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肾脏阴离子转运相关基因变异与肾结石发病风险的关系研究

摘要第4-6页
abstract第6-7页
引言第13-20页
    0.1 肾结石疾病的诊疗及发病机制第13-14页
    0.2 SLC26A6基因的功能及其在肾脏中的作用第14-15页
    0.3 ANKH基因的功能及在其肾脏中作用第15页
    0.4 单核苷酸多态性(SNP)在肾结石疾病发生过程中发挥的作用第15-17页
    0.5 等位基因特异性PCR扩增技术第17-18页
    0.6 分子动力学模拟第18-19页
    0.7 研究的目的意义第19-20页
第1章 利用生物信息学软件对阴离子转运蛋白SLC26A6基因和ANKH基因中的致病性ns SNP的预测第20-27页
    1.1 引言第20页
    1.2 预测方法第20-21页
        1.2.1 目的基因nsSNP的检索第20页
        1.2.2 生物信息学软件预测目的基因致病nsSNP第20-21页
            1.2.2.1 SIFT软件第21页
            1.2.2.2 PROVEAN软件第21页
            1.2.2.3 PhD-SNP软件第21页
            1.2.2.4 MutPred软件第21页
    1.3 结果与讨论第21-25页
        1.3.1 SLC26A6基因及ANKH基因中nsSNP的检索结果第21-22页
        1.3.2 SLC26A6基因中疾病相关的nsSNP预测结果第22-23页
        1.3.3 ANKH基因中疾病相关的nsSNP预测结果第23-25页
    1.4 结论第25-27页
第2章 预测的SLC26A6基因致病nsSNP在正常人和肾结石患者中的基因定型及相关分析第27-35页
    2.1 实验材料第27-28页
    2.2 实验方法第28-32页
        2.2.1 引物设计第28-29页
        2.2.2 DNA模板的获取第29-30页
        2.2.3 等位基因特异性PCR扩增第30-31页
        2.2.4 PCR产物的琼脂糖凝胶电泳第31页
            2.2.4.1 琼脂糖凝胶制备第31页
            2.2.4.2 琼脂糖凝胶电泳第31页
        2.2.5 连锁不平衡分析第31-32页
    2.3 结果与讨论第32-34页
        2.3.1 人类全基因组DNA的获得与验证第32-33页
        2.3.2 等位基因特异性PCR方法进行基因定型第33-34页
    2.4 结论第34-35页
第3章 预测的ANKH基因致病nsSNP在正常人和肾结石患者中的基因定型及相关分析第35-46页
    3.1 实验材料第35-36页
    3.2 实验方法第36-39页
        3.2.1 引物设计第36-37页
        3.2.2 DNA模板的获取第37页
        3.2.3 等位基因特异性PCR扩增第37-38页
        3.2.4 PCR产物的琼脂糖凝胶电泳第38页
            3.2.4.1 琼脂糖凝胶制备第38页
            3.2.4.2 琼脂糖凝胶电泳第38页
        3.2.5 基因测序第38页
        3.2.6 连锁不平衡分析第38-39页
    3.3 结果与讨论第39-45页
        3.3.1 人类全基因组DNA的获得与验证第39页
        3.3.2 等位基因特异性PCR方法进行基因定型第39-43页
        3.3.3 基因测序方法进行基因定型第43-45页
    3.4 结论第45-46页
第4章 分子动力学方法对SLC26A6基因致病ns SNP rs184187143导致肾结石患病风险增加的分子机制研究第46-51页
    4.1 引言第46-47页
    4.2 实验方法第47-48页
        4.2.1 实验基本数据的获取第47页
        4.2.2 同源建模和分子动力学模拟第47-48页
    4.3 结果与讨论第48-51页
致谢第51-52页
参考文献第52-56页
攻读学位期间发表学术论文及参加科研情况第56-57页

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