| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第一章 综述 | 第12-22页 |
| 引言 | 第12-13页 |
| 1 SNP 的特点及其检测方法 | 第13-18页 |
| ·SNP 的特点 | 第13页 |
| ·SNP 的检测方法 | 第13-18页 |
| 2 SNP 在水产动物遗传育种中的应用 | 第18-21页 |
| ·高密度遗传连锁图谱构建 | 第18-19页 |
| ·性状关联分析 | 第19-20页 |
| ·群体遗传多样性研究及亲缘关系鉴定 | 第20-21页 |
| 3 本研究的目的及意义 | 第21-22页 |
| 第二章 中国对虾多态性 SNP 位点开发 | 第22-41页 |
| 1 实验材料 | 第22-23页 |
| ·实验样品 | 第22页 |
| ·主要试剂 | 第22-23页 |
| ·主要仪器设备 | 第23页 |
| 2 实验方法 | 第23-26页 |
| ·基因组 DNA 提取 | 第23-24页 |
| ·基因组 DNA 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第24页 |
| ·基因组 DNA 浓度测定 | 第24页 |
| ·人工感染方法 | 第24页 |
| ·引物设计 | 第24页 |
| ·PCR 扩增 | 第24-25页 |
| ·探针设计 | 第25页 |
| ·HRM 检测 | 第25-26页 |
| ·数据分析 | 第26页 |
| 3 实验结果 | 第26-39页 |
| ·基因组 DNA 提取情况 | 第26页 |
| ·引物筛选 | 第26-27页 |
| ·探针筛选 | 第27-34页 |
| ·SNP 位点多态性分析 | 第34-37页 |
| ·SNP 位点基因功能预测 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-41页 |
| 第三章 中国对虾抗 WSSV 相关 SNP 位点的筛选及关联分析 | 第41-59页 |
| 1 材料与方法 | 第41-42页 |
| ·实验材料 | 第41-42页 |
| ·HRM 基因分型检测 | 第42页 |
| ·数据统计与分析 | 第42页 |
| 2 结果 | 第42-56页 |
| ·两群体 SNP 位点的遗传多态性分析 | 第42-49页 |
| ·抗病性状的关联分析 | 第49-55页 |
| ·抗病相关 SNP 位点功能预测 | 第55-56页 |
| 3 讨论 | 第56-59页 |
| ·群体多态性分析 | 第56页 |
| ·抗病相关基因功能预测 | 第56-59页 |
| 第四章 中国对虾 SNP 类型特征及分布特点 | 第59-64页 |
| 1 材料与方法 | 第59页 |
| ·实验材料 | 第59页 |
| ·实验方法 | 第59页 |
| 2 结果 | 第59-62页 |
| ·454 测序结果 | 第59-60页 |
| ·引物筛选结果 | 第60页 |
| ·碱基突变类型 | 第60-61页 |
| ·突变位点碱基组成 | 第61页 |
| ·突变位点相邻碱基组分与转换偏差 | 第61-62页 |
| 3 讨论 | 第62-64页 |
| 第五章 中国对虾抗病相关基因克隆及表达分析 | 第64-81页 |
| 1 实验材料 | 第64-65页 |
| ·材料 | 第64页 |
| ·主要试剂 | 第64-65页 |
| 2 实验方法 | 第65-70页 |
| ·总 RNA 提取 | 第65页 |
| ·引物设计 | 第65页 |
| ·3’‐RACE | 第65-67页 |
| ·5’‐RACE | 第67-69页 |
| ·克隆及测序 | 第69-70页 |
| ·全长序列分析 | 第70页 |
| ·基因的时空表达分析 | 第70页 |
| 3 结果 | 第70-78页 |
| ·中国对虾总 RNA 提取结果 | 第70-71页 |
| ·中国对虾醛缩酶基因的克隆 | 第71页 |
| ·中国对虾醛缩酶基因全长 cDNA 序列特征 | 第71-73页 |
| ·中国对虾醛缩酶基因编码蛋白的生物信息学分析 | 第73-76页 |
| ·中国对虾醛缩酶基因与其它物种的同源比对及系统进化树分析 | 第76-77页 |
| ·中国对虾醛缩酶基因不同组织、时间表达情况分析 | 第77-78页 |
| 4 讨论 | 第78-81页 |
| 参考文献 | 第81-90页 |
| 致谢 | 第90页 |