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植物病原真菌与昆虫病原真菌侵染寄主表皮的分子机制研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-18页
缩略词第18-19页
1 绪论第19-59页
   ·引言第19-21页
   ·稻瘟病菌侵染机理研究进展第21-46页
     ·稻瘟病菌的侵染循环第21-23页
     ·稻瘟病菌附着胞的形成第23-25页
     ·稻瘟病菌附着胞发育相关的代谢途径第25-29页
     ·细胞周期调控稻瘟病菌附着胞的发育第29-31页
     ·细胞自噬对稻瘟病菌附着胞发育的影响第31-33页
     ·信号传导途径在稻瘟病菌发育过程中的作用第33-46页
   ·绿僵菌侵染机理研究进展第46-59页
     ·绿僵菌侵染寄主昆虫的过程第46-47页
     ·绿僵菌附着胞的形成第47-50页
     ·绿僵菌对寄主体壁的穿透机制第50-55页
     ·绿僵菌对寄主血淋巴的适应机制第55-59页
2 稻瘟病菌 MoVAC8 和 MoTSC13 的基因功能研究第59-121页
   ·研究背景第59-60页
   ·研究内容与技术路线第60-62页
     ·研究内容第60-61页
     ·技术路线第61-62页
   ·材料与方法第62-90页
     ·供试菌株第62页
     ·主要仪器设备第62页
     ·主要试剂、培养基及溶液配制第62-65页
     ·稻瘟病菌的培养第65-66页
     ·稻瘟病菌原生质体的制备与转化第66-67页
     ·大肠杆菌化学感受态细胞的制备和转化第67-68页
     ·质粒的提取第68-69页
     ·酵母同源重组介导的载体构建第69-73页
     ·Split-Marker 方法敲除稻瘟病菌基因 MoVAC8、MoTSC13 及 MoATG4第73-75页
     ·CTAB 法提取稻瘟病菌基因组 DNA第75-76页
     ·稻瘟病菌总 RNA 的提取第76页
     ·基因组 DNA southern 杂交第76-78页
     ·稻瘟病菌菌落生长及产孢量的测定第78页
     ·MoVAC8:GFP 融合表达载体的构建第78-80页
     ·MoTSC13:GFP 融合表达载体的构建第80页
     ·MoVAC8SH4:GFP 融合表达载体的构建第80-81页
     ·MoVAC8:GFP 融合表达载体的基因定点突变第81-82页
     ·附着胞的诱导与观察第82页
     ·附着胞膨胀压的测定第82-83页
     ·穿透钉的观察第83页
     ·稻瘟病菌致病能力的分析第83-84页
     ·稻瘟病菌液泡膜和囊泡膜的 FM4-64 染色观察第84页
     ·稻瘟病菌细胞核的 DAPI 染色观察和细胞壁的 CFW 染色观察第84页
     ·稻瘟病菌细胞核的荧光蛋白标记第84-85页
     ·荧光显微镜观察荧光标记第85页
     ·RT-PCR 扩增 MoVAC8 和 MoTSC13 cDNA 序列第85-87页
     ·酵母功能互补载体 pYES2-MoVAC8 和 pYES2-MoTSC13 的构建第87-88页
     ·MoVAC8:yEGFP 和 MoTSC13:yEGFP 融合表达载体的构建第88-89页
     ·酵母转化子的表型分析第89页
     ·酵母液泡膜、囊泡膜的 FM4-64 染色观察和细胞核的 DAPI 染色观察第89-90页
   ·结果和分析第90-119页
     ·MoVAC8 和 MoTSC13 蛋白结构分析第90-94页
     ·MoVAC8 和 MoTSC13 蛋白的细胞定位及时空表达特征第94-97页
     ·MoVAC8 和 MoTSC13 基因在酵母细胞中的表达与功能分析第97-101页
     ·MoVAC8:GFP 和 MoTSC13:GFP 表达菌株的细胞核荧光观察第101-102页
     ·MoVAC8 和 MoTSC13 基因缺失突变体的构建第102-104页
     ·野生型稻瘟病菌、突变体⊿Movac8 和⊿Motsc13 的细胞核荧光观察第104-107页
     ·突变体⊿Movac8 和⊿Motsc13 的表型分析第107-110页
     ·MoVAC8 N 末端 SH4 结构域的功能分析第110-116页
     ·突变体⊿Moatg1 和⊿Moatg4 的细胞核荧光观察第116-118页
     ·⊿Moatg1 突变体细胞液泡和内质网的荧光观察第118-119页
   ·讨论第119-121页
     ·VAC8 和 TSC13 基因在不同物种中的功能分化第119-120页
     ·稻瘟病菌细胞核等细胞器的降解依赖于非选择性细胞自噬第120-121页
3 稻瘟病菌 MoTOR2 基因在细胞自噬过程中的功能研究第121-185页
