大型真菌黑松露EST-SSR信息分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 1 引言 | 第9-21页 |
| ·真菌类生物 | 第9-11页 |
| ·真菌的营养及繁殖 | 第9页 |
| ·真菌的分类及代表植物 | 第9-11页 |
| ·黑松露概述 | 第11页 |
| ·生长环境 | 第11页 |
| ·营养价值 | 第11页 |
| ·分子标记概述 | 第11-14页 |
| ·DNA 分子标记的建立与发展 | 第12页 |
| ·实验室目前常用的分子标记极其特点 | 第12-13页 |
| ·基于分子杂交技术 | 第12页 |
| ·基于 PCR 技术的分子标记技术 | 第12-13页 |
| ·基于限制性酶切和 PCR 技术的 DNA 标记 | 第13页 |
| ·EST 概述 | 第13-14页 |
| ·SSR 分子标记 | 第14-15页 |
| ·SSR 分子标记及特点 | 第14页 |
| ·SSR 的分布及功能 | 第14页 |
| ·SSR 的类型 | 第14页 |
| ·完全型 SSR | 第14页 |
| ·不完全型 SSR | 第14页 |
| ·复合型 SSR | 第14页 |
| ·SSR 标记的开发 | 第14-15页 |
| ·SSR 标记的通用性 | 第15页 |
| ·SSR 标记的局限性 | 第15页 |
| ·EST-SSR 分子标记概述 | 第15-18页 |
| ·EST 的发展 | 第16页 |
| ·EST-SSR 技术 | 第16页 |
| ·EST-SSR 标记的通用性与多态性 | 第16-17页 |
| ·EST-SSR 标记的优点 | 第17页 |
| ·EST-SSR 标记的应用 | 第17页 |
| ·遗传多样性评价 | 第17页 |
| ·种质资源鉴定 | 第17页 |
| ·EST-SSR 存在的问题与展望 | 第17-18页 |
| ·应用生物信息学方法筛选 SSR 标记 | 第18-19页 |
| ·在线直接查找和在线检索工具 | 第18页 |
| ·使用 DNAMan 软件搜索 | 第18页 |
| ·使用已开发出的 SSR 搜索软件进行查找 | 第18-19页 |
| ·SSRHunter | 第18页 |
| ·SSRFinder | 第18-19页 |
| ·现有 EST-SSR 搜索软件的缺点及改进 | 第19页 |
| ·基因本体数据库 GO 概述 | 第19-21页 |
| ·分子功能本体论 | 第19页 |
| ·生物学途径本体论 | 第19页 |
| ·细胞组件本体论 | 第19-20页 |
| ·常使用的 GO 工具 | 第20-21页 |
| ·AmiGO from BDGP | 第20页 |
| ·MGI GO Browser | 第20页 |
| ·QuickGO at EBI | 第20-21页 |
| 2 EST-SSR 信息分析 | 第21-25页 |
| ·研究现状概述 | 第21页 |
| ·websat 本地化 | 第21-22页 |
| ·运行环境的搭建 | 第21页 |
| ·websat 的优化处理策略 | 第21页 |
| ·websat 本地化方法 | 第21-22页 |
| ·核心组件的下载与安装 | 第21页 |
| ·websat 开发环境的配置 | 第21-22页 |
| ·websat 的优化 | 第22页 |
| ·websat 优化后验证 | 第22页 |
| ·材料与方法 | 第22-25页 |
| ·序列来源 | 第22-23页 |
| ·黑松露 EST 序列处理 | 第23页 |
| ·黑松露 EST-SSR 挖掘 | 第23页 |
| ·EST-SSR 重复基元的分析统计 | 第23页 |
| ·EST-SSR 引物设计与筛选 | 第23页 |
| ·黑松露 EST 功能挖掘 | 第23-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-33页 |
| ·黑松露 EST 的碱基信息 | 第25页 |
| ·黑松露 EST-SSR 频率 | 第25-26页 |
| ·黑松露 EST-SSR 特性 | 第26-31页 |
| ·黑松露 EST 功能分析 | 第31页 |
| ·websat 本地化 | 第31-33页 |
| ·websat 页面设计的优化及本地化 | 第31-32页 |
| ·页面 js 脚本的优化 | 第32页 |
| ·php 主程序优化 | 第32-33页 |
| 4 讨论 | 第33-35页 |
| 致谢 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-39页 |
