| 目录 | 第1-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一部分 文献综述 | 第11-27页 |
| 1 C4 光合作用 | 第11-13页 |
| 2. C3、C4 植物以及 CAM 植物的光合作用机制比较 | 第13-14页 |
| 3. C4 光合作用的进化 | 第14-18页 |
| ·C4 植物进化的原始动力 | 第14-15页 |
| ·低浓度 CO_2 | 第14-15页 |
| ·盐渍化、高温以及干旱 | 第15页 |
| ·C4 途径消除 Rubisco 的加氧反应 | 第15页 |
| ·C4 植物的进化历程 | 第15-17页 |
| ·C4 植物的分子进化 | 第17-18页 |
| ·PEPC | 第17页 |
| ·NADP-ME | 第17-18页 |
| ·PPDK | 第18页 |
| ·Rubisco | 第18页 |
| 4. 单细胞 C4 和黑藻 | 第18-21页 |
| ·黑藻中单细胞 C4 的转化 | 第19-20页 |
| ·黑藻中单细胞 C4 光合作用的过程 | 第20-21页 |
| 5 流式细胞技术在植物 DNA 含量测定中的应用 | 第21-22页 |
| ·流式细胞仪的结构 | 第21页 |
| ·流式细胞技术的原理 | 第21-22页 |
| ·利用流式细胞技术检测植物 DNA 含量 | 第22页 |
| 6. δ13C 稳定碳同位素的测定 | 第22-23页 |
| 7 RNA-Seq 技术的应用 | 第23-25页 |
| 8 本实验的意义 | 第25-27页 |
| 第二部分 实验论文 | 第27-65页 |
| 第一章 黑藻 C4 光合作用诱导的分子机制 | 第27-60页 |
| 1. 实验材料和仪器 | 第27-29页 |
| ·实验材料及培养条件 | 第27页 |
| ·实验仪器以及器材 | 第27-28页 |
| ·化学试剂 | 第28页 |
| ·Hoagland 配方 | 第28-29页 |
| ·引物 | 第29页 |
| ·生物信息学分析网站以及分析软件 | 第29页 |
| 2. 实验方法 | 第29-38页 |
| ·CTAB 法提取植物基因组 DNA | 第29-30页 |
| ·Trizol 法提取植物 RNA | 第30页 |
| ·FAST QUANT cDNA（with gDNA）反转录试剂盒 | 第30-31页 |
| ·RT-PCR | 第31-32页 |
| ·半定量 PCR | 第32-33页 |
| ·酶活的测定 | 第33-35页 |
| ·PEPC 酶活测定预实验所用药品配方 | 第33-34页 |
| ·蛋白提取液的配制 | 第34页 |
| ·酶活测定液的配制 | 第34-35页 |
| ·酶活的测定方法 | 第35页 |
| ·RNA-Seq 样品制备 | 第35-38页 |
| ·QIAGEN 试剂盒提取 RNA 步骤 | 第35-36页 |
| ·QIAGEN 试剂盒纯化 RNA | 第36页 |
| ·RNA 样品质量要求 | 第36-37页 |
| ·测序数据的处理 | 第37-38页 |
| 3. 实验结果与分析 | 第38-45页 |
| ·黑藻培养体系 | 第38-39页 |
| ·培养基质的准备 | 第38-39页 |
| ·培养条件 | 第39页 |
| ·黑藻低 CO2 的处理 | 第39-40页 |
| ·黑藻 C4 的鉴定 | 第40-43页 |
| ·酶活的测定 | 第40-41页 |
| ·PCR 验证 | 第41-42页 |
| ·半定量 PCR 结果 | 第42页 |
| ·δ13C 的检测 | 第42-43页 |
| ·RNA-Seq 样品的准备 | 第43-45页 |
| ·RNA-Seq 数据的分析 | 第45页 |
| 4. RNA-seq 结果及分析 | 第45-58页 |
| ·差异表达基因的分析 | 第46页 |
| ·测序的 GO 分析 | 第46-47页 |
| ·光合作用关键酶的分析 | 第47-50页 |
| ·光呼吸关键酶的分析 | 第50-53页 |
| ·KEGG 分析 | 第53-54页 |
| ·差异表达的编码转录因子的基因 | 第54-56页 |
| ·黑藻低 CO2_应答基因 | 第56-58页 |
| 5 讨论 | 第58-60页 |
| 第二章 基于流式细胞技术分析的黑藻 DNA 含量 | 第60-65页 |
| 1. 实验材料和仪器 | 第60页 |
| ·实验材料及培养条件 | 第60页 |
| ·实验仪器以及器材 | 第60页 |
| 2. 实验方法 | 第60-62页 |
| ·解离液的配制 | 第60-61页 |
| ·PI 染色液配方 | 第61页 |
| ·细胞悬浊液的制备 | 第61页 |
| ·细胞荧光染色 | 第61-62页 |
| ·流式细胞仪检测 | 第62页 |
| 3.实验结果及分析 | 第62-63页 |
| 4.讨论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-74页 |
| 致谢 | 第74页 |