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三种直翅目昆虫线粒体基因组的测定与系统发育分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第一部分 前言第10-18页
 1 六足总纲线粒体基因组的主要特征第10-12页
   ·线粒体基因组的结构特征第10-11页
   ·线粒体基因组的进化特征第11-12页
   ·线粒体基因组的遗传特征第12页
 2 六足总纲线粒体基因组各组分的特征第12-15页
   ·蛋白质编码基因(protein-coding genes)第12-13页
   ·tRNA基因(tRNA genes)第13页
   ·rRNA基因(rRNA genes)第13-14页
   ·控制区(control region)第14-15页
 3 直翅目昆虫线粒体基因组的研究概况第15-16页
 4 本课题研究的目的和意义第16-18页
   ·研究物种第16-17页
   ·研究目的及意义第17-18页
第二部分 材料与方法第18-32页
 1 实验材料第18-21页
   ·标本的采集、保存与鉴定第18页
   ·实验仪器和试剂第18-21页
 2 实验方法第21-27页
   ·总DNA提取第21-22页
   ·总DNA检测第22页
   ·PCR引物设计及PCR扩增第22-26页
   ·Sub-PCR扩增产物测序第26-27页
 3 数据处理和分析第27-28页
   ·测序结果的片段拼接第27页
   ·线粒体基因组序列的注释第27-28页
   ·线粒体基因组基因组成情况的分析第28页
   ·RNA的二级结构的预测第28页
 4 直翅目昆虫线粒体rRNA分子系统发育分析第28-32页
   ·序列数据来源第28-29页
   ·rRNA序列比对第29页
   ·序列组成分析第29页
   ·系统发育信号检验第29-30页
   ·构建系统发育树第30-32页
第三部分 线粒体基因组全序列测定第32-59页
 1 总DNA提取结果第32页
 2 PCR扩增第32-33页
   ·长PCR扩增和纯化第32-33页
   ·Sub-PCR扩增和纯化第33页
 3 Sub-PCR产物直接测序或克隆测序第33-34页
 4 序列组装和拼接第34页
 5 友谊华癞蝗线粒体基因组的注释结果第34-42页
   ·线粒体基因组的基本组成特征第34-36页
   ·碱基组成特点第36-37页
   ·蛋白质密码子使用情况第37-38页
   ·转运RNA(tRNA基因)第38-39页
   ·核糖RNA(rRNA)基因第39-42页
   ·A+T丰富区(D-loop)第42页
 6 理塘白纹蝗线粒体基因组的注释结果第42-49页
   ·线粒体基因组基本组成特征第42-44页
   ·碱基组成特点第44页
   ·蛋白质密码子使用情况第44-45页
   ·转运RNA(tRNA基因)第45-46页
   ·核糖RNA(rRNA)基因第46-49页
   ·A+T丰富区(D-loop)第49页
 7 李氏大足蜱线粒体基因组的注释结果第49-56页
   ·线粒体基因组基本组成特征第49-50页
   ·碱基组成特点第50-51页
   ·蛋白质密码子使用情况第51-52页
   ·转运RNA(tRNA基因)第52-53页
   ·核糖RNA(rRNA)基因第53-55页
   ·A+T丰富区(D-loop)第55-56页
 8 三种蝗虫线粒体基因组特征的讨论第56-59页
   ·线粒体基因组的基本组成特征第56页
   ·蛋白质基因第56-57页
   ·tRNA基因第57页
   ·rRNA基因第57-58页
   ·A+T丰富区第58-59页
第四部分 直翅目昆虫线粒体rRNA分子系统发育分析第59-72页
 1 分类单元取样第59页
 2 序列组成分析第59-60页
 3 系统发育信号检验第60-62页
 4 构建系统发育树第62-69页
   ·简约法建树第62-64页
   ·最大似然法建树第64-67页
   ·贝叶斯系统发育推论法第67-69页
 5 系统发育关系的分析与讨论第69-72页
结论第72-74页
参考文献第74-83页
致谢第83-84页
攻读硕士学位期间的研究成果第84页

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