分析（CCA） | 第17页 |
| 1.6 研究的目的与意义 | 第17-19页 |
| 1.7 技术路线 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-28页 |
| 2.1 试验材料 | 第20-22页 |
| 2.1.1 堆肥原材料 | 第20页 |
| 2.1.2 取样 | 第20页 |
| 2.1.3 实验试剂与仪器 | 第20-22页 |
| 2.2 试验方法 | 第22-28页 |
| 2.2.1 理化性质 | 第22页 |
| 2.2.2 DNA提取与纯化 | 第22-23页 |
| 2.2.3 PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.2.4 氨氧化细菌的DGGE分析 | 第24-25页 |
| 2.2.5 厌氧氨氧化细菌克隆文库的构建 | 第25-26页 |
| 2.2.6 基因定量分析 | 第26页 |
| 2.2.7 统计分析 | 第26-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-48页 |
| 3.1 理化及生物指标变化 | 第28-31页 |
| 3.1.1 温度变化 | 第28-29页 |
| 3.1.2 p H值变化 | 第29页 |
| 3.1.3 含水率变化 | 第29-30页 |
| 3.1.4 氨态氮及硝态氮的变化 | 第30-31页 |
| 3.1.5 发芽率变化 | 第31页 |
| 3.2 堆肥样品DNA提取与纯化 | 第31-32页 |
| 3.3 厌氧氨氧化菌 16S rRNA克隆文库分析 | 第32-36页 |
| 3.3.1 厌氧氨氧化菌 16S rRNA基因PCR扩增 | 第32页 |
| 3.3.2 DNA纯化 | 第32-33页 |
| 3.3.3 连接转化 | 第33页 |
| 3.3.4 厌氧氨氧化菌 16S rRNA基因克隆文库分析 | 第33-34页 |
| 3.3.5 厌氧氨氧化菌 16S rRNA基因系统发育分析 | 第34-36页 |
| 3.4 氨氧化细菌DGGE分析 | 第36-40页 |
| 3.4.1 氨氧化细菌基因PCR扩增 | 第36页 |
| 3.4.2 氨氧化细菌基因的DGGE及系统发育分析 | 第36-40页 |
| 3.4.3 氨氧化细菌 16SrRNA基因多样性分析 | 第40页 |
| 3.5 堆肥微生物与环境因子相关性的分析 | 第40-43页 |
| 3.5.1 厌氧氨氧化细菌群落结构变化与理化参数相关性分析 | 第40-42页 |
| 3.5.2 AOB群落结构变化与环境因子相关性分析 | 第42-43页 |
| 3.6 基因定量分析 | 第43-48页 |
| 3.6.1 厌氧氨氧化菌 16S rRNA基因定量 | 第43-45页 |
| 3.6.2 氨氧化菌 16S rRNA基因定量 | 第45-48页 |
| 4 讨论 | 第48-51页 |
| 4.1 堆肥中氨氧化菌和厌氧氨氧化菌的多样性分析 | 第48-49页 |
| 4.2 厌氧氨氧化细菌群落结构与环境因子相关性分析 | 第49页 |
| 4.3 AOB群落结构与环境因子相关性分析 | 第49-51页 |
| 5 结论 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第61页 |
