细胞色素P450中配体进出通道和协同效应的研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 第1章 细胞色素P450配体通道的研究进展 | 第9-20页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·主要的计算机模拟方法 | 第10-12页 |
| ·拉伸分子动力学 | 第10-11页 |
| ·随机退出分子动力学 | 第11页 |
| ·晶体热力学因子法 | 第11-12页 |
| ·MOLE和CAVER计算法 | 第12页 |
| ·其它方法 | 第12页 |
| ·六类P450酶中的配体通道 | 第12-18页 |
| ·P450cam中的通道 | 第12-13页 |
| ·P450BM-3中的通道 | 第13-14页 |
| ·P450 2B1中的通道 | 第14-15页 |
| ·P450 2C5中的通道 | 第15-16页 |
| ·P450 3A4中的通道 | 第16-17页 |
| ·P450 2A6中的通道 | 第17-18页 |
| ·总结与展望 | 第18-19页 |
| ·论文的总体安排 | 第19-20页 |
| 第2章 CYP2E1中配体离去通道的研究 | 第20-30页 |
| ·引言 | 第20-21页 |
| ·材料与方法 | 第21-23页 |
| ·CYP2E1晶体结构中的通道 | 第21-22页 |
| ·分子动力学模拟 | 第22页 |
| ·随机退出动力学模拟 | 第22-23页 |
| ·拉伸动力学模拟 | 第23页 |
| ·平均力势计算 | 第23页 |
| ·结果与讨论 | 第23-29页 |
| ·CYP2E1晶体结构中的通道 | 第23-24页 |
| ·RAMD模拟实验结果 | 第24-25页 |
| ·SMD模拟实验结果 | 第25-26页 |
| ·通道2c中配体的解离过程 | 第26-27页 |
| ·通道2a中配体的解离过程 | 第27-28页 |
| ·PMF分析 | 第28-29页 |
| ·通道2a与2c的门控机制 | 第29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 CYP2C9中协同效应的研究 | 第30-43页 |
| ·引言 | 第30-31页 |
| ·协同效应概述 | 第30页 |
| ·细胞色素P450中的协同效应 | 第30-31页 |
| ·材料与方法 | 第31-33页 |
| ·蛋白分子的准备 | 第31-32页 |
| ·小分子配体的准备 | 第32页 |
| ·分子对接 | 第32页 |
| ·分子动力学模拟 | 第32页 |
| ·结合自由能计算 | 第32-33页 |
| ·结合自由能分解 | 第33页 |
| ·结果与讨论 | 第33-41页 |
| ·分子对接结果分析 | 第33-37页 |
| ·分子动力学模拟结果分析 | 第37-38页 |
| ·结合自由能组分分析 | 第38-40页 |
| ·结合自由能分解 | 第40-41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 第4章 全文总结与展望 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-52页 |
| 研究生期间发表的论文 | 第52-53页 |
| 致谢 | 第53页 |
