| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第1章 引言 | 第8-47页 |
| ·概述 | 第8页 |
| ·miRNA基因 | 第8-11页 |
| ·miRNA的发现过程 | 第8-9页 |
| ·miRNA基因的结构特征 | 第9-11页 |
| ·miRNA的生物合成 | 第11-17页 |
| ·miRNA生物发生的基本概况 | 第11-12页 |
| ·miRNA加工的核内过程 | 第12-13页 |
| ·miRNA加工蛋白 | 第13-16页 |
| ·微处理器对pri-miRNA的剪切机制 | 第16页 |
| ·pre-miRNA的细胞核输出 | 第16-17页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第17-19页 |
| ·miRNA指导靶mRNA的切割 | 第17-18页 |
| ·miRNA指导翻译抑制 | 第18页 |
| ·靶分子的识别 | 第18-19页 |
| ·快速脱腺苷酸化 | 第19页 |
| ·miRNA的生物学功能 | 第19-26页 |
| ·miRNA在动物中的作用 | 第19-20页 |
| ·miRNA在植物中的作用 | 第20-21页 |
| ·与人类疾病相关的miRNA | 第21-22页 |
| ·miRNA参与siRNA的合成 | 第22-26页 |
| ·miRNA的界定和命名 | 第26-27页 |
| ·miRNA的界定 | 第26页 |
| ·miRNA的命名 | 第26-27页 |
| ·miRNA的研究方法 | 第27-43页 |
| ·miRNA的实验RNA组学方法 | 第27-32页 |
| ·miRNA的计算机RNA组学方法 | 第32-43页 |
| ·真菌中是否存在miRNA分子 | 第43-45页 |
| ·真菌中存在RNaseⅢ | 第43-44页 |
| ·真菌中存在RNAi作用机制 | 第44-45页 |
| ·本论文的研究目的与意义 | 第45-47页 |
| 第2章 材料与方法 | 第47-59页 |
| ·材料 | 第47-51页 |
| ·相关数据库 | 第47页 |
| ·菌株和培养基 | 第47-48页 |
| ·主要酶和试剂 | 第48页 |
| ·引物设计 | 第48-49页 |
| ·主要仪器和设备 | 第49-51页 |
| ·方法 | 第51-59页 |
| ·miRNA的计算机分析 | 第51-52页 |
| ·miRNA的实验验证 | 第52-59页 |
| 第3章 结果 | 第59-77页 |
| ·酿酒酵母miRNA基因的预测 | 第59-63页 |
| ·酿酒酵母EST库miRNA预测 | 第59-61页 |
| ·运用已知miRNA保守性预测 | 第61-62页 |
| ·运用多基因组比对预测 | 第62-63页 |
| ·酿酒酵母预测miRNA的验证分析 | 第63-74页 |
| ·酿酒酵母总RNA提取结果 | 第63-64页 |
| ·酿酒酵母基因组DNA提取结果 | 第64-65页 |
| ·RT-PCR结果 | 第65-74页 |
| ·miRNA靶序列的预测 | 第74-77页 |
| 第4章 讨论 | 第77-79页 |
| ·计算机RNA组学是鉴定miRNA快速、高效的方法 | 第77页 |
| ·真菌中存在miRNA | 第77-78页 |
| ·miRNA靶序列不能局限于UTR数据 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-88页 |
| 附录A:7种酵母基因组比对中待筛选的类miRNA分子 | 第88-93页 |
| 附录B:酿酒酵母miRNA分子与靶序列匹配度预测 | 第93-99页 |
| 附录C:Multiz基因组比对结果分析程序 | 第99-101页 |
| 附录D:基因组比对RNAz结果分析程序 | 第101-104页 |
| 附录E:缩略词 | 第104-106页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第106页 |