| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| 1 体细胞突变和肿瘤发生 | 第10-12页 |
| ·体细胞突变 | 第10-11页 |
| ·体细胞突变对肿瘤发生的影响 | 第11-12页 |
| 2 高通量测序技术 | 第12-18页 |
| ·测序技术的发展 | 第12-13页 |
| ·二代测序技术基本原理和对比 | 第13-15页 |
| ·外显子组测序技术及其应用 | 第15-18页 |
| 3 肿瘤基因组研究 | 第18-21页 |
| 第二章 Ⅱ型神经纤维瘤病的外显子组研究 | 第21-38页 |
| 1 引言 | 第21-24页 |
| ·Ⅱ型神经纤维瘤病的研究背景 | 第21页 |
| ·Ⅱ型神经纤维瘤病的研究进展 | 第21-23页 |
| ·研究目的和技术路线 | 第23-24页 |
| 2 材料和方法 | 第24-27页 |
| ·样本采集 | 第24页 |
| ·DNA提取 | 第24-25页 |
| ·PCR扩增分析 | 第25页 |
| ·克隆测序 | 第25页 |
| ·外显子组测序 | 第25-26页 |
| ·测序数据分析和验证 | 第26-27页 |
| 3 研究结果和分析 | 第27-35页 |
| ·NF2基因外显子扩增定位致病突变位点 | 第27-28页 |
| ·克隆测序量化突变位点在不同组织中的比率 | 第28-29页 |
| ·外显子组测序结果概况 | 第29-30页 |
| ·NF2基因组编码区域测序结果验证突变位点 | 第30-31页 |
| ·患者家系外显子组区域突变率具有明显差异 | 第31-33页 |
| ·De novo突变分析发现患者ORAI3基因存在一个错义突变 | 第33-34页 |
| ·定位人群稀有纯合位点 | 第34-35页 |
| 4 结论 | 第35页 |
| 5 讨论 | 第35-38页 |
| ·ORAI3对DNA修复系统及肿瘤发生的影响 | 第35-36页 |
| ·低频突变的定位和验证 | 第36页 |
| ·低频突变率的统计和对比 | 第36-38页 |
| 第三章 脊索瘤的外显子组研究 | 第38-50页 |
| 1 引言 | 第38-40页 |
| ·脊索瘤研究背景 | 第38页 |
| ·脊索瘤研究进展 | 第38-39页 |
| ·研究目的和技术路线 | 第39-40页 |
| 2 材料和方法 | 第40-42页 |
| ·样本采集和DNA提取 | 第40页 |
| ·复发肿瘤样本的全基因组扩增 | 第40-41页 |
| ·全基因组SNP分型和数据分析 | 第41页 |
| ·外显子组测序和分析 | 第41页 |
| ·等位基因型不平衡性检测 | 第41-42页 |
| ·候选位点验证 | 第42页 |
| 3 研究结果和分析 | 第42-48页 |
| ·SNP芯片分型结果分析 | 第42-43页 |
| ·外显子组测序结果分析 | 第43-48页 |
| 4 结论 | 第48-49页 |
| 5 讨论 | 第49-50页 |
| ·脊索瘤特有突变的检测 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 附录 | 第54-56页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第56页 |