   ·研究背景第121-123页
   ·研究内容与技术路线第123-125页
     ·研究内容第123-124页
     ·技术路线第124-125页
   ·材料与方法第125-137页
     ·供试菌株第125页
     ·主要试剂、培养基及溶液配制第125页
     ·LD-PCR 扩增稻瘟病菌 MoTOR2 全长基因第125-126页
     ·RACE 扩增 MoTOR2 cDNA 序列第126页
     ·启动子融合表达载体 Ptor2:GFP 的构建第126-127页
     ·MoTOR2 基因表达水平的定量 PCR 分析第127-128页
     ·雷帕霉素处理稻瘟病菌第128页
     ·稻瘟病菌胞内糖原和脂滴的染色观察第128-129页
     ·自噬体的荧光观察第129页
     ·MoCYC1:RFP 融合表达菌株的构建第129-130页
     ·MoTOR2 基因 RNAi 干扰菌株的构建第130-131页
     ·RNAi 干扰菌株中 MoTOR2 基因表达水平的定量 PCR 分析第131页
     ·附着胞发育阶段细胞自噬性凋亡的定量测定第131-132页
     ·RNAi 干扰菌株毒力的测定第132页
     ·酵母互补载体 p425GPD-MoLST8 及 p425GPD-yEGFP:MoLST8 的构建第132页
     ·MoLST8 互补载体在酵母细胞中的表达第132-133页
     ·MoTOR2 和 MoLST8 附着胞特异性超表达菌株的构建第133-135页
     ·超表达菌株中 MoTOR2 和 MoLST8 基因表达水平的定量 PCR 分析第135页
     ·超表达菌株的表型分析第135页
     ·Split-Marker 方法敲除稻瘟病菌的 MoFKBP12 基因第135页
     ·酵母双杂交载体的构建第135-136页
     ·酵母双杂交报告基因表达的检测第136-137页
   ·结果和分析第137-179页
     ·MoTOR2 编码蛋白的同源性分析第137-140页
     ·MoTOR2 基因的时空表达分析第140-141页
     ·MoFKBP12 基因缺失突变体的构建与功能分析第141-148页
     ·MoFKBP12 蛋白与 MoTOR2 蛋白 FRB 结构域之间的相互作用第148-150页
     ·雷帕霉素对稻瘟病菌营养菌丝生长的影响第150-152页
     ·雷帕霉素对稻瘟病菌附着胞形成的影响第152页
     ·雷帕霉素对稻瘟病菌附着胞发育阶段营养物质动员的影响第152-155页
     ·雷帕霉素对稻瘟病菌附着胞发育阶段细胞周期的影响第155-159页
     ·雷帕霉素对稻瘟病菌附着胞发育阶段细胞自噬的影响第159-161页
     ·MoTOR2 基因 RNAi 干扰菌株的构建第161-164页
     ·RNAi 干扰菌株中 MoTOR2 基因表达水平的定量 PCR 分析第164-166页
     ·MoTOR2 基因的 RNAi 干扰对稻瘟病菌生长发育的影响第166-170页
     ·MoLST8 基因在酵母细胞中的功能同源性分析第170-172页
     ·附着胞特异的 MoLST8 及 MoTOR2 超表达菌株的构建第172-175页
     ·超表达菌株中 MoLST8 和 MoTOR2 基因表达水平的定量 PCR 分析第175-176页
     ·MoLST8 及 MoTOR2 的超表达对侵染相关细胞自噬的影响第176-179页
   ·讨论第179-185页
     ·雷帕霉素与 MoFKBP12 蛋白形成复合体后结合至 MoTOR2 蛋白第179页
     ·MoTOR2 基因调控稻瘟病菌的营养生长与侵染相关的生理过程第179-182页
     ·MoTOR2 基因调控侵染相关的自噬和孢子细胞的自噬性凋亡第182-185页
4 稻瘟病菌 MoATG1 基因在细胞自噬过程中的功能研究第185-211页
   ·研究背景第185-188页
   ·研究内容与技术路线第188-189页
     ·研究内容第188页
     ·技术路线第188-189页
   ·材料与方法第189-195页
     ·供试菌株第189页
     ·GFP:MoATG1 融合表达载体的构建第189-190页
     ·mRFP:MoATG8 融合表达载体的构建第190-191页
     ·H1:GFP 融合表达载体的构建第191-192页
     ·MoATG1 基因定点突变载体的构建第192-195页
     ·自噬体、细胞核及液泡在 MoATG1 基因定点突变体中的荧光观察第195页
   ·结果和分析第195-209页
     ·GFP:MoATG1 融合蛋白的细胞定位及附着胞发育阶段的变化第195-199页
     ·MoATG1 基因定点突变体的构建第199-203页
     ·MoATG1 蛋白的激酶活性对稻瘟病菌自噬及致病性的影响第203-209页
