纤连蛋白在二氧化钛表面吸附的分子动力学模拟
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-18页 |
| ·课题背景 | 第9-10页 |
| ·课题来源及意义 | 第10-11页 |
| ·国内外研究现状 | 第11-17页 |
| ·生物分子吸附的实验和模拟研究 | 第11-14页 |
| ·二氧化钛与水分子相互作用的模拟研究 | 第14-15页 |
| ·NaCl溶液性质和离子吸附的模拟研究 | 第15-17页 |
| ·课题主要研究内容 | 第17-18页 |
| 第2章 蛋白质吸附的相关理论和模拟方法 | 第18-33页 |
| ·蛋白质在固体表面吸附的研究对象 | 第18-21页 |
| ·金红石型TiO_2 的性质和结构特点 | 第18-19页 |
| ·纤连蛋白的性质和结构特点 | 第19页 |
| ·蛋白质吸附的原理和复杂性 | 第19-21页 |
| ·分子模拟技术 | 第21-22页 |
| ·蛋白质吸附分子动力学模拟基本技术 | 第22-32页 |
| ·仿真物理模型 | 第23-24页 |
| ·势函数的选取 | 第24-26页 |
| ·模型边界条件的设定 | 第26-27页 |
| ·初始条件的设定 | 第27-28页 |
| ·系统的控制方法 | 第28-29页 |
| ·运动方程求解 | 第29-30页 |
| ·分子间力的计算 | 第30页 |
| ·模拟特征量的提取 | 第30-32页 |
| ·蛋白质吸附模拟程序设计 | 第32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第3章 纤连蛋白真空环境下吸附的机理研究 | 第33-45页 |
| ·吸附过程模拟模型的建立与模拟方法 | 第33-36页 |
| ·吸附过程分子动力学模拟模型 | 第33-34页 |
| ·TiO_2 基底表面弛豫研究 | 第34-35页 |
| ·纤连蛋白在真空环境下吸附模拟方法 | 第35-36页 |
| ·纤连蛋白在TiO_2 表面吸附机理的理论分析 | 第36-42页 |
| ·纤连蛋白与表面间吸附能求解 | 第36-38页 |
| ·纤连蛋白吸附基团原子表面距离 | 第38-39页 |
| ·纤连蛋白吸附过程均方根位移分析 | 第39-41页 |
| ·纤连蛋白在TiO_2 表面稳定吸附构象 | 第41-42页 |
| ·TiO_2 台阶表面纤连蛋白吸附机理研究 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第4章 纤连蛋白溶液环境下吸附的机理研究 | 第45-57页 |
| ·纤连蛋白纯水溶剂环境吸附模拟 | 第45-49页 |
| ·吸附过程分子动力学模拟模型 | 第45-47页 |
| ·纯水溶剂溶液微观结构分析 | 第47-48页 |
| ·纤连蛋白与表面间吸附能求解 | 第48-49页 |
| ·纤连蛋白在NaCl溶液中吸附模拟 | 第49-54页 |
| ·纤连蛋白在NaCl溶液中模拟方法 | 第49页 |
| ·NaCl溶液微观结构分析 | 第49-52页 |
| ·NaCl溶液体系固液界面特征 | 第52-53页 |
| ·NaCl溶液中离子对纤连蛋白吸附的影响 | 第53-54页 |
| ·纤连蛋白在NaCl溶液中构象变化分析 | 第54-56页 |
| ·纤连蛋白主链结构变化分析 | 第55页 |
| ·纤连蛋白侧链构象变化分析 | 第55-56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第62-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
