| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第10-11页 |
| 目录 | 第11-13页 |
| 图目录 | 第13-14页 |
| 表目录 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-19页 |
| ·本文的研究背景和国内外的研究现状 | 第15-17页 |
| ·猪链球菌的研究 | 第15页 |
| ·小蛋白的研究 | 第15-16页 |
| ·猪链球菌比较基因组学分析 | 第16-17页 |
| ·本文研究的目的和意义 | 第17页 |
| ·本文的主要研究工作和结构 | 第17-19页 |
| 第二章 猪链球菌同源蛋白聚类和功能分析 | 第19-33页 |
| ·研究背景 | 第19-20页 |
| ·材料和方法 | 第20-24页 |
| ·猪链球菌基因组数据 | 第20页 |
| ·COG功能分类数据库 | 第20-21页 |
| ·Inparanoid和Multiparanoid | 第21页 |
| ·数据处理流程 | 第21-24页 |
| ·结果分析 | 第24-30页 |
| ·蛋白COG功能分类注释结果 | 第24页 |
| ·所有蛋白同源聚类的保守度分析 | 第24-25页 |
| ·小蛋白同源聚类的保守度分布分析 | 第25-26页 |
| ·所有蛋白功能注释和保守度的关系 | 第26-27页 |
| ·小蛋白功能注释和保守度的关系 | 第27-28页 |
| ·猪链球菌标准株05ZYH33的蛋白同源性分析 | 第28-30页 |
| ·小结 | 第30-33页 |
| 第三章 猪链球菌蛋白演化分析 | 第33-49页 |
| ·研究背景 | 第33-34页 |
| ·材料和方法 | 第34-38页 |
| ·原核生物基因组数据 | 第34页 |
| ·软件工具介绍 | 第34-35页 |
| ·数据处理流程 | 第35-38页 |
| ·结果分析 | 第38-46页 |
| ·标准株05ZYH33的蛋白演化规律分析 | 第38-39页 |
| ·蛋白共存在关系分析 | 第39-41页 |
| ·系统发生树分析 | 第41-46页 |
| ·小结 | 第46-49页 |
| 第四章 总结与讨论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-61页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第61页 |