   ·讨论第209-211页
5 绿僵菌侵染寄主体表阶段全长均一化 cDNA 文库的构建与分析第211-241页
   ·研究背景第211-213页
   ·研究内容和技术路线第213-215页
     ·研究内容第213-214页
     ·技术路线第214-215页
   ·材料与方法第215-228页
     ·供试菌株及昆虫第215页
     ·主要仪器设备第215页
     ·主要试剂、培养基及溶液配制第215-217页
     ·绿僵菌培养及分生孢子悬浮液的制备第217页
     ·东亚飞蝗后翅的处理第217页
     ·绿僵菌分生孢子悬浮液接种东亚飞蝗后翅第217页
     ·侵染东亚飞蝗后翅的绿僵菌 mRNA 的提取第217-218页
     ·全长 ds cDNA 的合成第218-219页
     ·ds cDNA 的均一化处理第219-220页
     ·cDNA 片段的酶切和分级分离第220-221页
     ·pDNR-LIB 酶切载体的制备第221-222页
     ·cDNA 与载体 pDNR-LIB 连接第222-223页
     ·大肠杆菌感受态的制备第223-224页
     ·电转化第224页
     ·文库插入序列大小和重组率的分析第224-225页
     ·序列测定与 ESTs 序列分析第225-226页
     ·绿僵菌在基本培养基中的培养及总 RNA 的提取第226页
     ·东亚飞蝗后翅总 RNA 的提取第226页
     ·绿僵菌油剂悬浮液接种东亚飞蝗第226页
     ·东亚飞蝗血淋巴中绿僵菌菌丝体的快速分离及总 RNA 的提取第226-227页
     ·半定量 RT-PCR 分析不同生长条件下绿僵菌的基因表达水平第227-228页
   ·结果和分析第228-238页
     ·cDNA 文库质量分析第228-229页
     ·测序结果分析第229-230页
     ·ESTs 序列功能聚类与分析第230-235页
     ·ESTs 与病原菌-寄主相互作用数据库的比对分析第235-236页
     ·半定量 RT-PCR 结果分析第236-238页
   ·讨论第238-241页
     ·绿僵菌对寄主体表的适应机制第238-239页
     ·表达于蝗虫后翅的 ESTs 反映自然侵染状态下绿僵菌的基因表达第239-241页
6 绿僵菌 MaPLS1 全长基因的克隆与序列分析第241-255页
   ·研究背景第241-243页
   ·研究内容与技术路线第243页
     ·研究内容第243页
     ·技术路线第243页
   ·材料与方法第243-248页
     ·供试菌株第243页
     ·主要试剂、培养基及溶液配制第243-244页
     ·绿僵菌 MaPLS1 基因 cDNA 序列的克隆第244页
     ·绿僵菌基因组 DNA 的提取第244-245页
     ·基因组文库筛选 MaPLS1 克隆第245-247页
     ·Southern blot 杂交分析 MaPLS1 基因拷贝数第247页
     ·序列比对和编码蛋白结构分析第247-248页
     ·进化树的构建第248页
   ·结果与分析第248-253页
     ·绿僵菌 MaPLS1 基因的克隆和序列分析第248-249页
     ·绿僵菌 MaPLS1 的基因组拷贝数分析第249-250页
     ·绿僵菌 MaPLS1 蛋白的结构特征分析第250-252页
     ·MaPLS1 蛋白的进化关系分析第252-253页
   ·讨论第253-255页
7 绿僵菌与稻瘟病菌之间 ESTs 的比较分析第255-269页
   ·研究背景第255页
   ·研究内容和技术路线第255-256页
     ·研究内容第255-256页
     ·技术路线第256页
   ·材料与方法第256页
     ·稻瘟病菌 ESTs 序列的获取第256页
     ·绿僵菌 ESTs 与稻瘟病菌 ESTs 序列的比对分析第256页
   ·结果与分析第256-267页
     ·绿僵菌与稻瘟病菌 ESTs 序列的 Blast 比对分析第256-259页
     ·侵染寄主表皮相关 ESTs 序列的比较第259-262页
     ·绿僵菌自噬相关基因的鉴定第262-265页
     ·绿僵菌潜在毒力因子的鉴定第265-267页
   ·讨论第267-269页
8 全文小结与后续工作建议第269-273页
   ·全文小结第269-270页
   ·本论文创新点第270页
   ·后续工作建议第270-273页
致谢第273-275页
参考文献第275-313页
附录第313-361页
 A 博士期间已发表及拟发表的论文第313-314页
 B 附表第314-361页

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