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DNA分子中碱基甲基化及羟基化损伤的理论研究

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第一章 综述第10-24页
 第一部分 DNA 甲基化的研究概况第10-17页
  1 引言第10页
  2 DNA 甲基化的分子生物学研究第10-13页
   ·DNA 甲基化第10-11页
   ·DNA 甲基化水平与相关疾病的研究第11-13页
     ·甲基化诱发疾病第11页
     ·甲基化致癌性质的基因学研究第11-12页
     ·DNA 高甲基化的致癌性第12-13页
     ·DNA 低甲基化的致癌性第13页
  3 DNA 甲基化的药物研究第13页
  4 DNA 甲基化的反应方式第13页
  5 DNA 甲基化反应的量子化学研究概述第13-15页
   ·甲基基团对DNA 结构影响的量子化学研究第13-14页
   ·甲基对碱基对影响的研究第14-15页
   ·5-甲基胞嘧啶的量子化学研究第15页
  参考文献第15-17页
 第二部分 DNA 羟基化综述第17-24页
  引言第17页
  1 自由基的种类和产生第17-18页
  2 羟基自由基与碱基、核苷、核酸的反应产物及其反应机理第18页
  3 羟基自由基对DNA 碱基的损伤第18-20页
   ·羟基自由基对嘌呤的损伤第18-20页
   ·羟基自由基对嘧啶碱基的损伤第20页
  4 有关羟基加合物的研究第20-22页
   ·羟基加合物的实验研究第20-21页
   ·羟基加合物的量子化学研究第21-22页
  参考文献第22-24页
第二章 基本理论简介第24-29页
 1 从头算方法简介第24-26页
   ·量子化学计算中的Schr?dinger 方程第24页
   ·从头算的三个近似和Pauli 原理第24-26页
     ·从头算的三个近似第24-25页
     ·Pauli 原理第25-26页
 2 分子的自洽场计算中的几个问题第26页
 3 B3LYP 方法第26-27页
 4 DZP++基组第27页
 参考文献第27-29页
第三章 O~6-MedG·dC 的电子结构和性质的理论研究第29-44页
   ·引言第29页
   ·计算模型与方法、计算细节第29-31页
     ·计算模型与方法第29-30页
     ·计算细节第30-31页
   ·结果与讨论第31-42页
     ·O~6-MedG·dC 构象的优化结果第31-33页
     ·O~6-MedG·dC 构象的共面性第33-37页
       ·O~6-MedG·dC 的键长和键角第34-35页
       ·鸟嘌呤碱基单体和甲基化且质子化的鸟嘌呤碱基单体的键长比较第35-36页
       ·dG·dC 碱基对和质子化O~6-MedG·dC 碱基对的平面构象中鸟嘌呤分子的键长第36-37页
     ·甲基化dG·dC 碱基对的反应趋势第37-38页
       ·dG·dC 碱基对和甲基化的O~6-MedG·dC 碱基对的碱基配对趋势第37-38页
       ·dG·dC 和鸟嘌呤质子化的O~6-MedG·dC 的碱基配对趋势分析第38页
       ·dG·dC 碱基对和甲基化的鸟嘌呤质子化的胞嘧啶碱基对dG·dC 的碱基配对趋势第38页
     ·O~6-MedG·dC 的NBO 电荷分析第38-39页
     ·分子轨道及其能级第39-42页
   ·结论第42页
 参考文献第42-44页
第四章 羟基胸腺嘧啶脱氧核苷酸加合物的结构和性质的量子化学研究第44-58页
   ·引言第44页
   ·计算模型与方法、计算细节第44-45页
   ·结果和讨论第45-55页
     ·(5'-dTMP 酸+·OH)加合物的几何优化结构第45-48页
     ·(5'-dTMP 酸+ ·OH)加合物的键长和键角第48-50页
       ·C2-OH-dTMP 和C2-OH-dTMP'的键长和键角第48页
       ·加合物 C4-OH-dTMP 、C4-OH-dTMP'、C5-OH-dTMP 、C5-OH-dTMP'、C6-OH-dTMP 、C6-OH-dTMP' 的分子结构第48-50页
     ·(5'-dTMP 酸+·OH)加合物的分子轨道第50-52页
     ·(5'-dTMP 酸+·OH)加合物的稳定性第52-53页
     ·(5'-dTMP 酸+·OH)加合物的NBO 电荷分布第53-54页
     ·(5'-dTMP 酸+·OH)加合物的自旋密度分析第54-55页
   ·结论第55-56页
 参考文献第56-58页
致谢第58-59页

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