中文摘要 | 第1-5页 |
英文摘要 | 第5-10页 |
前言 | 第10-23页 |
一、国内棘蛙的分类和系统发育研究概况 | 第10-13页 |
二、分子系统学的研究概况 | 第13-15页 |
三、本研究中应用到的分子系统学的技术(DNA序列分析)基本原理和特点及分子数据的系统发育分析方法 | 第15-17页 |
1 DNA序列分析的基本原理和特点 | 第15页 |
2 分子数据的系统发育分析方法 | 第15-17页 |
·距离矩阵法(Distance Methods) | 第15-16页 |
·最大简约法(Maximum parsimony method,MP) | 第16页 |
·最大似然法(Maximun likelihood method,ML) | 第16页 |
·贝叶斯推断(Bayesian Inference) | 第16-17页 |
四、两栖类分子生物学研究的进展 | 第17-22页 |
1 有关两栖类细胞学的研究 | 第17-18页 |
2 有关两栖类蛋白质学和营养组分的研究 | 第18-19页 |
3 线粒体DNA在动物遗传多样性研究中的优势 | 第19-20页 |
4 线粒体DNA标记在两栖类研究中的应用 | 第20-22页 |
·线粒体DNA标记在两栖类群体遗传结构中的应用 | 第20-21页 |
·线粒体DNA标记在系统学中的应用 | 第21-22页 |
·线粒体DNA标记在两栖类分子生物地理学中的应用 | 第22页 |
五、棘蛙群研究的目的 | 第22-23页 |
第一章 广西棘蛙类的遗传比较 | 第23-51页 |
1. 实验材料 | 第23页 |
2. 实验的主要试剂 | 第23页 |
3. 主要实验设备 | 第23页 |
4. 实验方法 | 第23-26页 |
·基因组DNA 的提取 | 第23-24页 |
·试剂与溶液 | 第23-24页 |
·操作步骤 | 第24页 |
·目标DNA 片段的PCR 扩增 | 第24-26页 |
·目标DNA 及相应的引物 | 第24页 |
·PCR 反应体积和条件 | 第24-25页 |
·PCR产物的检测 | 第25页 |
·PCR产物的回收与纯化 | 第25页 |
·目的片段的测序 | 第25页 |
·序列分析与系统关系的构建 | 第25-26页 |
5. 结果与分析 | 第26-46页 |
·实验结果 | 第26-28页 |
·基因组DNA的检测 | 第26页 |
·模板DNAPCR 扩增的检测 | 第26-27页 |
·PCR 产物回收纯化的检测 | 第27-28页 |
·实验数据的分析 | 第28-46页 |
·基于12SrRNA 基因的实验数据分析 | 第28-33页 |
·12SrRNA 基因序列的碱基组成与变异分析 | 第28-30页 |
·基于12SrRNA 基因的系统发育分析关系 | 第30-33页 |
·基于16SrRNA基因的实验数据分析 | 第33-38页 |
·16SrRNA基因序列的碱基组成与变异分析 | 第33-35页 |
·基于16SrRNA 基因的系统发育分析关系 | 第35-38页 |
·基于细胞色素b 基因的实验数据分析 | 第38-46页 |
·Cytb 基因序列的碱基、氨基酸组成与变异分析 | 第38-44页 |
·基于Cytb 基因的系统发育分析关系 | 第44-46页 |
6. 讨论 | 第46-50页 |
·基因组DNA的提取 | 第46-47页 |
·目的片段的选择 | 第47页 |
·核苷酸偏好性 | 第47-48页 |
·碱基替换 | 第48页 |
·Cyt b 基因序列密码子的使用及氨基酸组成 | 第48-49页 |
·系统发育分析 | 第49-50页 |
·基于12SrRNA基因片段的系统发育分析 | 第49页 |
·基于16SrRNA 基因片段的系统发育分析 | 第49-50页 |
·基于Cytb 基因片段的系统发育分析 | 第50页 |
7. 展望 | 第50-51页 |
第二章 广西棘蛙类的种组划分及棘蛙属不同种组之间的亲缘关系 | 第51-55页 |
1. 序列来源 | 第51页 |
2. 系统发育的推断方法 | 第51页 |
3. 系统发育关系的分析 | 第51-52页 |
4. 讨论 | 第52-55页 |
·棘蛙属蛙类的单源性 | 第52页 |
·棘蛙属物种间的系统发育关系 | 第52-53页 |
·棘蛙属种组间的系统发育关系 | 第53页 |
·广西棘蛙类的分类地位 | 第53-54页 |
·棘胸蛙的分类地位 | 第53-54页 |
·棘腹蛙的分类地位 | 第54页 |
·棘侧蛙的分类地位 | 第54页 |
·选用贝叶斯推断的优越性 | 第54-55页 |
5. 结论 | 第55页 |
第三章 结论 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-65页 |
附录 | 第65-77页 |
致谢 | 第77-78页 |