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广西棘蛙类的遗传多样性及棘蛙属种组间的系统发育关系

中文摘要第1-5页
英文摘要第5-10页
前言第10-23页
 一、国内棘蛙的分类和系统发育研究概况第10-13页
 二、分子系统学的研究概况第13-15页
 三、本研究中应用到的分子系统学的技术(DNA序列分析)基本原理和特点及分子数据的系统发育分析方法第15-17页
  1 DNA序列分析的基本原理和特点第15页
  2 分子数据的系统发育分析方法第15-17页
   ·距离矩阵法(Distance Methods)第15-16页
   ·最大简约法(Maximum parsimony method,MP)第16页
   ·最大似然法(Maximun likelihood method,ML)第16页
   ·贝叶斯推断(Bayesian Inference)第16-17页
 四、两栖类分子生物学研究的进展第17-22页
  1 有关两栖类细胞学的研究第17-18页
  2 有关两栖类蛋白质学和营养组分的研究第18-19页
  3 线粒体DNA在动物遗传多样性研究中的优势第19-20页
  4 线粒体DNA标记在两栖类研究中的应用第20-22页
   ·线粒体DNA标记在两栖类群体遗传结构中的应用第20-21页
   ·线粒体DNA标记在系统学中的应用第21-22页
   ·线粒体DNA标记在两栖类分子生物地理学中的应用第22页
 五、棘蛙群研究的目的第22-23页
第一章 广西棘蛙类的遗传比较第23-51页
 1. 实验材料第23页
 2. 实验的主要试剂第23页
 3. 主要实验设备第23页
 4. 实验方法第23-26页
   ·基因组DNA 的提取第23-24页
     ·试剂与溶液第23-24页
     ·操作步骤第24页
   ·目标DNA 片段的PCR 扩增第24-26页
     ·目标DNA 及相应的引物第24页
     ·PCR 反应体积和条件第24-25页
     ·PCR产物的检测第25页
     ·PCR产物的回收与纯化第25页
     ·目的片段的测序第25页
     ·序列分析与系统关系的构建第25-26页
 5. 结果与分析第26-46页
   ·实验结果第26-28页
     ·基因组DNA的检测第26页
     ·模板DNAPCR 扩增的检测第26-27页
     ·PCR 产物回收纯化的检测第27-28页
   ·实验数据的分析第28-46页
     ·基于12SrRNA 基因的实验数据分析第28-33页
       ·12SrRNA 基因序列的碱基组成与变异分析第28-30页
       ·基于12SrRNA 基因的系统发育分析关系第30-33页
     ·基于16SrRNA基因的实验数据分析第33-38页
       ·16SrRNA基因序列的碱基组成与变异分析第33-35页
       ·基于16SrRNA 基因的系统发育分析关系第35-38页
     ·基于细胞色素b 基因的实验数据分析第38-46页
       ·Cytb 基因序列的碱基、氨基酸组成与变异分析第38-44页
       ·基于Cytb 基因的系统发育分析关系第44-46页
 6. 讨论第46-50页
   ·基因组DNA的提取第46-47页
   ·目的片段的选择第47页
   ·核苷酸偏好性第47-48页
   ·碱基替换第48页
   ·Cyt b 基因序列密码子的使用及氨基酸组成第48-49页
   ·系统发育分析第49-50页
     ·基于12SrRNA基因片段的系统发育分析第49页
     ·基于16SrRNA 基因片段的系统发育分析第49-50页
     ·基于Cytb 基因片段的系统发育分析第50页
 7. 展望第50-51页
第二章 广西棘蛙类的种组划分及棘蛙属不同种组之间的亲缘关系第51-55页
 1. 序列来源第51页
 2. 系统发育的推断方法第51页
 3. 系统发育关系的分析第51-52页
 4. 讨论第52-55页
   ·棘蛙属蛙类的单源性第52页
   ·棘蛙属物种间的系统发育关系第52-53页
   ·棘蛙属种组间的系统发育关系第53页
   ·广西棘蛙类的分类地位第53-54页
     ·棘胸蛙的分类地位第53-54页
     ·棘腹蛙的分类地位第54页
     ·棘侧蛙的分类地位第54页
   ·选用贝叶斯推断的优越性第54-55页
 5. 结论第55页
第三章 结论第55-56页
参考文献第56-65页
附录第65-77页
致谢第77-78页

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