| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-25页 |
| 1 姜病毒研究进展 | 第9-10页 |
| 1.1 病毒对植物生长发育的影响 | 第9页 |
| 1.2 引起姜病毒病害的主要病毒 | 第9-10页 |
| 2 植物病毒检测技术研究进展 | 第10-20页 |
| 2.1 生物学测定法 | 第10-11页 |
| 2.2 电子显微镜检测法 | 第11-13页 |
| 2.3 血清学检测法 | 第13页 |
| 2.4 分子生物学检测法 | 第13-16页 |
| 2.5 第二代测序（Next-generation sequencing, NGS）检测法 | 第16-20页 |
| 3 杆状DNA病毒的研究进展 | 第20-24页 |
| 3.1 杆状DNA病毒的发生、分布及危害 | 第20-21页 |
| 3.2 杆状DNA病毒的形态学 | 第21页 |
| 3.3 杆状DNA病毒的分子生物学特性 | 第21-24页 |
| 4 本研究的目的及意义 | 第24-25页 |
| 第二章 小黄姜小RNA深度测序数据分析 | 第25-32页 |
| 1 实验材料与仪器 | 第25页 |
| 1.1 实验材料 | 第25页 |
| 1.2 主要仪器与试剂 | 第25页 |
| 2 实验方法 | 第25-28页 |
| 2.1 样品RNA的制备 | 第25-27页 |
| 2.2 sRNA深度测序 | 第27页 |
| 2.3 sRNA测序原始数据处理与分析 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-30页 |
| 3.1 小黄姜sRNA深度测序结果 | 第28-29页 |
| 3.2 sRNA序列拼接及病毒筛查 | 第29-30页 |
| 4 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 小黄姜病毒的分子鉴定 | 第32-56页 |
| 1 实验材料与仪器 | 第32-33页 |
| 1.1 实验材料 | 第32页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第32-33页 |
| 2 实验方法 | 第33-40页 |
| 2.1 CTAB法提取植物总DNA | 第33-34页 |
| 2.2 超保真DNA聚合酶扩增反应 | 第34页 |
| 2.3 PCR产物纯化 | 第34-35页 |
| 2.4 大肠杆菌感受态细胞制备 | 第35-36页 |
| 2.5 连接反应 | 第36页 |
| 2.6 大肠杆菌感受态细胞转化 | 第36-37页 |
| 2.7 菌液PCR鉴定重组质粒 | 第37页 |
| 2.8 序列测定与比对分析 | 第37-38页 |
| 2.9 PCR扩增病毒部分基因组序列 | 第38-40页 |
| 3 结果与分析 | 第40-52页 |
| 3.1 小黄姜杆状病毒的验证 | 第40-43页 |
| 3.2 小黄姜杆状病毒的部分基因组克隆 | 第43-49页 |
| 3.3 小黄姜杆状病毒来源的sRNA分析 | 第49-50页 |
| 3.4 PCR法鉴定田间小黄姜病毒侵染结果 | 第50-51页 |
| 3.5 20份不同地区黄姜ZBV检测 | 第51-52页 |
| 4 讨论 | 第52-56页 |
| 第四章 结论、创新与展望 | 第56-58页 |
| 1 结论 | 第56-57页 |
| 2 创新 | 第57页 |
| 3 展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 缩略词 | 第64-66页 |
| 附录 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67-69页 |