蛋白质结构预测中基于原子对距离分布的统计势研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 引言 | 第9-11页 |
| 第一章 蛋白质结构预测概述 | 第11-22页 |
| §1.1 基于模板的蛋白质结构预测 | 第11-16页 |
| ·模板搜索和选取 | 第12-13页 |
| ·目标蛋白和模板比对 | 第13-14页 |
| ·建立结构骨架 | 第14-15页 |
| ·侧链和环区构建 | 第15-16页 |
| §1.2 无模板的蛋白质结构预测 | 第16-20页 |
| ·基于物理的能量函数 | 第16-18页 |
| ·基于知识的能量函数 | 第18-20页 |
| §1.3 预测方法的评估 | 第20页 |
| §1.4 本文的内容安排 | 第20-22页 |
| 第二章 基于原子对距离分布的统计势 | 第22-33页 |
| §2.1 基于原子对距离分布的统计势简介 | 第22-24页 |
| §2.2 统计势中的可调项目 | 第24-25页 |
| §2.3 参考态假设 | 第25-31页 |
| ·取平均参考态 | 第26-27页 |
| ·准化学近似参考态 | 第27页 |
| ·有限理想气体参考态 | 第27-28页 |
| ·球域无相互作用参考态 | 第28-30页 |
| ·原子洗牌参考态 | 第30页 |
| ·无规行走链参考态 | 第30-31页 |
| §2.4 小结 | 第31-33页 |
| 第三章 各参考态下统计势的性能比较 | 第33-52页 |
| §3.1 构建基于不同参考态的统计势 | 第33-36页 |
| §3.2 统计势性能评估方法 | 第36-38页 |
| §3.3 统计势应用于各类构象集 | 第38-50页 |
| §3.4 小结 | 第50-52页 |
| 总结与展望 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
