皱纹盘鲍表达谱基因芯片研制及不同表型家系差异表达基因的初步研究
| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 综述 | 第10-25页 |
| ·鲍的生物学特征以及养殖现状 | 第10-11页 |
| ·皱纹盘鲍的遗传学研究现状 | 第11-12页 |
| ·皱纹盘鲍功能基因的研究现状 | 第12-15页 |
| ·EST 的技术原理和应用 | 第15-21页 |
| ·EST 的定义和技术原理 | 第15-16页 |
| ·EST 技术的应用 | 第16-20页 |
| ·生物信息学在EST 中的应用 | 第20-21页 |
| ·应用基因芯片技术寻找表达差异基因 | 第21-22页 |
| ·其它差异表达基因研究方法 | 第22-25页 |
| ·差异显示和随机引物聚合酶链反应技术 | 第22页 |
| ·cDNA 消减杂交技术 | 第22-23页 |
| ·SAGE 技术 | 第23页 |
| ·SDGE-microarray | 第23-25页 |
| 第二章 皱纹盘鲍cDNA 文库的构建 | 第25-30页 |
| ·材料与方法 | 第25-26页 |
| ·结果 | 第26-29页 |
| ·讨论 | 第29-30页 |
| 第三章 皱纹盘鲍EST生物信息学分析 | 第30-45页 |
| ·材料与方法 | 第30-33页 |
| ·材料 | 第30-31页 |
| ·方法 | 第31-33页 |
| ·cDNA 与载体连接 | 第31页 |
| ·cDNA 序列测定 | 第31-32页 |
| ·序列编辑 | 第32-33页 |
| ·序列同一性分析 | 第33页 |
| ·功能基因注释 | 第33页 |
| ·结果与讨论 | 第33-43页 |
| ·EST 测序结果 | 第33-35页 |
| ·测序概况 | 第33-34页 |
| ·EST 序列长度分布统计 | 第34-35页 |
| ·EST 序列的同一性分析 | 第35页 |
| ·EST 序列末端信息 | 第35页 |
| ·与核酸蛋白数据库 Blast 比对结果 | 第35-43页 |
| ·与核酸数据库 Blast 比对结果 | 第35-37页 |
| ·与蛋白数据库比对结果 | 第37-43页 |
| ·讨论 | 第43-45页 |
| ·EST 的核酸比对结果讨论 | 第43页 |
| ·EST 的蛋白比对结果讨论 | 第43-44页 |
| ·主要功能基因分类 | 第44-45页 |
| 第四章 皱纹盘鲍表达谱芯片的制备 | 第45-56页 |
| ·材料和方法 | 第45-51页 |
| ·基因芯片靶基因EST 序列的扩增 | 第45-46页 |
| ·EST 序列扩增产物的电泳检测 | 第46-47页 |
| ·EST 序列扩增产物的浓度检测 | 第47页 |
| ·EST序列扩增产物电泳检测结果统计 | 第47页 |
| ·EST 序列扩增产物的沉淀纯化 | 第47页 |
| ·纯化产物的溶解以及定量 | 第47-48页 |
| ·纯化产物的转板 | 第48页 |
| ·384 孔板中纯化产物的冷冻抽干 | 第48页 |
| ·384 孔板中纯化产物的溶解 | 第48页 |
| ·阴阳性对照的制备 | 第48-49页 |
| ·皱纹盘鲍表达谱芯片的点制 | 第49-50页 |
| ·芯片点样后处理 | 第50页 |
| ·芯片质量检测 | 第50-51页 |
| ·结果与讨论 | 第51-56页 |
| ·靶基因EST 序列扩增产物浓度 | 第51页 |
| ·靶基因EST 序列扩增产物电泳检测结果 | 第51-54页 |
| ·EST 序列扩增产物沉淀纯化结果 | 第54页 |
| ·芯片质量检测结果 | 第54-56页 |
| 第五章 皱纹盘鲍表达谱芯片杂交结果的初步分析 | 第56-76页 |
| ·材料和方法 | 第57-61页 |
| ·皱纹盘鲍样本的选择 | 第57页 |
| ·总RNA的准备 | 第57-59页 |
| ·总RNA 的提取 | 第57页 |
| ·总 RNA 质量检测 | 第57-58页 |
| ·总RNA样品的纯化 | 第58-59页 |
| ·总RNA样品纯化产物质量检测 | 第59页 |
| ·荧光探针的制备 | 第59页 |
| ·荧光探针的纯化 | 第59-60页 |
| ·荧光探针的定量 | 第60页 |
| ·芯片杂交 | 第60页 |
| ·芯片洗涤 | 第60页 |
| ·芯片扫描及数据读取 | 第60-61页 |
| ·结果 | 第61-70页 |
| ·总RNA 质量检测结果 | 第61-62页 |
| ·荧光探针质量检测结果 | 第62页 |
| ·芯片杂交结果 | 第62-70页 |
| ·芯片杂交扫描结果 | 第62-63页 |
| ·杂交结果中表达差异基因 | 第63-70页 |
| ·讨论 | 第70-76页 |
| ·总RNA 质量电泳检测 | 第70-71页 |
| ·芯片杂交结果讨论 | 第71-76页 |
| ·两组杂交实验结果的比较 | 第71-72页 |
| ·实验结果重复性的讨论 | 第72-73页 |
| ·其它检验芯片质量的方法 | 第73-76页 |
| 第六章 结论 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
