| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-22页 |
| ·基因组学的定义和历史 | 第13-14页 |
| ·基因组技术在家畜育种中的应用 | 第14-16页 |
| ·动物基因组学的发展 | 第14-15页 |
| ·动物育种的技术和战略 | 第15-16页 |
| ·ANGPTL4 基因研究进展 | 第16-19页 |
| ·ANGPTL4 基因发现和命名 | 第16页 |
| ·ANGPTL4 基因的结构与功能 | 第16-19页 |
| ·GPIHBP1 基因研究进展 | 第19-20页 |
| ·本研究的意义 | 第20-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-26页 |
| ·试验材料 | 第22-23页 |
| ·组织样品的采集 | 第22页 |
| ·用于分子标记的DNA 样品来源 | 第22页 |
| ·主要试剂和药品 | 第22页 |
| ·普通试剂和药品 | 第22-23页 |
| ·仪器设备及来源 | 第23页 |
| ·试验方法 | 第23-25页 |
| ·SNPs 的分型 | 第23页 |
| ·血液 DNA 的提取 | 第23页 |
| ·引物设计 | 第23-24页 |
| ·样品的PCR 扩增 | 第24页 |
| ·PCR 扩增产物的酶切分析 | 第24-25页 |
| ·主要分子生物学数据库及软件 | 第25页 |
| ·数据统计方法 | 第25-26页 |
| ·基因频率和基因型频率的计算 | 第25页 |
| ·基因型频率的x2 独立性检验 | 第25页 |
| ·位点遗传杂合度、纯合度和有效等位基因数的计算 | 第25页 |
| ·多态信息含量计算 | 第25页 |
| ·Hardy-Weinberg 平衡检测 | 第25页 |
| ·SNPs 与经济性状的关联分析统计模型 | 第25-26页 |
| 第三章 黄牛ANGPTL4 基因的生物信息学分析 | 第26-29页 |
| ·ANGPTL4 同源性分析 | 第26页 |
| ·牛ANGPTL4 蛋白质信息分析 | 第26-29页 |
| ·牛ANGPTL4 蛋白的二级结构 | 第26-27页 |
| ·牛ANGPTL4 蛋白跨膜结构的分析 | 第27-29页 |
| 第四章 候选基因SNPS的检测 | 第29-36页 |
| ·牛血液基因组DNA 的检测 | 第29页 |
| ·牛ANGPTL4 基因SNPS 检测 | 第29-36页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测 | 第29页 |
| ·黄牛混合DNA 池测序分析 | 第29-32页 |
| ·候选基因PCR 产物不同基因型序列测定 | 第32-36页 |
| 第五章 ANGPTL4 基因PCR-RFLP 分析 | 第36-41页 |
| ·PCR-RFLP 分析引物设计 | 第36-38页 |
| ·ANGPTL4 基因的PCR-RFLP 检测 | 第38-41页 |
| ·ANGPTL4 基因g. 1422 T> C 突变的MspΙ酶切分析 | 第38页 |
| ·ANGPTL4 基因g.4899C>T 突变的BamHΙ酶切分析 | 第38-39页 |
| ·ANGPTL4 基因g.5095T>A 突变的TaqΙ酶切分析 | 第39页 |
| ·ANGPTL4 基因g. 5200C>T 突变的HindⅢ酶切分析 | 第39-41页 |
| 第六章 ANGPTL4 基因多态位点的群体遗传学分析 | 第41-45页 |
| ·ANGPTL4 基因G.1422T>C 突变位点 | 第41页 |
| ·ANGPTL4 基因4899C>T 突变位点 | 第41-42页 |
| ·ANGPTL4 基因5095T>A 突变位点 | 第42-43页 |
| ·ANGPTL4 基因5200C>T 突变位点 | 第43-45页 |
| 第七章 ANGPTL4 多态性与三个黄牛品种主要生长性状关联分析 | 第45-54页 |
| ·ANGPTL4 基因的1422T>C 多态性与生长性状的关联分析 | 第45-47页 |
| ·南阳牛群体内ANGPTL4 基因1422T>C 突变位点与生长性状相关分析 | 第45-46页 |
| ·郏县红牛群体内ANGPTL4 基因1422T>C 突变位点与生长性状相关分析 | 第46页 |
| ·秦川牛群体内ANGPTL4 基因1422T>C 突变位点与生长性状相关分析 | 第46-47页 |
| ·ANGPTL4 基因的G. 4899C>T 多态性与生长性状的关联分析 | 第47-49页 |
| ·南阳牛群体内ANGPTL4 基因4899C>T 突变位点与生长性状相关分析 | 第47页 |
| ·郏县红牛群体内ANGPTL4 基因4899C>T 突变位点与生长性状相关分析 | 第47-48页 |
| ·秦川牛群体内ANGPTL4 基因4899C>T 突变位点与生长性状相关分析 | 第48-49页 |
| ·ANGPTL4 基因的 g. 5095 T>A 多态性与生长性状的关联分析 | 第49-51页 |
| ·南阳牛群体内ANGPTL4 基因5095 T>A 突变位点与生长性状相关分析 | 第49页 |
| ·郏县红牛群体内ANGPTL4 基因5095 T>A 突变位点与生长性状相关分析 | 第49-50页 |
| ·秦川牛群体内ANGPTL4 基因5095 T>A 突变位点与生长性状相关分析 | 第50-51页 |
| ·ANGPTL4 基因的 g. 5200C>T 多态性与生长性状的关联分析 | 第51-54页 |
| ·南阳牛群体内ANGPTL4 基因5200C>T 突变位点与生长性状相关分析 | 第51-52页 |
| ·郏县红牛群体内ANGPTL4 基因5200C>T 突变位点与生长性状相关分析 | 第52页 |
| ·秦川牛群体内ANGPTL4 基因5200C>T 突变位点与生长性状相关分析 | 第52-54页 |
| 第八章 讨论 | 第54-57页 |
| ·GPIHBP1 基因遗传变异 | 第54页 |
| ·ANGPTL4 基因遗传变异 | 第54页 |
| ·ANGPTL4 基因与黄牛生长性状的关系 | 第54-55页 |
| ·小结 | 第55-56页 |
| ·结论与创新点 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 附录 | 第62-67页 |
| 附录1 黄牛体尺测量的项目与方法. | 第62页 |
| 附录2 DNA 提取所用试剂配方 | 第62-63页 |
| 附录3 琼脂糖凝胶电泳分析所用溶液配方. | 第63页 |
| 附录4 聚丙烯酰胺凝胶电泳分析所用溶液配方. | 第63-64页 |
| 附录5 黄牛全血基因组DNA 提取步骤 | 第64-65页 |
| 附录6 资料的统计与分析 | 第65-67页 |
| 附表 | 第67-69页 |
| 附表1 实验中主要的仪器设备 | 第67-68页 |
| 附表2 PCR 反应体系 | 第68页 |
| 附表3 PCR 反应程序 | 第68页 |
| 附表4 限制性内切酶的酶切体系 | 第68-69页 |
| 缩略词 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 作者简介 | 第71页 |
