基于二级结构甲型H1N1流感病毒的进化分析
| 提要 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| ·进化分析的背景介绍 | 第11-12页 |
| ·国内外现状 | 第12-13页 |
| ·本文的主要研究工作 | 第13-14页 |
| ·论文的框架结构 | 第14-15页 |
| ·本章小结 | 第15-16页 |
| 第2章 甲型H1N1病毒和构建进化树概述 | 第16-23页 |
| ·甲型H1N1病毒 | 第16-17页 |
| ·进化树的构建方法 | 第17-21页 |
| ·距离法 | 第17-19页 |
| ·最大简约法 | 第19-20页 |
| ·最大似然法(maximum likehood) | 第20-21页 |
| ·进化树几种构建方法比较 | 第21-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 点括替代算法的思想和实现 | 第23-36页 |
| ·RNA的二级结构的点括表示 | 第23-25页 |
| ·圆点括号法定义 | 第24-25页 |
| ·点括号法转化结构序列 | 第25-27页 |
| ·结构特征序列模型 | 第27-31页 |
| ·结构特征序列描述 | 第28-31页 |
| ·RNA二级结构的预测算法 | 第31-34页 |
| ·比较序列分析方法 | 第31-32页 |
| ·动态规划算法 | 第32-33页 |
| ·对RNA结构预测算法的评价 | 第33-34页 |
| ·结构预测与进化分析 | 第34-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 第4章 结构进化树的构建和结果分析 | 第36-49页 |
| ·甲型H1N1病毒数据收集 | 第36-40页 |
| ·多序列比对对构建进化树的意义 | 第40-46页 |
| ·用比对软件进行对序列比对 | 第40-42页 |
| ·构建序列的进化树 | 第42-46页 |
| ·基于结构构建进化树 | 第46-47页 |
| ·BARCODE条形码与进化树的结果对照 | 第47-48页 |
| ·实验结果分析 | 第48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第5章 结论 | 第49-50页 |
| ·总结 | 第49页 |
| ·展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 作者简介 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
