| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·计算分子生物学概论 | 第10-11页 |
| ·DNA、RNA及蛋白质的结构研究 | 第11-13页 |
| ·DNA分子 | 第11-12页 |
| ·RNA分子 | 第12-13页 |
| ·蛋白质分子 | 第13页 |
| ·生物序列比较方法研究概况 | 第13-14页 |
| ·序列比对方法 | 第14页 |
| ·非序列比对方法 | 第14页 |
| ·本文主要工作 | 第14-16页 |
| 第二章 基于扩展Burrows-Wheeler算法重构禽流感病毒的进化树 | 第16-29页 |
| ·引言 | 第16-17页 |
| ·扩展Burrows-Wheeler算法基本原理 | 第17-19页 |
| ·Burrows-Wheeler算法基本原理 | 第17页 |
| ·扩展Burrows-Wheeler算法基本原理 | 第17-18页 |
| ·Burrows-Wheeler相似性分布 | 第18-19页 |
| ·构建进化树 | 第19-28页 |
| ·80种H5NI禽流感病毒的相似性分析 | 第19-23页 |
| ·对80种H5NI禽流感病毒序列构建进化树 | 第23-28页 |
| ·总结 | 第28-29页 |
| 第三章 基于Burrows-Wheeler算法的蛋白质序列相似性比较 | 第29-37页 |
| ·引言 | 第29页 |
| ·数据集 | 第29-31页 |
| ·比较方法 | 第31-32页 |
| ·蛋白质序列相似性比较 | 第32-34页 |
| ·对13个β—珠蛋白质序列的相似性分析 | 第32页 |
| ·构建13个β—珠蛋白质序列的进化树 | 第32-34页 |
| ·对24个脊椎动物的转铁蛋白序列的相似性分析 | 第34-36页 |
| ·对24个脊椎动物的转铁蛋白序列的相似性分析 | 第34-35页 |
| ·构建24个脊椎动物的转铁蛋白序列进化树 | 第35-36页 |
| ·本章小结 | 第36-37页 |
| 结论 | 第37-38页 |
| 本文总结 | 第37页 |
| 未来展望 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-41页 |
| 附录A 算法中处理数据的matlab程序 | 第41-48页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49页 |