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苏云金芽胞杆菌菌株YBT-1520基因组中TA系统的研究

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
缩略语表第11-12页
1 前言第12-42页
   ·细菌中的8个TA系统家族第13-27页
     ·F因子上的ccd系统第14-16页
       ·ccd系统的结构第14-15页
       ·ccd系统的毒素靶标和作用机制第15-16页
       ·CcdA与CcdB的比例能够调节TA系统操纵子的转录第16页
     ·大肠杆菌的relBE系统第16-18页
       ·RelE在核糖体A位点切割mRNA第16-17页
       ·relBE系统在细菌应急反应中起作用第17-18页
     ·Rts1质粒上的higBA系统第18-19页
     ·RK2质粒上的parDE系统第19页
     ·Pem(parD)和mazEF(chp)系统第19-25页
       ·MazE/MazF复合体的结构第20页
       ·MazF毒素蛋白的作用机制第20-21页
       ·能够触发mazEF的外界压力第21页
       ·TLD与mazEF系统有关第21-22页
       ·MazEF在细菌中广泛存在第22-24页
       ·MazEF与细菌的多细胞性第24-25页
     ·原噬菌体P1上的TA系统phd/doc第25页
     ·VapBC系统第25-26页
     ·质粒pSM19035上的ω-ε-ζ系统第26页
     ·其它的TA系统第26-27页
       ·限制修饰(RM)Ⅱ性系统第26-27页
       ·大肠杆菌K-12中的hipBA系统第27页
   ·TA系统结构的研究进展第27-32页
     ·TA系统的作用基础第27-28页
     ·TA系统在转录水平被抗毒素蛋白调节第28-29页
     ·毒素蛋白的进化关系第29-32页
   ·TA系统在自由生长的细菌中广泛分布第32-33页
   ·TA系统发挥功能的两个模型第33-34页
     ·简单的被动模型第33-34页
     ·主动控制模型第34页
   ·TA系统的生理学意义第34-36页
     ·TA系统与细菌利他致死机制相关第34-35页
     ·TA系统导致细菌进入生长停滞状态第35-36页
     ·染色体TA系统能够稳定基因转移因子第36页
   ·TA系统在构建新型载体上的应用第36-39页
     ·MazF基因作为反向选择基因第36-37页
     ·基于MazF基因作为反向选择基因的新型载体第37-39页
   ·TA系统总结第39-40页
   ·苏云金芽胞杆菌菌株YBT-1520简介第40页
   ·本研究的目的和意义第40-42页
2 材料与方法第42-49页
   ·实验材料第42-44页
     ·菌株和质粒第42-43页
     ·培养基第43-44页
     ·试剂和仪器第44页
       ·试剂第44页
       ·仪器第44页
   ·实验方法第44-46页
     ·DNA操作第44-45页
       ·苏云金芽胞杆菌质粒的制备第44-45页
       ·大肠杆菌质粒DNA的提取第45页
       ·质粒DNA的纯化第45页
       ·DNA的体外重组操作第45页
     ·重组质粒的转化及转化子的筛选鉴定第45-46页
       ·大肠杆菌的常规转化第45-46页
       ·苏云金芽胞杆菌的电转化第46页
       ·大肠杆菌转化子的筛选第46页
       ·苏云金芽胞杆菌重组菌的筛选第46页
   ·苏云金芽胞杆菌质粒稳定性检测第46-47页
   ·PCR扩增第47-48页
   ·斑点杂交第48页
   ·序列测定和序列分析第48-49页
3 结果与分析第49-84页
   ·菌株YBT-1520质粒pBMB8240上TA系统的研究第49-56页
     ·质粒pBMB8240上TA系统的生物信息学分析第49-50页
     ·pBMB8240上毒素抗毒素基因的克隆第50-51页
     ·pBMB8240上潜在TA系统能够增强质粒稳定性第51-56页
   ·菌株YBT-1520中质粒pBMB7635上TA系统的研究第56-64页
     ·质粒pBMB7635上TA系统的生物信息学分析第56-58页
     ·pBMB7635上毒素抗毒素基因的克隆第58-59页
     ·pBMB7635上潜在的TA系统无法克隆第59-61页
     ·pBMB7635、pBMB9741和pGI1三个质粒序列一致性很高第61-64页
   ·YBT-1520中小质粒pBMB2062的研究第64-68页
     ·质粒pBMB2062上TA系统的生物信息学分析第64-65页
     ·YBT-1520质粒pBMB2062上ORF1的功能分析第65-67页
       ·质粒pBMB2062衍生质粒的构建第65-66页
       ·质粒pBMB2062衍生质粒的稳定性第66-67页
     ·质粒pBMB2062在苏云金芽胞杆菌中的分布调查第67页
     ·质粒pBMB2062与两个相近质粒的比较第67-68页
   ·库斯塔克亚种菌株YBT-1520染色体上TA系统的研究第68-84页
     ·芽胞杆菌染色体上的TA系统第68-72页
     ·TA系统在芽胞杆菌已测序质粒上分布的生物信息学分析第72-75页
     ·YBT-1520染色体上TA系统的生物信息学分析第75-79页
       ·YBT-1520染色体上其它TA系统的生物信息学分析第75-77页
       ·YBT-1520染色体上mazEF系统的生物信息学分析第77-79页
     ·YBT-1520染色体上MazEF系统的敲除实验第79-84页
       ·用PCR方法扩增mazEF及其上下游的序列第79-81页
       ·分别扩增A、B双臂构建出双交换载体第81-84页
4 讨论第84-85页
5 总结第85-88页
参考文献第88-99页
致谢第99-100页
附录文章发表情况第100页

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