| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-25页 |
| 1.1 DNA转座子的分类 | 第11-13页 |
| 1.1.1 剪切-粘贴型DNA转座子 | 第11-12页 |
| 1.1.2 复制粘贴型DNA转座子 | 第12-13页 |
| 1.2 Helitron转座元件 | 第13-22页 |
| 1.2.1 Helitrons的简介 | 第14-15页 |
| 1.2.2 Helitrons的结构和编码特征 | 第15-17页 |
| 1.2.3 Helitrons的全基因组鉴定 | 第17-19页 |
| 1.2.4 Helitrons的转座机制 | 第19-20页 |
| 1.2.5 Helitrons的基因捕获 | 第20-22页 |
| 1.3 明尼苏达被毛孢 | 第22-24页 |
| 1.3.1 明尼苏达被毛孢简介 | 第22-24页 |
| 1.3.2 明尼苏达被毛孢的转座子 | 第24页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第24-25页 |
| 第二章 HmHeli1转座元件的序列及结构特征 | 第25-31页 |
| 2.1 实验数据 | 第25页 |
| 2.2 分析方法 | 第25-26页 |
| 2.2.1 H. minnesotensis中RepHel转座酶的筛选与鉴定 | 第25页 |
| 2.2.2 H. minnesotensis中RepHel转座酶的系统发育分析 | 第25页 |
| 2.2.3 Helitron的末端结构分析 | 第25-26页 |
| 2.2.4 RepHel转座酶的序列及结构特征分析 | 第26页 |
| 2.3 结果 | 第26-29页 |
| 2.3.1 H. minnesotensis包含两类Helitron转座元件 | 第26-27页 |
| 2.3.2 HmHeli1转座元件的近期扩张 | 第27页 |
| 2.3.3 HmHeli1属于Helitron2类别的转座元件 | 第27-28页 |
| 2.3.4 HmHeli1编码的转座酶的序列特征 | 第28-29页 |
| 2.4 讨论 | 第29-31页 |
| 第三章 HmHeli1元件的从头预测 | 第31-35页 |
| 3.1 实验数据 | 第31页 |
| 3.2 方法 | 第31-32页 |
| 3.2.1 基于序列结构特征从头预测基因组中的HmHeli1元件 | 第31页 |
| 3.2.2 预测HmHeli1元件的验证 | 第31-32页 |
| 3.3 结果 | 第32-34页 |
| 3.3.1 基因组中自主和非自主的HmHeli1元件 | 第32-33页 |
| 3.3.2 部分HmHeli1元件含有多个 5′末端 | 第33-34页 |
| 3.4 讨论 | 第34-35页 |
| 第四章 HmHeli1插入位点与基因捕获能力分析 | 第35-39页 |
| 4.1 数据 | 第35页 |
| 4.2 方法 | 第35页 |
| 4.2.1 HmHeli1插入位点分析 | 第35页 |
| 4.2.2 HmHeli1捕获基因情况分析 | 第35页 |
| 4.3 结果 | 第35-38页 |
| 4.3.1 HmHeli1插入位点的偏好性 | 第35-36页 |
| 4.3.2 HmHeli1转座对功能基因的影响 | 第36-38页 |
| 4.3.3 HmHeli1不具备主动捕获基因的能力 | 第38页 |
| 4.4 讨论 | 第38-39页 |
| 第五章 真菌中自主的HmHeli1元件 | 第39-45页 |
| 5.1 数据 | 第39页 |
| 5.2 方法 | 第39-40页 |
| 5.2.1 真菌中RepHel蛋白的聚类分析 | 第39页 |
| 5.2.2 Cluster1转座酶的系统发育分析 | 第39页 |
| 5.2.3 HmHeli1元件通过水平转移在不同物种间迁移 | 第39-40页 |
| 5.3 结果 | 第40-43页 |
| 5.3.1 真菌中RepHel蛋白可以分为8类 | 第40-42页 |
| 5.3.2 HmHeli1元件主要存在于肉座菌目 | 第42页 |
| 5.3.3 HmHeli1元件的水平转移 | 第42-43页 |
| 5.4 讨论 | 第43-45页 |
| 第六章 讨论与结论 | 第45-48页 |
| 6.1 讨论 | 第45-46页 |
| 6.2 结论 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-57页 |
| 附录 | 第57-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 作者简介 | 第76页 |
