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广西猪瘟病毒扁桃体和流产胎儿来源株E2基因的克隆、测序及遗传学分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-7页
目录第7-11页
第一章 前言第11-28页
   ·病原第11-13页
     ·猪瘟病毒的基本特征第11-12页
     ·猪瘟病毒的遗传变异第12-13页
   ·猪瘟病毒的分子结构第13-19页
     ·基因组构成第13页
     ·基因组功能第13-19页
       ·5′端非编码区第13-14页
       ·3′端非编码区第14-15页
       ·P23蛋白第15页
       ·C蛋白第15页
       ·E0蛋白(E~(ms)蛋白)第15-16页
       ·E1蛋白第16页
       ·E2蛋白第16-18页
       ·P~7蛋白第18页
       ·NS2~3蛋白第18-19页
       ·NS5B蛋白第19页
   ·猪瘟疫苗的研究第19-22页
     ·传统疫苗第19-20页
     ·新型疫苗第20-22页
       ·病毒活载体疫苗第20页
       ·亚单位疫苗第20-21页
       ·标记疫苗第21页
       ·口服疫苗第21页
       ·基因疫苗第21-22页
   ·猪瘟的分子流行病学研究第22-28页
     ·猪瘟病毒基因分群第23-24页
     ·国内流行猪瘟病毒E2基因的抗原变异第24-26页
     ·我国猪瘟流行现状第26-27页
     ·本研究目的意义第27-28页
第二章 材料与方法第28-39页
   ·材料第28-32页
     ·毒株来源第28页
     ·质粒载体第28页
     ·菌种第28页
     ·主要试剂及溶液第28-31页
       ·酶类第28页
       ·培养基第28-29页
       ·琼脂糖电泳缓冲液第29页
       ·电泳胶的制备第29页
       ·制备感受态细胞用试剂第29页
       ·重组质粒抽提溶液第29-30页
       ·其它试剂第30-31页
     ·仪器及其来源第31页
     ·引物第31-32页
   ·方法第32-39页
     ·病毒总RNA的提取第32-33页
     ·反转录第33页
     ·聚合酶链式反应(PCR第33-34页
     ·电泳第34页
     ·PCR产物回收纯化第34-35页
       ·制胶第34页
       ·电泳第34-35页
       ·凝胶块中DNA的回收第35页
     ·PCR纯化产物的加尾第35页
     ·加尾PCR产物的pMD18-T载体克隆第35-36页
     ·制备感受态细胞第36页
     ·连接产物转化DH5α感受态细胞第36页
     ·筛选第36-37页
     ·抽提质粒第37页
     ·质粒的PCR和酶切鉴定第37-38页
       ·PCR鉴定第37页
       ·限制性内切酶切割鉴定第37-38页
     ·测序及遗传学分析第38-39页
第三章 结果与分析第39-61页
   ·采集病料的检测结果第39页
   ·CSFV E2基因的扩增和克隆第39-43页
     ·阳性病料RT-PCR结果第39-40页
     ·E2基因的扩增结果第40-41页
     ·纯化结果第41页
     ·E2基因cDNA的克隆和酶切鉴定第41-42页
     ·重组质粒的PCR鉴定第42-43页
   ·E2基因核苷酸序列的测定与比较第43页
   ·氨基酸序列对比第43-57页
   ·同源性分析第57-59页
   ·遗传树分析第59-61页
第四章 讨论第61-66页
   ·猪瘟流行情况第61页
   ·引物特异性第61-62页
   ·套式PCR第62页
   ·连接和转化第62页
   ·重组质粒内切酶及PCR鉴定第62-63页
   ·序列分析第63-65页
     ·核苷酸序列比较第63页
     ·氨基酸序列比较第63页
     ·主要抗原表位B、C区氨基酸变异第63-64页
     ·抗原表位A、D区氨基酸变异第64页
     ·WH303和4-9D4单抗识别抗原表位的变异情况第64页
     ·E2蛋白中Cys变异情况第64-65页
     ·糖基化位点变异情况第65页
   ·遗传学分析第65-66页
第五章 结论第66-67页
参考文献第67-73页
致谢第73-74页
攻读学位期间发表的学术论文第74页

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