| 缩写词 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 前言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-20页 |
| 1 烟草青枯病、TMV、PVY 概况 | 第13-17页 |
| ·烟草青枯病、TMV、PVY 的发生及危害 | 第13页 |
| ·烟草青枯病、TMV、PVY 的病源 | 第13-14页 |
| ·烟草青枯病菌 | 第13-14页 |
| ·烟草花叶病毒 | 第14页 |
| ·马铃薯 Y 病毒 | 第14页 |
| ·烟草青枯病、TMV、PVY 抗性研究 | 第14-16页 |
| ·烟草青枯病、TMV、PVY 的抗性鉴定 | 第14-15页 |
| ·苗期室内鉴定 | 第14页 |
| ·田间鉴定 | 第14-15页 |
| ·分子标记在烟草研究中的应用 | 第15页 |
| ·烟草青枯病、TMV、PVY 的抗性分子标记研究 | 第15-16页 |
| ·烟草青枯病、TMV、PVY 的抗性遗传 | 第16页 |
| ·烟草青枯病、病毒病的防治 | 第16-17页 |
| ·抗病育种 | 第16-17页 |
| ·化学防治 | 第17页 |
| ·生物防治 | 第17页 |
| ·农业防治 | 第17页 |
| 2 DNA 标记技术 | 第17-19页 |
| 3 下一代测序技术 | 第19-20页 |
| 第二章 利用深度测序技术定位烟草 TMV、PVY 抗性基因 | 第20-39页 |
| 材料与方法 | 第20-28页 |
| 1 材料 | 第20-21页 |
| ·植物材料 | 第20页 |
| ·常用分子生物学试剂 | 第20-21页 |
| 2 制备均一化 cDNA 文库 | 第21-24页 |
| ·植物材料 RNA 的获得 | 第21页 |
| ·试剂盒方法提取植物材料 RNA | 第21页 |
| ·Trizol 法提取植物材料 RNA | 第21页 |
| ·DNA 消化 | 第21页 |
| ·建立 RNA 池 | 第21-22页 |
| ·SMART 反转录 RNA 池 | 第22页 |
| ·LD PCR 扩增 cDNA | 第22-23页 |
| ·均一化 cDNA | 第23-24页 |
| ·纯化 cDNA | 第23页 |
| ·cDNA 沉淀和溶解 | 第23页 |
| ·均一化 cDNA | 第23-24页 |
| 3 烟草 cDNA 深度测序 | 第24页 |
| 4 深度测序数据的生物信息学分析 | 第24-28页 |
| ·de novo 拼接策略 | 第24-25页 |
| ·读段比对 | 第25页 |
| ·鉴定抗性相关 SNP | 第25-26页 |
| ·计算相关 SNP 的偏离系数 | 第26页 |
| ·相关 SNP 在番茄和马铃薯基因组上定位 | 第26-28页 |
| 结果与分析 | 第28-38页 |
| 1 制备的 cDNA 文库 | 第28-31页 |
| ·RNA 电泳检测结果 | 第28页 |
| ·RNA 池 | 第28-29页 |
| ·各 RNA 池 OD 值的检测结果 | 第29页 |
| ·电泳检测 RNA 反转录成 cDNA 结果 | 第29页 |
| ·PCR 纯化后 OD 值的检测结果 | 第29-30页 |
| ·cDNA 均一化结果 | 第30-31页 |
| 2 深度测序数据分析 | 第31-38页 |
| ·烟草 cDNA 深度测序的 de novo 拼接结果 | 第31页 |
| ·读段定位结果分析 | 第31-33页 |
| ·抗性相关 SNP 鉴定结果 | 第33-34页 |
| ·TMV 相关 SNP 鉴定结果 | 第33页 |
| ·PVY 相关 SNP 鉴定结果 | 第33-34页 |
| ·抗性相关 SNP 在番茄和马铃薯基因组中的定位 | 第34-38页 |
| ·TMV 相关 SNP 定位结果 | 第34-36页 |
| ·PVY 相关 SNP 定位结果 | 第36-38页 |
| 讨论 | 第38-39页 |
| 第三章 烟草 SSR 连锁图谱加密及青枯病抗性 QTL 定位 | 第39-54页 |
| 材料与方法 | 第39-42页 |
| 1 材料 | 第39页 |
| ·植物材料 | 第39页 |
| ·常用分子生物学试剂 | 第39页 |
| 2 烟草基因组 DNA 的提取 | 第39-40页 |
| 3 连锁图谱的构建 | 第40页 |
| ·SSR 标记来源 | 第40页 |
| ·抗、感亲本间多态性 SSR 标记筛选 | 第40页 |
| ·PCR 扩增 | 第40页 |
| ·非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析 | 第40页 |
| ·作图群体的 SSR 标记分析 | 第40页 |
| ·数据记录与处理 | 第40页 |
| ·图谱构建 | 第40页 |
| 4 烟草青枯病抗性 QTL 定位 | 第40-42页 |
| ·病圃种植 | 第40-41页 |
| ·病情调查及病指分析 | 第41页 |
| ·病情调查方法 | 第41页 |
| ·病情指数的计算和分析 | 第41页 |
| ·烟草青枯病抗性 QTL 定位 | 第41-42页 |
| 结果与分析 | 第42-52页 |
| 1 亲本间 SSR 标记的多态性 | 第42页 |
| 2 烟草 SSR 连锁图谱 | 第42-44页 |
| 3 烟草青枯病的病情指数分析结果 | 第44-47页 |
| ·正态分布检验结果 | 第44-47页 |
| ·病情指数的相关性分析结果 | 第47页 |
| 4 烟草青枯病抗性 QTL 定位结果 | 第47-52页 |
| 讨论 | 第52-54页 |
| 全文总结 | 第54-55页 |
| 本研究创新点 | 第55-56页 |
| 下一步工作计划 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 附录 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
