| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 缩略语表 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-19页 |
| 1.1 分子谱系地理学的研究进展 | 第11-15页 |
| 1.1.1 分子谱系地理学简介 | 第11页 |
| 1.1.2 分子谱系地理学研究及相关理论 | 第11-13页 |
| 1.1.3 分子谱系地理学研究中的分子标记 | 第13-14页 |
| 1.1.3.1 电泳技术和P CR技术为核心的分子标记 | 第13-14页 |
| 1.1.3.2 以DNA直接测序技术为核心的分子标记 | 第14页 |
| 1.1.4 植物亲缘地理学的应用 | 第14-15页 |
| 1.2 半日花属的研究进展 | 第15-17页 |
| 1.2.1 半日花形态学研究 | 第15页 |
| 1.2.2 半日花生态学研究 | 第15页 |
| 1.2.3 半日花生理学研究 | 第15-16页 |
| 1.2.4 半日花繁殖技术研究 | 第16页 |
| 1.2.5 半日花分子生物学方面研究 | 第16-17页 |
| 1.3 研究目的意义及技术路线 | 第17-19页 |
| 1.3.1 研究目的意义 | 第17页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第17-19页 |
| 2 材料和方法 | 第19-27页 |
| 2.1 材料 | 第19-21页 |
| 2.1.1 实验材料采集 | 第19-21页 |
| 2.1.2 实验试剂与实验设备 | 第21页 |
| 2.2 方法 | 第21-24页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取方法 | 第21-22页 |
| 2.2.2 引物的筛选 | 第22-24页 |
| 2.2.3 PCR扩增程序及PCR产物测序 | 第24页 |
| 2.2.4 序列的比对 | 第24页 |
| 2.3 数据分析 | 第24-27页 |
| 2.3.1 遗传多样性计算 | 第25页 |
| 2.3.2 群体遗传结构分析 | 第25页 |
| 2.3.3 种群历史动态 | 第25-26页 |
| 2.3.4 系统发育和网状分支分析 | 第26页 |
| 2.3.5 支系分化时间估计 | 第26-27页 |
| 3 结果分析 | 第27-45页 |
| 3.1 Trnc-ycf6序列分析 | 第27-32页 |
| 3.1.1 遗传多样性 | 第27-28页 |
| 3.1.2 群体遗传结构分析 | 第28-29页 |
| 3.1.3 种群扩张历史分析 | 第29页 |
| 3.1.4 单倍型系统发育与谱系地理学分析 | 第29-31页 |
| 3.1.5 分化时间估算 | 第31-32页 |
| 3.2 Psbj-petA序列分析 | 第32-38页 |
| 3.2.1 遗传多样性分析 | 第32-34页 |
| 3.2.2 群体遗传结构分析 | 第34页 |
| 3.2.3 种群扩张历史分析 | 第34-35页 |
| 3.2.4 单倍型系统发育与谱系地理学分析 | 第35-37页 |
| 3.2.5 分化时间估算 | 第37-38页 |
| 3.3 2个cpDNA序列联合分析 | 第38-45页 |
| 3.3.1 遗传多样性分析 | 第38-40页 |
| 3.3.2 群体遗传结构分析 | 第40页 |
| 3.3.3 种群扩张历史分析 | 第40-41页 |
| 3.3.4 单倍型系统发育与谱系地理学分析 | 第41-43页 |
| 3.3.5 分化时间估算 | 第43-45页 |
| 4 讨论 | 第45-48页 |
| 4.1 遗传多样性和遗传结构分析 | 第45-46页 |
| 4.2 谱系地理学及种群动态历史分析 | 第46页 |
| 4.3 半日花种群保护措施 | 第46-48页 |
| 5 结论 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 作者简介 | 第57页 |