| 第一章 绪论 | 第1-11页 |
| ·生物信息学 | 第7页 |
| ·序列比对意义 | 第7-11页 |
| 第二章 生物信息学的一些基本概念 | 第11-17页 |
| ·核酸和蛋白质 | 第11-12页 |
| ·分子生物学的中心法则 | 第12-13页 |
| ·序列比对分类 | 第13页 |
| ·序列比对的基本原理 | 第13-17页 |
| ·空位罚分 | 第13-14页 |
| ·替换矩阵(Substitution Matrix) | 第14-15页 |
| ·双序列比对基本原理 | 第15-17页 |
| 第三章 多序列比对算法的研究现状 | 第17-25页 |
| ·同步法 | 第17-22页 |
| ·动态规划算法 | 第17-18页 |
| ·Needleman-Wunsch 算法 | 第18-20页 |
| ·Smith-Waterman算法 | 第20-21页 |
| ·多序列的动态规划法 | 第21-22页 |
| ·渐进法 | 第22-23页 |
| ·迭代法 | 第23页 |
| ·模拟退火算法 | 第23页 |
| ·遗传算法 | 第23页 |
| ·现有算法分析 | 第23-25页 |
| 第四章 与NW算法相结合的并行遗传算法 | 第25-48页 |
| ·遗传算法 | 第25-30页 |
| ·遗传算法的描述 | 第25-26页 |
| ·遗传算法的基本实现技术 | 第26-28页 |
| ·遗传算法的特点 | 第28-30页 |
| ·并行遗传算法 | 第30-33页 |
| ·并行算法 | 第30页 |
| ·并行遗传算法的实现方案 | 第30-32页 |
| ·并行遗传算法的参数 | 第32-33页 |
| ·与NW算法相结合的并行遗传算法 | 第33-42页 |
| ·序列比对问题的优化模型 | 第33-34页 |
| ·编码问题 | 第34-35页 |
| ·目标函数(适应值函数) | 第35-36页 |
| ·选择算子 | 第36页 |
| ·交叉操作 | 第36-38页 |
| ·变异算子 | 第38-39页 |
| ·种群初始化 | 第39页 |
| ·算法并行化 | 第39-42页 |
| ·算法的实现 | 第42-46页 |
| ·实验环境 | 第42页 |
| ·实现算法的参数 | 第42页 |
| ·实验结果及其分析 | 第42-46页 |
| ·程序的集成化 | 第46-48页 |
| 第五章 结论与展望 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 发表论文和参加科研情况: | 第54-55页 |
| 附 录 | 第55-57页 |
| 致 谢 | 第57页 |