摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-10页 |
第一部分 前言 | 第10-18页 |
1 六足总纲线粒体基因组的主要特征 | 第10-12页 |
·线粒体基因组的结构特征 | 第10-11页 |
·线粒体基因组的进化特征 | 第11-12页 |
·线粒体基因组的遗传特征 | 第12页 |
2 六足总纲线粒体基因组各组分的特征 | 第12-15页 |
·蛋白质编码基因(protein-coding genes) | 第12-13页 |
·tRNA基因(tRNA genes) | 第13页 |
·rRNA基因(rRNA genes) | 第13-14页 |
·控制区(control region) | 第14-15页 |
3 直翅目昆虫线粒体基因组的研究概况 | 第15-16页 |
4 本课题研究的目的和意义 | 第16-18页 |
·研究物种 | 第16-17页 |
·研究目的及意义 | 第17-18页 |
第二部分 材料与方法 | 第18-32页 |
1 实验材料 | 第18-21页 |
·标本的采集、保存与鉴定 | 第18页 |
·实验仪器和试剂 | 第18-21页 |
2 实验方法 | 第21-27页 |
·总DNA提取 | 第21-22页 |
·总DNA检测 | 第22页 |
·PCR引物设计及PCR扩增 | 第22-26页 |
·Sub-PCR扩增产物测序 | 第26-27页 |
3 数据处理和分析 | 第27-28页 |
·测序结果的片段拼接 | 第27页 |
·线粒体基因组序列的注释 | 第27-28页 |
·线粒体基因组基因组成情况的分析 | 第28页 |
·RNA的二级结构的预测 | 第28页 |
4 直翅目昆虫线粒体rRNA分子系统发育分析 | 第28-32页 |
·序列数据来源 | 第28-29页 |
·rRNA序列比对 | 第29页 |
·序列组成分析 | 第29页 |
·系统发育信号检验 | 第29-30页 |
·构建系统发育树 | 第30-32页 |
第三部分 线粒体基因组全序列测定 | 第32-59页 |
1 总DNA提取结果 | 第32页 |
2 PCR扩增 | 第32-33页 |
·长PCR扩增和纯化 | 第32-33页 |
·Sub-PCR扩增和纯化 | 第33页 |
3 Sub-PCR产物直接测序或克隆测序 | 第33-34页 |
4 序列组装和拼接 | 第34页 |
5 友谊华癞蝗线粒体基因组的注释结果 | 第34-42页 |
·线粒体基因组的基本组成特征 | 第34-36页 |
·碱基组成特点 | 第36-37页 |
·蛋白质密码子使用情况 | 第37-38页 |
·转运RNA(tRNA基因) | 第38-39页 |
·核糖RNA(rRNA)基因 | 第39-42页 |
·A+T丰富区(D-loop) | 第42页 |
6 理塘白纹蝗线粒体基因组的注释结果 | 第42-49页 |
·线粒体基因组基本组成特征 | 第42-44页 |
·碱基组成特点 | 第44页 |
·蛋白质密码子使用情况 | 第44-45页 |
·转运RNA(tRNA基因) | 第45-46页 |
·核糖RNA(rRNA)基因 | 第46-49页 |
·A+T丰富区(D-loop) | 第49页 |
7 李氏大足蜱线粒体基因组的注释结果 | 第49-56页 |
·线粒体基因组基本组成特征 | 第49-50页 |
·碱基组成特点 | 第50-51页 |
·蛋白质密码子使用情况 | 第51-52页 |
·转运RNA(tRNA基因) | 第52-53页 |
·核糖RNA(rRNA)基因 | 第53-55页 |
·A+T丰富区(D-loop) | 第55-56页 |
8 三种蝗虫线粒体基因组特征的讨论 | 第56-59页 |
·线粒体基因组的基本组成特征 | 第56页 |
·蛋白质基因 | 第56-57页 |
·tRNA基因 | 第57页 |
·rRNA基因 | 第57-58页 |
·A+T丰富区 | 第58-59页 |
第四部分 直翅目昆虫线粒体rRNA分子系统发育分析 | 第59-72页 |
1 分类单元取样 | 第59页 |
2 序列组成分析 | 第59-60页 |
3 系统发育信号检验 | 第60-62页 |
4 构建系统发育树 | 第62-69页 |
·简约法建树 | 第62-64页 |
·最大似然法建树 | 第64-67页 |
·贝叶斯系统发育推论法 | 第67-69页 |
5 系统发育关系的分析与讨论 | 第69-72页 |
结论 | 第72-74页 |
参考文献 | 第74-83页 |
致谢 | 第83-84页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第84页 |