白草花叶病毒种群遗传结构分析
| 缩略词表 | 第1-7页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| 中文摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 1 前言 | 第14-25页 |
| ·玉米矮花叶病的发生与危害 | 第14-15页 |
| ·MDM的病原 | 第15-17页 |
| ·白草花叶病毒的研究 | 第17-20页 |
| ·白草花叶病毒的生物学特性 | 第17-18页 |
| ·PenMV的分子生物学特性 | 第18-20页 |
| ·植物病毒的遗传变异 | 第20-21页 |
| ·突变 | 第20页 |
| ·重组 | 第20-21页 |
| ·重排 | 第21页 |
| ·植物RNA病毒群体遗传分析方法 | 第21-24页 |
| ·序列比对 | 第21-22页 |
| ·系统发育关系分析 | 第22页 |
| ·中性假说 | 第22-23页 |
| ·选择压力分析 | 第22-23页 |
| ·中性检测 | 第23页 |
| ·遗传分化和基因流 | 第23-24页 |
| ·核苷酸的错配分布 | 第24页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 2 材料和方法 | 第25-37页 |
| ·材料 | 第25-26页 |
| ·病毒样品 | 第25页 |
| ·菌株和载体 | 第25页 |
| ·分子生物学试剂和玉米品种 | 第25页 |
| ·主要实验仪器 | 第25页 |
| ·引物合成 | 第25-26页 |
| ·方法 | 第26-37页 |
| ·实验所需试剂及配制 | 第26页 |
| ·植物总RNA的提取 | 第26-27页 |
| ·引物设计 | 第27页 |
| ·反转录聚合酶链式反应(RT-PCR) | 第27-29页 |
| ·反转录 | 第27-28页 |
| ·聚合酶链式反应(PCR扩增) | 第28-29页 |
| ·PCR产物回收 | 第29页 |
| ·连接反应 | 第29-30页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞DH5α的制备 | 第30页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞DH5α的转化 | 第30-31页 |
| ·质粒DNA的提取 | 第31页 |
| ·重组质粒鉴定 | 第31-32页 |
| ·重组质粒电泳 | 第31-32页 |
| ·重组质粒PCR鉴定 | 第32页 |
| ·5'-RACE扩增 | 第32-35页 |
| ·植物总RNA的提取 | 第32-33页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第33页 |
| ·DNA-RNA杂合体中RNA的降解 | 第33-34页 |
| ·cDNA的纯化 | 第34页 |
| ·5'加尾反应和纯化 | 第34页 |
| ·第一次PCR扩增 | 第34页 |
| ·Nested-PCR扩增 | 第34-35页 |
| ·序列测定与分析 | 第35-37页 |
| ·序列测定与拼接 | 第35页 |
| ·序列一致率比对 | 第35页 |
| ·重组分析 | 第35-36页 |
| ·系统发育关系分析 | 第36页 |
| ·选择压力分析 | 第36页 |
| ·种群统计分析 | 第36-37页 |
| ·接种 | 第37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-55页 |
| ·RT-PCR检测结果 | 第37-38页 |
| ·基因组的扩增 | 第38页 |
| ·序列特征与推定的蛋白酶水解位点 | 第38-41页 |
| ·PenMV分离物序列一致率 | 第41-42页 |
| ·重组 | 第42-45页 |
| ·系统发育关系 | 第45-48页 |
| ·遗传距离和选择压力 | 第48-51页 |
| ·基因流和遗传分化 | 第51页 |
| ·种群中性检测和多态性 | 第51-54页 |
| ·不同玉米品种抗病性 | 第54-55页 |
| 4 讨论 | 第55-57页 |
| 5 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文 | 第67页 |
